ClCG11G000010 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTTCGACCTTCGATTGCTGCAGCCCCCTCGCCGGAAAACTCCATTCCGGACCCTCATTCCTTCTCATCAATCCCTTTCATGTCCGTGAATTTCGTGTTTTTCGACGCCGGAGACTCAAGCATTACCGCCATGCCCACCGTCGCACCGCCTTCACCGTCCGAAGCCAGTCGAACCCCTTCGAGAGCCTTTTCCATAACTTGGTTTCGCAAGTTACCACCGTCAATTCCTTGGAGCTAATTGCTCCCGCGCTCGGATTCTCTTCTGGCGTTGCACTTTACCTGTCCAATGTCGTATCTGCCAAAAATTCCGCTGTGTCGGATATTGGCGAATGGATTTTGTTGTCCAGCCCCACGCCGTTTAACAGATTCGTGTTTCTTCGCTGTCCGTCTATAGCTTTCCCCAGAAGCGACACAAACCTTGTGGAGGATGTGAGTGAGAAACTGGTGAAGGAGGACAGACACTTTGTGAGGCTCAACAGCGGGAGAATGAAGGCCACTACCGGCGATGATGATAAGGAAGACAAATTGACTTACCAAAGATTGTGTATAAGCACCGAAGATGGTGGGGTAATTTCATTGGACTGGCCGTCTAATTTGAACTTAAGGGAAGAGCACGGTTTGGACACCACGTTATTGTTAGTGCCCGGAACCCCAGAAGGGAGCATGGATAAGAATGTGCGGTTGTCTGTGATTGAGGCTCTTGGGCGAGGCCTTTTTCCGATAGTCATGAATCCTAGAGGCTGTGCTGGTTCACCTCTTACCACCGCACGGTATGACCACTGCCTTGTAACTTCTTTGCTTCACTTCGTCATAAATATGTCAGACTGCTGGAAGGCAGCGGCTAATACCCTCTGTTTTGATCGGTTTTGTTATTGCAATAGTGCTGTGATTAATATTTCGGTTGCTGCTTGGTTTTGCCACTTTAAACCAGTTTACGTGAATGTTTCTGTAGCATTAGCTAGGTGTTTCTGATTTATGTTACAATTTCTGTATGATGGAAAAGCATGTAGCCGGTGCTAAGGAAGGTTGGGGATTTACATGCGGGATTGTTTGACCTTTATTTGATATTGGCTAGTCGAGCTTTCTTAGCTTATTCTTGATTCTGGTTTAGCTGGTTAAAATCTTTATGTCCTTTCTCTTTTTTGCTACTGTTTCAACCTATTGCTTTATGACACATATTCAGGTCGTTATTGGCTTGTGGCTATATAATCCAACACGAATGAATTGCCTGAGTATGCTGGGCATATTTTTTAAAAACTGTTTCTCCTTCATCTTTTAACAGTTGTCTGTCCCATGCACAGAAAAATAAGTCTGCAGAGTATGGAGGAGTGAGTGTGATCTTCAAAAATTGCGTTGTTTCTTAACACAGTGACTATGTGATTTCATATTGTTGGTTGTAAACATGTTAATTTGCAATAAAATCAATAATGATTTTATTTTATGATTCTTTCCTTTTATGTGTCAAACGTTTCTCCTATATAAGAAGGTTTTGTATTTCACATTAACATTATTGGTATACAAATATCCTATTCCATTCAATTCAAGATGTTATCGGAGCTAAGAAATACAAAACCCTAGCTATTTTCTTTCTAATCAAACCATAGCATCATCGATTGGAACCCTAGTTGTCGTGCACAATACCTTCAGCAAATCTTTAAGTCAGAGGTTCAAGTTGTTGTCAAAGGTTGGAGAAGTGTAATGACCCAAGTTTAGGAGGGGGACATAAATGAACTGAGATCACATCCGAATGAGAGGGATCCTGAGGATATGAAAGTATGATTAAGAAAGACTTAGAATAATGGATAGTTACTACTTTTACCAACATAGTGCGACATCTTTTCTTTCGGTGGCTCAGTCATAAAACTCCAAAGTTAAGCGTGCTTAACTTGGATCAATCTTATGTTGGGTGACCTTTTAGGAATTTTCTTAGGAAGCATGTGAGTGAGGACAAAGCATGTTGAAAGGACTCGTGTTGGTTTGTGGGGATAGTCTTCACTCTTAGAACTTGAAAGGCCTCCAATGGTCCAAGCCTACCACATAAGGGAAAAACTGGGATTACACACATAACAGTGCCAGGGACAATGTAAGGGGGTGGTTGAGCGGGAATAACCTTTTTTGTGTATGGCTGCTTACTTAGCCTTTTTGTATGTCTTTAGACGGGTTGTCTTGAGTGGTGATTTTGGGACAAGAGTCTTCTTGTAAGGAGATTTCCAGCTCTCTCTAATGGTTGGAGAACTTATGTTATCTTATTGAAGCCATTGAAGCTTTCACCGCCTTTCTATAGTTCTCTCTGTGTGTTTTTAGGTGTTGTGTGAACATTATTCTAGGATAAGATATTCGATACTTTACAGAAACATTCAAGACAAGCAAGGATGACGTTACAAGGTCACAAGGGATGTTGGGGCCATTAGATGCCGAATTCGGATTTCAAATCCTTGACCTGGGCATTGCAAATGGTATCAGAGTGGAAACTCTCCTAGTAAGATGTGGTTCGGGGACGAACTCAACAGAAGTTGATGGGCATATAATGCCCCGAGTTTATGAGGGGAACATGAATGAAGTGAGATCACTTCCGAATGAGGTGCGATCCTAAGTATACGAAAGTATGATTAAGAAAGGCTTAAAAGAATTGAAAGTTAGTACACATACCAACTAGGTGTACCTTCCTTTTTGGTGATTCAATCATAATAACTCCAAAGTTTAGCGTTCTTAGCTTGGAGCAATCTTATGTTGGGGGACCTCTTGGAAATTAGCATGTGAGTGAGGACAAAGCATGCTGAAAGGACTCGTGTTGGTTTGTGGGGATAGTCTTTACTCTTAGAAACATTCAAAACAAGCAATAATGACGTTGGCAAGTTGCAAGGGAATGCCGGAGCCATTAGATGTTGGATCTGAATTTCGAATCTTGGGTCTGGGGCATTACAAGAACACTCGAGTAGTTGCTGAAAACACTCAATTTTACCTCTTGTTTGCTCGTGGTACCGTTGCAGGTTTGTGTTTGTTTTCGAAGTCTAGAAAGAAGAGAGAATTTTCCACAAGCTGGAACTAATCAAGATCATTAGGAAGCTGGGGCAAGAGGATTTTTGAGCTTTGATGGACTAGAGGCGTGTTAGTGAGAAACCCTCTCCTATCTAGGACTCACTAGACTGGAAGATTATTTCAATTCAAACAAAGGCTATCTGTCTTACATTAAAAATTATTGGAATACAAATATCTTATTCCATTCAATTCAAGGCATACTTTCTCATGTGAGGTATCTGATAGGCTAACTCCTTTACTGCAATATGTAGGTTGTTTTCAGCTGCTGACAGCGATGATATCTACGCAGCTGTACAGTTCATTAGTAAGGCAAGGCCGTGGACAGCATTGATGGCCACTGGCTGGGGATATGGTGCAAACATGTTGACCAAGTACCTGGCAGAAGTTGGTGAGAGAACACCACTTACCGCTGCAACATGCATTGACAATCCCTTTGACTTGGAGGAGGCCACCCAGACCCCTCCATATCACATGACCATTGATCATGATCTCACTGGTGGGCTGATTAATATTCTGAGATCTAATAAGGTTTGTGATTCCTGCACCTGCTTGTTGCCTTATTAATTATAGCTTAATGTTTATGAAGAAAGAGGTGAAACTTCCAATGCCTTATTGCTTAATGAATTATGCTTACACATAGTGTAGCAATGTGTGCCGATGGCTTTATGGTTTTAGTTTGTTACTGGATACTGGATAGTAACTGCTGTTGGTAGATGACGATTTTTTTTTGGTTTTTTTTAATAAAATTATTATTATTTTTTTCTTTTAATTAGCAATAAAATTGTGGGCTCTTTTCAAATATAGCAAAAGGAACCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATTTCACTGTCTATCTGCGATAGATCGCGATAGTCTGTGTATTTTGCTATTAGTTGTAAATATTTTCAGCAGTTTTGCCATTTAAGATAATCTCCCTAAAATTATTATTATTATTATTTTTTATTTTAAATTTGCAGGAACTCTTTCAAGGGAAAGCAAAAGGCTTTGATGTTGAAAAGGCCCTTGAAGCCAAATCTGTGCGCGATTTTGAAAAATTAATATCTAGTGTTTCTCATGGTTTTAATTCTGTTGAAGATTTCTACTCGAAGTCAAGCACAAGAAGTGTGGTTGGGAATGTGAAAATCCCTGTACTTTATATCCAGGTGCATGTTTTCTACAAAGATTTTCTTTGAGTTTGGCTATTGAACTGCTGAAAAGATATTATTAGATTCTTTCAGTTCCATAATCTATTTGTGTATTTATGTGTACATACCTATAAAATTCTAGTCTGGCCCATTGTAATGTATTAATATCATTTATTTCACGATGTTGAAAATTAAAACAACACAGTTAATTGGATTTTGGAAAGTGGAATCATTTTAAAAATGTAGCTCAATTGAAGTTTATTTAATTGACTCTGTATGTATGCCAAATAACAACAAGATGTAATAGCCAGTTTTCTCCTTTTTTGGAAGCTAGGTTGTATTTACGGTGTTAAATTATTTCAACTCATTATCGAGGCATTCTAAATAGCTGAGCTGTCCAGAAAATTTGATGTTTTAATATTAATTCGAAATGCAGAAAGTTTGTGTGCTCTAAGAATTTCATCATCTTACGTTTGGAGTATCGTTTTCAATGAATTATTTTTGTTTGATAGTTGACATCACTTTCTCATACACAAATAAATCAGTTTTCTAACTTGTTGAACTGTCTGAAATTATCAGAATGACAATGGATCAGCTCCAGTATTCTCAATTCCACGTGGTTTAATAGTAGAAAATCCATTTACAAGTCTTCTGATGTGTTCTTATTCGCCATCTAGTATTATATCTAGCATGAAACCTGTTCTATCTTGGTGCCAGCAGTTATCTATTGAGGTAATGAATTATTTTCTTTCCCATGTGATCTTGTCACAAGTTAAGTTATTTCATCATCTGCTGATTTATAGCAAATC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MTSTFDCCSPLAGKLHSGPSFLLINPFHVREFRVFRRRRLKHYRHAHRRTAFTVRSQSNPFESLFHNLVSQVTTVNSLELIAPALGFSSGVALYLSNVVSAKNSAVSDIGEWILLSSPTPFNRFVFLRCPSIAFPRSDTNLVEDVSEKLVKEDRHFVRLNSGRMKATTGDDDKEDKLTYQRLCISTEDGGVISLDWPSNLNLREEHGLDTTLLLVPGTPEGSMDKNVRLSVIEALGRGLFPIVMNPRGCAGSPLTTARYDHCLVTSLLHFVINMSDCWKAAANTLCFDRFCYCNSAVINISVAAWFCHFKPVYVNVSVALARLFSAADSDDIYAAVQFISKARPWTALMATGWGYGANMLTKYLAEVGERTPLTAATCIDNPFDLEEATQTPPYHMTIDHDLTGGLINILRSNKNDNGSAPVFSIPRGLIVENPFTSLLMCSYSPSSIISSMKPVLSWCQQLSIEWLTAVELGLLKGRHPLLKDVDITINSSRGLALVEGKTVEERGKTIRQLGYNWSDASSGYQSTRFIKKKLEESHSSIHTDLRSQNNSQSKSQLEDKGSLEIEVGVLNQTSSISEDMGKKDEVGSEDTEKGQVLRTAEVVMNILDMTNPGTLTDEEKKKVLNAVGKGETLMKALQDAVPEEVRGKLTTALSGILHAQGSNLKVNDLIGSSQKSNATLELKGKTEEKVRHVAEAEGSSQISSPSHEMGAGNDVSDGSDSYQPTKDKFIGELESESPSSDKLQKSIDQNGSQALAIHGDDTISSTRKETSGFGKTESDDEFSGENTSQNLVTGEKELDIGLKPELLSEAELVGSHKVATGDNYKDQGGGIAQSDEEEENKPKKDEEKAVDSSNDVKAVSSFTIEEALSSPGSTSEAEAIRADHEYNNDQRDNNTMQPVVEHSKPVVSESNVDNFSVSQALDALAGIDDSTQVAVNSVFNVIENMISQLEGSENEGEDKKSDSLVDNHCSGNDNEISSGKKECANTDLSVNPKRLSGPCIINTLERRRGTEHNVRSGREEEEFTSDLVSINRSYLIRSQSAQAGRDGNEKAKLLDDLNGNVDMTSNVSLDSVHNNFFLKYIATNMPTKSLDKDTTTALLLDYIPEEGQWKFIEQPGNENGAISASEGVDAQMNAYAHAKVKNSDDVIEPLYMILDSDDQLEPVGEYQTMVDGKEEIERNDGQKDLEYFVRTIIQDSLQVEVGRRLSAVDKDLKLGVDRDIEHVANLLSVAVGNGSGCSQCLGSKSDSIDSFGEKMGTLCGEQIIRSISSSVQETVYLKKILPLGVIIGSSLAALRKHFHVTTLHDDNQGQCLFVDQAKKSGERNHGEANNGREPTQNIMLTDTVCEEGGCAEMRNLNNDTVVVGAVTAALGASALLVHQQSLCETDETTESSLKSEEKAGLRKEPERHDEQIVPEKNQNIVTALAEKAMSVASPVVPKKEDGEVDEERLVSMLAELGEKGGILKLVGRIALLWGGIRTAMSVTEKLISILRIAERPLFQRILGSVGMVLVLWSPITLPLLPKLVDSWTSRTPSKIANLACGFGLYIALTILVMMWGKRIRGYENPAKEYGLDLTSWSKFYDFIMAFLGGVGVLLGIQFVNRFLGYTTLSMPAIPTLENLVSWLKVFGGSLLLVSIGIISSIIVTAVEELLFRSWLTEEIALDLGYFPGIIISGLAFAILQRSLQAIPVLWVLSLGLAGARQRREGCLSIPIGLRAGITASSFIFQKGGFISYKPIPMHHPVWIMGIDTQQPLSGVAGFAFALLVACIFLPRNPMEKKNLRRTIRE
BLAST of ClCG11G000010 vs. Swiss-Prot
Match: EMB8_PICGL (Embryogenesis-associated protein EMB8 OS=Picea glauca GN=EMB8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 6.4e-07 Identity = 41/124 (33.06%), Postives = 54/124 (43.55%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. Swiss-Prot
Match: GAR2_SCHPO (Protein gar2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=gar2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 9.3e-06 Identity = 41/160 (25.62%), Postives = 74/160 (46.25%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KUL8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G534990 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1718.7 bits (4450), Expect = 0.0e+00 Identity = 928/1242 (74.72%), Postives = 1017/1242 (81.88%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KUL8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_5G534990 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 475.7 bits (1223), Expect = 2.5e-130 Identity = 236/258 (91.47%), Postives = 244/258 (94.57%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 1146.7 bits (2965), Expect = 0.0e+00 Identity = 684/1490 (45.91%), Postives = 920/1490 (61.74%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. TrEMBL
Match: A0A0R0GLS9_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_13G113900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 244.6 bits (623), Expect = 9.2e-61 Identity = 135/238 (56.72%), Postives = 170/238 (71.43%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 1131.7 bits (2926), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/1394 (47.35%), Postives = 899/1394 (64.49%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. TrEMBL
Match: W9SK90_9ROSA (Embryogenesis-associated protein OS=Morus notabilis GN=L484_019551 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 9.8e-71 Identity = 150/240 (62.50%), Postives = 176/240 (73.33%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 159.1 bits (401), Expect = 5.1e-35 Identity = 78/110 (70.91%), Postives = 88/110 (80.00%), Query Frame = 1
HSP 3 Score: 1127.5 bits (2915), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/1582 (43.87%), Postives = 955/1582 (60.37%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. TrEMBL
Match: A0A061GM37_THECC (Alpha/beta-Hydrolases superfamily protein, putative OS=Theobroma cacao GN=TCM_037465 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 9.5e-66 Identity = 145/238 (60.92%), Postives = 173/238 (72.69%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 1122.1 bits (2901), Expect = 0.0e+00 Identity = 699/1589 (43.99%), Postives = 967/1589 (60.86%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. TAIR10
Match: AT2G03140.2 (AT2G03140.2 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 623.2 bits (1606), Expect = 4.8e-178 Identity = 458/1359 (33.70%), Postives = 695/1359 (51.14%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 245.0 bits (624), Expect = 3.6e-64 Identity = 174/542 (32.10%), Postives = 275/542 (50.74%), Query Frame = 1
HSP 3 Score: 201.8 bits (512), Expect = 3.5e-51 Identity = 102/187 (54.55%), Postives = 137/187 (73.26%), Query Frame = 1
HSP 4 Score: 139.8 bits (351), Expect = 1.6e-32 Identity = 75/131 (57.25%), Postives = 86/131 (65.65%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. TAIR10
Match: AT3G28770.1 (AT3G28770.1 Protein of unknown function (DUF1216)) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 2.5e-09 Identity = 90/418 (21.53%), Postives = 167/418 (39.95%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. NCBI nr
Match: gi|659121251|ref|XP_008460565.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499360 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2247.2 bits (5822), Expect = 0.0e+00 Identity = 1167/1364 (85.56%), Postives = 1243/1364 (91.13%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. NCBI nr
Match: gi|659121251|ref|XP_008460565.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499360 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 7.9e-130 Identity = 236/258 (91.47%), Postives = 244/258 (94.57%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 188.3 bits (477), Expect = 1.1e-43 Identity = 93/110 (84.55%), Postives = 95/110 (86.36%), Query Frame = 1
HSP 3 Score: 2236.1 bits (5793), Expect = 0.0e+00 Identity = 1167/1382 (84.44%), Postives = 1243/1382 (89.94%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. NCBI nr
Match: gi|659121249|ref|XP_008460564.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499360 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 7.9e-130 Identity = 236/258 (91.47%), Postives = 244/258 (94.57%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 188.3 bits (477), Expect = 1.1e-43 Identity = 93/110 (84.55%), Postives = 95/110 (86.36%), Query Frame = 1
HSP 3 Score: 2236.1 bits (5793), Expect = 0.0e+00 Identity = 1167/1382 (84.44%), Postives = 1243/1382 (89.94%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. NCBI nr
Match: gi|659121255|ref|XP_008460568.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499360 isoform X4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 136.3 bits (342), Expect = 5.1e-28 Identity = 67/82 (81.71%), Postives = 68/82 (82.93%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 2233.8 bits (5787), Expect = 0.0e+00 Identity = 1190/1527 (77.93%), Postives = 1282/1527 (83.96%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG11G000010 vs. NCBI nr
Match: gi|778703825|ref|XP_011655435.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101219570 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 475.7 bits (1223), Expect = 3.5e-130 Identity = 236/258 (91.47%), Postives = 244/258 (94.57%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 2222.6 bits (5758), Expect = 0.0e+00 Identity = 1190/1545 (77.02%), Postives = 1282/1545 (82.98%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |