ClCG05G012300 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGATGTACCTTCTGTGGAGTATTGTTGTGAGTGGCTTATGAGTATTCGGAGGAACTTGGGATTGTATTGAACGAACAATTTATCTCTAATTTAGGCTTCCCAGTATATGACATCTCTTATCGTCAGTTAAGTATATTACATGTTAATGCAACGTGCAAAATGAGATTTCCAGTGGTGGGCTTTGGAGCGGTAATTGGGTCCTCTTCAAGATCTATGATGGCTTCTATGCATGGTTTTCAAAAGTTATCTTTGACCCCAACAGGTGCTGAAGCGTTGGCTATTTATGAGGGTCTAAGATTGATGGTTAGATTGGAGTTATCTCATATGTTGGTGTTGTTTGATTCTTTAGTGGTTATTCAAATGCTCAGAGGCGTGAGGAGAGTCCAAGTGGATTTAGCCAATTATGTGGTTGATATTAAAAGATTGCAGCTTCTTTCCGGTCTGTGGTGTTCCAATATGTGCCTCGTTTGTCAAATTCAGTGGCTGATGAGTTGGCAAGGACGAGATGTATTGGGTCAAGTGCTTTGTGCCGTGATTGCTTCTCCTCGAGGATTGTCTCTATATACTCACGTGATTTTTCTTTTCTAACCAGTCATAGAACTTTATAGTTTTGTTGTTACGTTTGTATAAAAAAAATTATGTATATACATAATTTGATAAGTAATTATTTCTTCTATTATGAATTATTTTATTCAGACTTTTCAATAGTTTTGTTTAGAAGAATGGAATAGTGACTATTTAAATCGATTGAGTTTTCAAATAAAATAACAAATTGGAAAAAGTTTCCTGAACAAACCGATTTCCACAATTTTTTTTTTTGCAAAATTAATGGGGTGTTTGGGAGATCGTAATGAGATGGGATTGTAATGTAATGTAATCCAAAATAAATGTTTGGATTGAGCATTTTGGGCTTGATTTGTAATACAAAACTCATTCTATTCCGATAGTTTTCAACCCAACCATATTTTCAACCGTTTTCACGATCTCATTTTTGTTTTTTCCTCGAGTTCTCACACATTCCAATGTTCCTCTGATTTTCAGTAATTCTATTATATTCCAGCTACCTAAATAACCTCTAAACAGAAAATATAGACAAAGATACATAAGACATCTCTGATATCACAATGTCACATAAACATTCTTATTTTAAATACAAAAATTATGGAAAGAAAGATTTGATGTTAAAGGCTACATAAATAAATTAATTTTGACTCATTAAAATGGATTGTTAGGTCATCACCGTTGTCTTTCATTTCTCATGTCCTTGTTTAAAGGGCTATGTTCGTAAATTTCAATTTTCTTGCTTATAAATTATAGGTGGATGGTCAAAATGACCACAATTATTCAATTAATGGAAAAATATGATTGTGGTTTCTTGTTGACAACTTTTCCATTATTAATCAAATAACCATACAAAAAAACGTGAAAAGAGAGTTGAATAACACTAAAAAAATTGACATTCTTAAATAATTAAAAAGCAAGTCTAGTAGATTATTGGTCAACAACAACATAACTTAATTATCATTCAGAGTATAATCTTTATCAAAAATAAATAAAATTAGAAATTAAAAATTTTCACTTACGTATTATTGAACTAAAAAAAGAAAAAAAAATTAAATTAAATTTTCATATAGACCATAAAGGAGTATCAGGAAATAACATACATAATAAAGTTTTAAAAAACTTCCACTATACATTATAATGTTGAATTATAATAGATTTTCTCTAATCACCGCTAAAGAATGGTCAAAATAGAATACAAAATATAGTCCTAAATTAGTTACCACTTTACCTAAAACTAATATAAAATATGCAAATGTAAAATAATCCTAGAGAGAATATAATATAAACAACAACATTAGTAATTCATAGTAAACAAATAGCTAACACCCATTTCATAATTATTTAGACTCCGTTTGGTAACTATTTTAGCTTTTGTTTTTAATTTTGAAAATTAACCCTATTTCCTTCTCATTTCTTATATTGATTTTGCATCTCTCTTGGTACAATAGGTTAATTATTTGCCAAATTCCAAAAACAAGAGCAAGTTTTTAAAAGCTATTTTTTTTTTTTTAGTTTTCAAATTTTGGTTTGGTTTTTTAAACCCTCGGTAAAAAATAGATAACAAAGAAATAAAGTTGAAGGTAGAAATAGTGTCTATAGGCTTAATTTTAAAAAACAAAAACAAAAAACTAAATGGTTACAAAATGGTGCCTAGTTTTTTGTTTTTAGTTTTTGAAAATTGAGCCTAGAAACACTTTACCGCTTCTAAATTTTTTGTTTTGTTATTTATTTTTTACTAGTGTTTTAAAAAACCAAGCCAAATTTTGAAAATTATGAAAGTAGTTTTTAAAAACTTGTTTTCTATTTTAGAATTTGGCTTGGACTTAAGAAAAATGCAAACTATTTAAGAAATTGAGAGGAATTATACTTTTTTTTTTTTTTTTATAAAATACTGGTTACTAAATAGGGCCTAAAATATCATTTTAATCGTATTTTGAAGTTTATTTAATTTTAATTCATGTTACTTTTAAATTTTAAATTTTAGTCTTTATACTTTTAATAAACTTTAAATCTAATCCACCAAAGTTAACTTTTTATTGAAATTGGCTAAATAAATAATAATAATTTTTTACTTGAAAACAAAAAGTATATGTTTTCAAAATTTATGGTGAAAATACTAATACATAACAAAAGGTATTTAAGAAATCAACAATAAACTAGAATTAGATAAAAAATACAATTACTACGACCCTAAGTTTTATTTTTATTTTTTAAAAATTAAACCTATAAACATTTCTTCCACCTTTAAATTTCTTGTTTTATTATCTATTTTTACCAATGTTTTCAAAAATCATGCTAAAATTTGAAGCTAAAAAGAGTCATTTTTAAAATGTATTTTTTTGTTTTTAAAATTTGAATAAAAATTCAATTTTTGGATTTAGAAAAGATTCAAACCATTTTTAAAAAAATCAAAAGAAAATAGGTTTAATTTTCAAAAACCAAAAATTAAAACGAAACCTACCATACCAAAAGTTAATGATGATTAATTCGGTGAAGTAGGCATCCCAAGTTATTTTTCCCTTAATTTCAATTATACTTGGTATGCTTTCTATAATTCACTTGCATAGTTTTGTTTAATCAATCAAACAGATTATTGTTTAATTAATTTAGTAAAAATTATCAACAAATTTTCTCGAAACGAAGATTTTCTATCACATGAATTGTAAGTCCTCATTCCTATTTTTCTTTGCCTAAATTTAAGTTAAAAATAAATGAGCCAAGGTGGACTTGAGATGACTTGAATAAAAGAGATTTTTACATAAATAATCATCTTGGGCCATATATTTCATAATTGTCTTTAAATTTGAATTTTTCTAAATAAGACTTTAGAGTTAATTTTGGACAATTTTACCATTTTTCCATTTATTTATATGCGTTTTTTATATATATTTACCTAATTACAAAACTCCTTTAATGATGAAGAGAGAAAAAAAACATTTATCATGGAGCGAGAATATACATTTAATATGATTTTTTTTCCATTTTCAATTGGAGATAGAAAATGCATTTAATATAATTTTTTCCAATTTTCAATTGGAGAGAGAAAATCAATTTAATATGATATATTTTCCCATTTTCACATCAATTTGTTGGTTTCAAGCGTCTTCTTCGTTTTTCATGTTATTTTTACATGTACCTTTGAACATTGTATTAGATATTTTATGTTTTAACCAATATATGAAATATATTGGTAAATATATTTGATATGTACTAAAATACAACTAGTTCCACGATAACTTGTTGGTTTTTCTAGCGAATTTATAGTTATTTTTAAATATACTTTAGAATATTGTATTAGATGCTTGTAAATATTTTAACCAATATATGAAATACAAATTTACTCAAATAGATGGTTATACCATTCAAAAGTTTTGATATAATATTATTCATATGACAGTACAATATATAAAATTCGAGTATATATTATTTAATCAAATTTCTTTATTAGTTATACTGCAGTATATAAATAACTGATTGACTCAATGTTCAATATAAATCATAGTATATATCATAAATTCTGTTTATATAGCAAAGTATATATCATAAATTCAAAAGAGTCGAAAATAAACAAAAATATATATCACAGTATATTAATCACAAATGGACTCAATGTTCAACATAAAACATATATACAAGTGTGTATATATATATCACAATATATATATAAAAAACTGTCCTCATTTATATAAAATTAACAAATATATATATCATAGTATATATATGTACTTTTATTCATCTCTTTCTTCTTTGTGAAGCACTTGTTGTCGTCACCCATCTCCACCTCTTCTTTGTGAAGCCCTAGATCTACTGCTACGTCTTCACCTTAGTCACCTTGCTCGTCGTTGCCAACTCATCGTCCTACTTATCGTGTCAACAGTTGGGTCCGTGCACTATAATCGATTGTCATTGTCCAAAACTCCGCACTACTCAAATTCACCGTGCCCCAATGCTATTGTCCAGAAACCCGCATCGTCAACCTTCGTCATCCTTCCTTGA 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BLAST of ClCG05G012300 vs. TAIR10
Match: AT1G10000.1 (AT1G10000.1 Ribonuclease H-like superfamily protein) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 6.5e-06 Identity = 39/132 (29.55%), Postives = 62/132 (46.97%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |