ClCG03G010040 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATCAAATAATCTGTGTAAAATTTAGAAAGGGAACAACTGAGAAGAAGCCTTGTGTTGAGCCTACAGTGTTGTGGTCATTGTTCCTAAAAGAAGAAAGTCTAAAGGTTACATGTCGTGGTGCTCTATTTTGGCAAATGGAGTTGGAGCCAAAAGAGATGATCAAAATGGAAAAGAAGAACAGTGCTTCCTTCTGGGATTTTATTTATTTTCAGCTTTCTACTGGTGCCTCAAATCTAAGGGGTTTAATTTGTGTTTTTATTATTATTTCTTTGTGGTGATTTCTCCATCATGTCTACAATACGAGAGTGCTTCTGAATTTCTTATGGCTTACTTTTGTAATTTCATTATTAATGATTTCTTATTTAAACAAACATGAGATTGTAAGTCTCTCAATATAGGAATTTCAGATAAGAGAGGTGTCAACAAATAACAGACTGACTGTGCCTTGTTTTGCGTTATCAATCAGATTTCCTTCCATGTTTGAAGACCACAAGTTCAGTTGCAGTGTTTGTTAAACAATTTTAATGTCTCCTCATGGTTTAGCATCTTATTGCAGGGGGTCCTAATTGTTGGTGAGAGGGGAACAGGAAAGACATCTCTTGCACTGGCCATAGCTGCAGAAGCAAAAGTACCAGTTGTTACAGTTGAAGCCCAAGAATTAGAGCCTGGACTATGGGTTGGACAAAGTGCATCCAATGTCCGGGAATTATTCCAAACTGCAAGAGATTTGGTTGTTCTCTTGAATCTTTATTGTTGAAATATGCGTACCTAGACTTTCACATATTGGTAGATATATTATTGCTTTTATTTGTTTGATTATTAACAATTTCATTAACAATTTCATTAGTAAATGAATGTACAATAGGTAAGAATAAAACTCCAAGCCTAGAGTGTTGTAGAAGCTCTTCAATTAGCAATAGTAGAAGAAATAAAGCTATTGTAAAATAGCTTTAGCAGAATAACATCAGAAGGAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCCCAGCTTTCTCATCATATTATTCTCAAGGTTATAAAATATTCTTCTATATCCTAGCAATCAAAATCTGCAGAAGGATTGTGCGAGCAACCACTACCCGAAAGGCCCTAGCCTTGCCCTAGAACTTTCTATTAAGATATCAGGCAGGTATATGAGAAGAATGAACAATTACCAAGGAGATTAAAAATGCTCTCTTATTGGTCAGCAAAACTGGAAAAATAGCAATTTAAAAGTTCTCTTGGAGTGCATTTTGCTCATAGTGGGACAAGGTTTCCCTGCTATTCCTTAATTTGGTTCTTTCGGGAATGTCGGGCAGCCTCTTCCCTATCTTTTAGTGCAGCTATTCTCTAGAGAGGAAAGCTAAAGTCCTTTGGGTTAATGCAACTAGAGCCATTGATGTGGTACGTTTGGCTTGAGAAGGATAGAAAAATCTTCAATGAATAGGAGAAGGATTTGACCTTGGGGCTCTTTATGTCAATAGGGCCTTTGTTTTTGTGCTTTGTAAATTCCTAACATCGTTTTTCTTCCTTTAAACAATCTACCCTATTCTCAGTCAAGTTTCAATATGCAACTTATGCATGAAATGATTGGAGTTAAAAGAAGAGGTAGAAAAAGAAGGGGAAGACAAGGAGGCACTGGCCACTTGGGATCCCACCATCACTGTATTGTCAAAGGTTGATATTGTCGCAACTTCATCGGCAATGCTTGTGATTGCTGTCGATTCGTCAAGCGTTGCAGAGATTGAAGGTTTGGGGAACCCCTCCGTCATCACCTCATTAGATTCGACCGTTCATGCCTCACTGGAGAAGAAAAAATTGTATGTAACGATGAAGAAGAAAAGGAGTGTTGGGCAGCAGCTATTCACGATGAAGAAGAACGGAAGTTAGGGACAAGGGCAGTTTTGGTATTTTCTTCCTACCTAATGGACACTTTTACCACATCGGGCCTAATGGGCCACACACGGCAAAATTTCAAGTTTTATTTTAAAGATGATGGCTCAAGAATTAATTTTCATTTCAAGTTGAAGAAATTTTCATGGAGTATTTAACTTAATTCCAATTTGGCTTTGGGAAATTTTACACCAAGAATTTTCGGTTGGAGTCTATCACACTCAACGAGCTGAGAGAAGGAAGCTTCACTTTATCACCTCAAACTTGAGGATGAGAATATTCACTTTGTCACTTGGATTAATTTTATATTTTTACCTTCATGTTCGTTTTGAAACTCGAGGACAAGTTTTTTTTGGAGGGGTAGAATGATGTAGTAGGATTAGGTAAATTAGGTTTTATGGTCAAATCCTTAATTGATTAGGATTGGGATTAGTTTCCATGATTGATTAGAATTAGGATTAGTTTCCTTGGTTTATTAGGATTAGGATTACTTTCTTTGATTAATTAAGACTATGATTAGTTTGCTTTCCAATTCTCTATAAATAGAGAGATTGTCTTCTTGTTTTGATAACTTTTGATTCATTTGAATAAAATTCTCTCTTGATATTCATTAGATCACTTCAAAACCAAAGTGTTGATCAATCTGTTTGTAAAGCTTTGATTAAAGTTGTCAATGGGACTTAACCAATTTTATTGACTCTCCTAGAAAATGGACGACTTTTGAGGATTTTCAGTTGCTTTATGAAAAATGGAATAGCGAGATTCGGTCTTCTAAGATTTATAAAGGGATATGGGGGTTGAATTTTAATTAAAAATCTACCCTTAGACTACTAGTGTCGTGAGACCTTTTAGTCTTTGGGACATATTTTGGAGGTCTTGTTAGCATAGCATCTGACACTCTCAATATGATCATTTGTTCGGTGGCTCGAATTCAAGTCCAAAGCAATCTTTATAGTTTTATGCTTGCCATAATTGAAATTAATAATTAAATTAGAGGAAATATTTTCCTTCATTTGGGTGACATTGAAGTCTTAGATCCTCCAAATATAGTTTCTGATGCTTTATTTGTGAGTGACTTTCACATTCCAGTTGATATTTTTCATTTAAAACATGTTATGGAAGATGAAGGTATCAATCCTATAGTTCAGAACCTTGAAGCAGACTTTTATGAATTAATTTAGATTTTCCCCTCAAGCTCAAGGGATCCCTTCGAATCTTCTAGGATTGTGGAAAAATCTAAAGAGGTTAACCTATTAGCAAAAAGTTCTAGGTTGTCACGAGCGAAAGAGCTTGGGATGGAAGGAAATGTGGCACCAGACTTGTCTTTGCACACAAATGGTGGATTTGAGGAAGGAAACATGGTTGTTTCAAATCATTCTTTTGAGAATGTGGCACCAGTCTCTTCTTTGAACTGGAGCCCTACCCTTTCTTTTATACCAGAAAGCTTGGTTGTCCTGGTATTCCTGGAAAGTTAGAGATCAATACAGGTACTTTGGAGGAAGCCTGTACTCGGGTCATCACTTCATCATCAAAGCTAATTCAACCTCCTCCTCCTCCTCCAGATCAGTTCACTTATACAGAGTTCATTCTGCTAGGATCAAATGTTGTGTTTACTAAAGGAGTTTCAATCTCTTTCATCACCAAGCATCTACCTCCACTCAATCTATTCATTTAGGGGATTCCGATTTTGTATTAGAGGTTAGTATGAGCAGTGAGGAGATCTTATTGTTGAATATTCTCTCACGGAAGCTTTTGATAATCTTTTCTCAATTGATGATAGTAAGGTTTCAGATAAGGCTTTACTTTCAGTAGCTCCAGAGGATGAGGTTTAAGTCCCTTCTCAATCCCTTCCAAATTTCATTCCTTAATTTAGAAGTGTGGCTTTCAGATGGTAGAAATCAAATCTCAGTCACTGCAAATTAAGATTTAATTCAGGTTTTGGGTGGTGGTTGCAGTTTTGGCTTTGTTTCCCCTTTCTTCACTCCAAGTGGATTTTTGATTGCTCGTTTAAGACGTAAAACTAAGGCCTGTTTTCTTCTTCTTTGGGTTTGTGTTTTTGTCAATCATGCTTAGCGGGCTCTTCGTTATTATCAAAGTTCAACCCTTGCAAGGTATTGCAGTAGAAGCTTTTCTTCTTTTTGTTTTGGTCTTCTCTGAGTTTAAGTCTTCTTGACTATGAGTTTCTCTTGTGTTATGTGTTTAGTTGGCTTGTTCTACGTTTTCTCCAGAATTTTAGTCTTTGATGTAATTTGGTTATAGCCTATTGGCATATTTGAAGTTTTAACTTTGTTTCCTCTTATGTACTTTGAGCATTTGACTCTTTTATTGTATCAATGAATAGTTTTGTTTCCTTTACCAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGCAGCTTATGCATCCAATCTTACTTGGTTTGATTCTTTCTCGTTATATTATTGTGAATCCTTTTTAACCTGCAATATTTTCCTCGGATTTTATGCTAGAAGAGATTAGATTGTTAGTTTTTGCAATCTTCCTTGTCTAACTTTAGTTCTAGAGGTATCTCTAGGCACCTGTGATCATATTTGTGGAGGATTTTGACCTGTTTGCTGGAGTTCGTGGCAAGTTTATTCATACCAAAGAACAGGATCACGAGGCTTTCATTAACCAACTTCTCGTGGAGCTTGATGGGTAAGCGTAAATTTCTTTTAGTTATTTTGACCATCCAGTGTTCTAGTTCTCTTCCTCTGGATGTCTTGAAACATAATAAAACCTATCCATGAGATAACTGGCACTTATGTATTACAACAAAATGGAAGTATAATATATAGGGGAAATGAAATGAAGCAAAGTCATTCTAGAAAATTCTATTTGTAGAGAGGAAAGAAATTGGTTCAGCTTGTGGGTTTTTTTTTTTAATTCTTTTATTATTATTTTTTTAATTTTTATCTACAGGAACACTTTAACCCTATACAGTCACAACCTCAAAAATGAGACGCACAATCCTGTGGTTTTTAATGCAGGAGGCATGTGGGGTGGGAAGTTTGGACGCATAGGAACCTTAGGATATCCAAATGTAAATCTAAAGGTGGGAAGGGGTGTGAGATTTTAGCGAAAAGGTTGGC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ATGGATCAAATAATCTGTGTAAAATTTAGAAAGGGAACAACTGAGAAGAAGCCTTGTGTTGAGCCTACAGTGTTGTGGTCATTGTTCCTAAAAGAAGAAAGTCTAAAGGTTACATGTCGTGGTGCTCTATTTTGGCAAATGGAGTTGGAGCCAAAAGAGATGATCAAAATGGAAAAGAAGAACAGTGCTTCCTTCTGGGATTTTATTTATTTTCAGCTTTCTACTGGTGCCTCAAATCTAAGGGGTTTAATTTGTGGGGTCCTAATTGTTGGTGAGAGGGGAACAGGAAAGACATCTCTTGCACTGGCCATAGCTGCAGAAGCAAAAGTACCAGTTGTTACAGTTGAAGCCCAAGAATTAGAGCCTGGACTATGGGTTGGACAAAGTGCATCCAATGTCCGGGAATTATTCCAAACTGCAAGAGATTTGGCACCTGTGATCATATTTGTGGAGGATTTTGACCTGTTTGCTGGAGTTCGTGGCAAGTTTATTCATACCAAAGAACAGGATCACGAGGCTTTCATTAACCAACTTCTCGTGGAGCTTGATGGGTTTGAGAAACAAGATGGAGTAGTTTTGATGGCTACCACTCGGAATTTGAAGCAAATTGATGAGGCTCTACAGCGGCCTGGGCGGATGGATCGAGTATTTCATCTTCAAAGGCCAACTCAATCCGAAAGAGAGAAAATACTACAAATTGCTGCGGAAGGATCCATGGATGAAGAGCTCATTAATTATGTAGATTGGAAAAAGGTTGCCGAGAAAACATCCCTTTTACGACCGGTGGAACTAAAACTTGTCCCACTTGCCTTGGAAGGAAGTGCTTTTCGGAGCAAATTCCTTGACACTGATGAACTGATGGGCTACTCTAGCTTGTTTGCTACTTTCAGTGGTATTGTTCCCAAGTGGGTGCAGAAAACCAGAACAGTCAAAAAACTAAACAAAATGTTGGTGAATCATCTGGGATTAACACTGTCTAAAGAAGATCTTCAAAATGTGGTTGATCTGATGGAACCATACGGTCAAATAAGCAATGGAATTGAACTCCTTAATCCTCCTCTTGATTGGACAAGGGAGACGAAGTTTCCACATGCTGTTTGGGCAGCTGGTCGTGGTCTTATTGCCCTTCTATTACCCAATTTTGATGTTGTGGATAATCTGTGGCTTGAGCCATTATCTTGGCAGGGTATTGGATGTACAAAGATCAGTAAGCGGAGAAATGAAGGATCCATTAATGGGAATTCAGAATCAAGATCGTACCTAGAAAAGAAGCTGGTCTTTTGCTTTGGTTCATATATTGCAGCTCAAATGCTACTTCCTTTTGGAGAAGAAAATTTCCTATCTTCGTCTGAGTTAAAGCAGGCGCAAGAGATTGCAACGAAAATGGTGATTCAATATGGCTGGGGGCCAGATGATAGTCCAGCAATTTACAGCCGAAACAATACGGTTACTTCTTTGAGTATGGGCGATAAATATGAATATGAAGTGGCAGCTAAAGTTGAGAAGATATATGATTTAGCGTATTGTAGAGCGAAGGAGATGTTGGCAAAAAATCGTCAAGTTCTTGAAAAGTTTGTTGAAGAATTACTAGAGTGTGAAATTCTTACTGGGAAGGTTTTGGAGAGATTAATTGAAACCAATGGAGGAATTAGGGAGAAAGAGCCTTTTTATCTTTCTGAATACTATGGTAGAGAGCCATTGACTGGTGGATTTCTTGAAAGCGCGAACTCATCGGGAACTGCTCTTTTAAAGATACAATCTAGTTTAGATGTGTTGAGGATGGAGATACGATGTGATAAAAATGGCGTAGATATTATCACTCATTTCTACGAGGAGAAACATTCTATTTTCTCTTTTGCTCCATTCAATTTCCCTTTACTCCTTTTATTGATTATTTATAGGAACTTTTGTACCATTATGCTTCCCAAATATTTAAGATTTTAG MDQIICVKFRKGTTEKKPCVEPTVLWSLFLKEESLKVTCRGALFWQMELEPKEMIKMEKKNSASFWDFIYFQLSTGASNLRGLICGVLIVGERGTGKTSLALAIAAEAKVPVVTVEAQELEPGLWVGQSASNVRELFQTARDLAPVIIFVEDFDLFAGVRGKFIHTKEQDHEAFINQLLVELDGFEKQDGVVLMATTRNLKQIDEALQRPGRMDRVFHLQRPTQSEREKILQIAAEGSMDEELINYVDWKKVAEKTSLLRPVELKLVPLALEGSAFRSKFLDTDELMGYSSLFATFSGIVPKWVQKTRTVKKLNKMLVNHLGLTLSKEDLQNVVDLMEPYGQISNGIELLNPPLDWTRETKFPHAVWAAGRGLIALLLPNFDVVDNLWLEPLSWQGIGCTKISKRRNEGSINGNSESRSYLEKKLVFCFGSYIAAQMLLPFGEENFLSSSELKQAQEIATKMVIQYGWGPDDSPAIYSRNNTVTSLSMGDKYEYEVAAKVEKIYDLAYCRAKEMLAKNRQVLEKFVEELLECEILTGKVLERLIETNGGIREKEPFYLSEYYGREPLTGGFLESANSSGTALLKIQSSLDVLRMEIRCDKNGVDIITHFYEEKHSIFSFAPFNFPLLLLLIIYRNFCTIMLPKYLRF
BLAST of ClCG03G010040 vs. Swiss-Prot
Match: FTSI5_ARATH (Probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 5, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=FTSHI5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 770.0 bits (1987), Expect = 2.1e-221 Identity = 385/498 (77.31%), Postives = 435/498 (87.35%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. Swiss-Prot
Match: FTSH_HAEIN (ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH OS=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) GN=ftsH PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 5.3e-36 Identity = 134/477 (28.09%), Postives = 217/477 (45.49%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. Swiss-Prot
Match: FTSH3_SYMTH (ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH 3 OS=Symbiobacterium thermophilum (strain T / IAM 14863) GN=ftsH3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 146.0 bits (367), Expect = 1.5e-33 Identity = 130/468 (27.78%), Postives = 207/468 (44.23%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. Swiss-Prot
Match: FTSH4_SORC5 (ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH 4 OS=Sorangium cellulosum (strain So ce56) GN=ftsH4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 141.7 bits (356), Expect = 2.7e-32 Identity = 127/471 (26.96%), Postives = 210/471 (44.59%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. Swiss-Prot
Match: FTSH_BUCAI (ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH OS=Buchnera aphidicola subsp. Acyrthosiphon pisum (strain APS) GN=ftsH PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 140.6 bits (353), Expect = 6.1e-32 Identity = 123/470 (26.17%), Postives = 215/470 (45.74%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TrEMBL
Match: W9RHH7_9ROSA (ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH OS=Morus notabilis GN=L484_024479 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 844.7 bits (2181), Expect = 7.3e-242 Identity = 418/498 (83.94%), Postives = 459/498 (92.17%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TrEMBL
Match: A0A067JUT9_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_23568 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 837.4 bits (2162), Expect = 1.2e-239 Identity = 415/498 (83.33%), Postives = 461/498 (92.57%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TrEMBL
Match: A0A059B763_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_H04217 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 836.6 bits (2160), Expect = 2.0e-239 Identity = 411/498 (82.53%), Postives = 465/498 (93.37%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TrEMBL
Match: A0A061F1B0_THECC (Metalloprotease m41 ftsh, putative isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_026140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 833.9 bits (2153), Expect = 1.3e-238 Identity = 415/500 (83.00%), Postives = 461/500 (92.20%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TrEMBL
Match: A0A061F0H2_THECC (Metalloprotease m41 ftsh, putative isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_026140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 833.9 bits (2153), Expect = 1.3e-238 Identity = 415/500 (83.00%), Postives = 461/500 (92.20%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TAIR10
Match: AT3G04340.1 (AT3G04340.1 FtsH extracellular protease family) HSP 1 Score: 770.0 bits (1987), Expect = 1.2e-222 Identity = 385/498 (77.31%), Postives = 435/498 (87.35%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TAIR10
Match: AT5G15250.2 (AT5G15250.2 FTSH protease 6) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 6.1e-30 Identity = 134/493 (27.18%), Postives = 216/493 (43.81%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TAIR10
Match: AT1G50250.1 (AT1G50250.1 FTSH protease 1) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 2.6e-28 Identity = 74/171 (43.27%), Postives = 97/171 (56.73%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TAIR10
Match: AT5G42270.1 (AT5G42270.1 FtsH extracellular protease family) HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 1.7e-27 Identity = 71/171 (41.52%), Postives = 98/171 (57.31%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 68.2 bits (165), Expect = 2.2e-11 Identity = 59/234 (25.21%), Postives = 108/234 (46.15%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. TAIR10
Match: AT3G47060.1 (AT3G47060.1 FTSH protease 7) HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 2.2e-27 Identity = 67/149 (44.97%), Postives = 92/149 (61.74%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. NCBI nr
Match: gi|659086122|ref|XP_008443775.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487285 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 932.2 bits (2408), Expect = 5.0e-268 Identity = 471/498 (94.58%), Postives = 482/498 (96.79%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. NCBI nr
Match: gi|449449669|ref|XP_004142587.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101207174 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 912.1 bits (2356), Expect = 5.3e-262 Identity = 463/497 (93.16%), Postives = 476/497 (95.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. NCBI nr
Match: gi|703120875|ref|XP_010102198.1| (ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 844.7 bits (2181), Expect = 1.0e-241 Identity = 418/498 (83.94%), Postives = 459/498 (92.17%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. NCBI nr
Match: gi|1009117928|ref|XP_015875583.1| (PREDICTED: probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 5, chloroplastic [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 843.2 bits (2177), Expect = 3.0e-241 Identity = 415/503 (82.50%), Postives = 463/503 (92.05%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG03G010040 vs. NCBI nr
Match: gi|802759535|ref|XP_012089378.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105647765 isoform X2 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 837.4 bits (2162), Expect = 1.7e-239 Identity = 415/498 (83.33%), Postives = 461/498 (92.57%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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