ClCG02G006880 (gene) Watermelon (Charleston Gray)

NameClCG02G006880
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr02 : 7963130 .. 7985242 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDS
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CCTTGTACGGTTAAGAAGTGACTATTTTGATCTCATTTTTTCTACCAAAATTTTAGGATGGCACTTCAATCGCTAAATCTCTTAAAGTTGGCAATAAACTTGTATTAAAGGGTTTTTATTGTGTATAAAATTTGTGTTAAATTTTTACAAATATAGATCAAAATGATCACTTTTAAAAATACAAGGATCAAAATTGACCGTTTTAAAAATACAAAGACTATTAACAAAAGTTGAAAGTAGAGGACCAAAAGTAGTATTTGAAATCATATACCTCATAGCAGTGTGAAAATAGATACTTCTCCATATAGTTCTGTTGGTTTTAAAATGCATTTCATGCATTTGTGACAATTATTTTCAGTACAATGGAGTGGGGATTTGAACCACAGACTTCATGTATTTATGCTAGTTGAACTAAGCTCATTTTGGCTTTTACTTAAAGTTCTTTTACTGGACTTCACAGTTTCAATTTGCATAGTTTCCATTACACTTTCTTTTAACATCTATATTGACATAAATGTTGAAGCTCTTTCCGCTGGTTGGGAAATTTTTTACACTGTAAAATGGGATTATCATTTACGTCAACCTTTTTCTAGTTGATGTAATTTCCTTTTATTACTGAAAACTCACAATTGTTTTATGTTTTCATGTAATATGCCAGATTTAGCCAGCAAGGTTCTTCTTTCTCATACATCTAATGGTACAAAATATTGTCATGTGGCCTCATCCAATGACTTGATGATAATTAGAAGTAGAAAAATGATAAAAGAGAGTAAAACATAAGATAAAAATAATGGGGCATTCCGAGAATTGAACTCGGGACCTCTCGCACCTAAAGCCAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCATTAATAAAAAGTTTAACTTCAGTTATGATATTTAATCAGATTGTCATTTTGGTAGGATTGAATGTCATGAAACTGCCAGTTTAATGGGGATACCATTACTAACTCTGCTTTGATATCTTTCATGATACTGAATCAGGTTTCTGCTATATTTTAACTTCTACATGAACATATATGATTTCCAAAAAGGACAATTTTGTACAAGATTGTCTTGGGGCATTCTGAGAATTGAACTCGGGACCTCTCGCACCCAAAACGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCTATTCATAATAGTATATCCAATTTTTTAAAGATCTCTTCATCATTATTCTATAAATTCTATTTTATCTATCAAACACTGTAAAATGTTAATCATCTCAGGATTGATCAATAAAGAATGCGTCACATTAATGAAACCTATGTGCCTATATTATTAACTTTATATCTTTTAGATCTAGACAGCTGCAAATTTGGACTATTCTCAAACTTGTTATATAGGAGTAGGTACGATCAATTGGGAAGAGGAGAAAACGTTGTTGGAAGTCAATCCTTAATGCAAATTTTAGATTGACAGTTTCACTTGAACCACGCATTTTGAGCACACAAGTAAAGCAAATATAGAATGCTAAGATTTAGTAATGTTAGAGTGTTTGTATAATATTAAATTTACCTGCACCTAGCAACTTAAGCTCTTGGGTCAATCAATGATTTAATAGTTAGACAATGTTGATTGATTAACATCTATACTTTTCAGTACTCAAGAGTTATGTTATTTCTTCTTACTGAAGCAATTACAGTTCCTCCTACCTATGGTCTCATTAGTTGAATTCCCTTCCAATGGGTTGGGTAGAAATATATGGTGGAAGTAGATGATTATGATGTTAGTATTTGGTTCATATACGTTCAATTTTGGTTAATTTTTGTCCTTGTACTATCAATATATATGTTTTGTTCCTTGTATACTTTGTAAGAAGTGACTTTTTTGGTCTGATTTTTTTGATACCAAAATTGTAGGATGATACCTCAATTACTAAATCCCTTAAAACTTAGATGTAAATTTGTATTAAAGGGTTTCATAACTTTCATTGTGTATAAAATTTATGTTACTCTTGCAGATAGAGATCAAATATGGTTGTTTTTAAAAGCACTGTTTTGAAAATACAAATACTAAAATTAACCAAAGTTGAAAGTAGACTCCTATTTGAAATAATAATTGTAATTTTTGTTTTTCAGTCACAAAATGAGAAA

mRNA sequence

CAATCGAAGGGAACCAGTTCGTTCGAACTGCAACAATCGCTACTGCAATGGCGAAAGCTGATACGGCATACGGGATGCTGCCATTTCGGCTGGCGATTCTTATTAATTTTCTGTCAATACGTATGGAGCTGCCAATTGAGCGCGGTACTGGCTGTTTCGTTGTAGCTGCAATGGTGGAAGCTGATACGAGGTGTATTTCGAGCCTTGCTGACGTGGATGTGGAACGGTTGCTTCTACCTCAGAAAACTAATGGTAAAAGCCCTGGTAACCATTTGGTACGGTTGCTTCTATCTCTCAAGAAACCGAGTTTAGAGTCACAAAATGAGAAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGAAAGCTGATACGGCATACGGGATGCTGCCATTTCGGCTGGCGATTCTTATTAATTTTCTGTCAATACGTATGGAGCTGCCAATTGAGCGCGGTACTGGCTGTTTCGTTGTAGCTGCAATGGTGGAAGCTGATACGAGGTGTATTTCGAGCCTTGCTGACGTGGATGTGGAACGGTTGCTTCTACCTCAGAAAACTAATGGTAAAAGCCCTGGTAACCATTTGGTACGGTTGCTTCTATCTCTCAAGAAACCGAGTTTAGAGTCACAAAATGAGAAA

Protein sequence

MAKADTAYGMLPFRLAILINFLSIRMELPIERGTGCFVVAAMVEADTRCISSLADVDVERLLLPQKTNGKSPGNHLVRLLLSLKKPSLESQNEK
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG02G006880.1ClCG02G006880.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
ClCG02G006880Silver-seed gourdcarwcgB0288
ClCG02G006880Silver-seed gourdcarwcgB0368
ClCG02G006880Silver-seed gourdcarwcgB0445
ClCG02G006880Silver-seed gourdcarwcgB0711
ClCG02G006880Cucumber (Chinese Long) v3cucwcgB145
ClCG02G006880Cucumber (Chinese Long) v3cucwcgB308
ClCG02G006880Cucumber (Chinese Long) v3cucwcgB572
ClCG02G006880Watermelon (97103) v2wcgwmbB136
ClCG02G006880Watermelon (97103) v2wcgwmbB138
ClCG02G006880Watermelon (97103) v2wcgwmbB168
ClCG02G006880Wax gourdwcgwgoB259
ClCG02G006880Wax gourdwcgwgoB277
ClCG02G006880Wax gourdwcgwgoB281
ClCG02G006880Watermelon (Charleston Gray)wcgwcgB046
ClCG02G006880Watermelon (Charleston Gray)wcgwcgB139
ClCG02G006880Cucumber (Gy14) v1cgywcgB396
ClCG02G006880Cucurbita maxima (Rimu)cmawcgB101
ClCG02G006880Cucurbita maxima (Rimu)cmawcgB293
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