ClCG01G024970 (gene) Watermelon (Charleston Gray)

NameClCG01G024970
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr01 : 38010341 .. 38017496 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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ATGGCGCCAAGCTTCAGTAGAATCATAGACATTACTTCTGCAGGTAGTTCAAGCCAGTTCCTCGCTTCAGCTTCCGACTGAATCGTGGAGTTGGACTCCATGAGATGGGAATGGATTGGACTGGACAGTGTATTGAATTTTTGAGGAAATTGGAGAAATTAGGGACGTTTCGAAATGGAAATGAGGATTGTGTATGATAGGGTCTGGCCATTATTAAACCGAAATAACTGATCGTATTGATATTTGGACACAGAATTTCGATTTTCTGCCATGAGCCAAATATTATTAGGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAATATTCTTTATTTTAATATTGTAGCTGGGGAAAATAATTGGAAAAATATTTTTGTTTGAAAATATTTAGAAAAATATGGTTGTTTTAGAGGAGAGAAGGTCGAAACTTCAAACCTCGACCAAGGAGAAGGTCGAAGTTTCAACACTCGATCAAGGCTAAAGTCTAGCTCCCAGTCTCACTCTCTCCCAGACTCTCTCAGTCTTGCTCTCTCTCAAACTCTCTGTTTCGCCCTCTCTCTCACACTTGCTCTCTCTCTCTCAAACTGTCTCTCAGTCTCGCTCTTTCTCTCTCTCTCAACTCTCAAACTAGCTCTCTCAGTCTCGCCTTTCGCTCTCTCTCTCAGTCTCACTCTGTCGCTCTCTCTCTCAGTGTCGCGTCTCGTCGCCAGCTGCTACCTACCGTTGCTGCTGATCGTCGATTTTTGAAGACCTGAATCAATGTATTGATCCTGATCTCGAATCAGTTGCACCAGTCTATGACGATGAAGATATAGTGGCTGGTAATCAATATAACGGACGATGAGTTTGAGTAGTTGGATTTTAATGGTCGTCAACATGATATGTCGTCAAATACATTCGCTGATCTTGACATGAATATAATAGACAACATTAGATGAATATAAGAGACAACATTAAATTACATGACCCAGTTGTAGCCCTGTGGTTGTTGACAATACCCAATTGACATTAATATAATAGACAGCATTAGATTACATGACCCAGTTGTAGCCCTGTGGTCGTTGACAATACCCAATTGTATAAGGGTATAATTTTTCAACACATAAATGCTACAATATTTGGTCAAGTGTGTTGCTATCAAGTGTCATGCACCATACGAGGTAGTGGAATCAACACCGAATAATTAGGTAATTCGATGTAAGAAATGAGAGGATTATTGCAGATAGTGCCTCCCTGCAGCGAAGAAAAAATCTCATAATTTGTTTGAGATTACTAAGTATATTGAGCAACATACATGTTTTTACTTAGAGCTTAGCCAAAGTCATATACAAATAGATTCTTCAATGATTGCACTAGAGTTTTGTGAAGTTGTGTGGGAAAAATTGTCCATCAATGTGGCACAACTACAGTCCGACATCAAAACAAAATTTGGATACTATATGTCCTTACCATATGGTGTGGAAGGGTAAACGAAAGGCGTTGCTAAAGTGTTTGGTGATTGAGATAATCATACAAATTGTTGCCCAGGTGGTTGTATATGATCAATCATACAAATCCTAGCACGCGCGTGGAGTGGAGAATAAAGGGTACACCTACTGAAGAACATATCATCCTTATGTATTTTGGCCACTTGGCCCTTGTATAGAAACATTTAATAGATGTTGGCCTATTATTCAAATAGATGGTACTCACTTGTATGGAGACTTCAATTGATTCGAATGGGCATCTTTCTTTCTCTTGCATTTGCCATTGTAGATGAGGAGTCCGCTGACACGTGAGGATAGTTGGGCACTTGGCCCTTGTATAGAAACATTTAATAGATGTCGGCCTATTATTCAAATAGATGGTACTCACTTGTATGGAGACTTCAATTGATTCGAATGGGCATCTTTCTTTCTCTTGCATTTGCCATTGTAGATGAGGAGTCCGCTGACACGTGAGGATAGTTTTTAAAACACCTTAGAGAAATTGTTGTACACGAAGTGATGTGCTTGATTTTGGATCCACATGGTGGCATCATATCGAAAATGGTTGGACATGACCAAAATGTCACCATAGATTCTGCTTACGCCACATTGTAAGTAATTTTAATAAAAAATACAAGTTCAATAAGTTAAAGAATTTTGTATATCCTGCTGGATGTCAGTTTCAAGTTTGAAAGTCTAATAAAGCAGTAGAAGACATCAAAAGAATAAATTGACGTTATATGAGTTTTTTTTACAACATTAGTATTGAGCAATGAACTTAAGCGCACAATGGAGGGTTTAGATACGGGTGGATGACGACAAATCTATCAGAGTGCATCAATGGAGTCTTCAAAGGAGCTCGAATGTTGCTAATAAATGCTCTCGCTTAAATAACTTTTTACAAATGTGTAAATTATTTTGAGAAAAGAAGATAAGAAATAAGAGCTGCTTTAGAGGGTCGAGATAAATACACCCGGTAATAATTTTTTTTATTAGTAATCAACAATTTGTTTCAAATATTTTTATAGTAATAAGTGAGCAAATATTCAGGTACGCACGCGAAAAAATCTCAAAAGGGCTGTAAGATCCAGTAAACATGAACGATATACCTATTGCACCTCTACCAATTCCTAGGCATAGGGACGTGCTTAAGCAGAAGAAGTTGAGTTTGATGCGATTCACCAGTTCATACATGCATACACATGGGAGCGGTCGTGGAGAACATAATGAATATCTATACTATGTTCAAAGTCGATGACCCCAACCAGCTTGAAATCGGCGACGTCCGCCTTGTGGACACATTGAATTTTTTTTTATTATTATTTTTAGTGAAATAAAAACAATAAATTATTGTATTAATATTGACACTTTAATTTTATATTTTATTATTTTTTTATTATGAACAATAATTTAATGACGTTTTATGATTATTTTTACCTTTTTTACATTGGTTCTAATAATTTTTTGCGAAACTATTGGTTGGTTAGTAATAAAATATATCTTTTTTTGTTATTAAAAACTATAACTGTTTTTTAACCAATATTAGTTAAAATAATATTATTAAAGTATATTTCTTATTTATTAAATATATATATATATATATATATAGAGTGGTCGAGAGTTGGAAGAATAAAAAATAAAAAAAAAGGAATCGAGGTTGAACCTCGATCAAACAGTTGCCTTCACAACCTTTCATAAAATTTATAAGAAAAATATTTTAAAAAATACAATATTTTTCTAAATTTTACCGTTGAGATATATCGATGATTCAAAATTCAAAATTTTTAATAGACACGTGTCGACTTCTCATGGATATGTATATTATAAAACAAGGATTGTTGGACATAGAATCATAGAACTAGAGGGGAAAATATCCCAATTATATTGTAGTTCCTAAAACTTAAAAGATAATATTAATTATTTTTATTTTTATTTATTTAAAAAAAAAAAGCTGTTTAATGCATAATTTTTTTTTTCGAAACATAAAAATTTAAAATATCATTTTGGTTCCTATATTTTAAAGTTTGTTTAATTTTAGTCTTTATACTTTTGCATATTCAATTTTAATCCTCGTATTTTCAATAAATCTTAAATTTAGTTCTACTACTAAACTAAACTTGAATATTTGAAAGTAAATGGACTAAAATTGAACAAATTACAAAGTATAAAGACTAAGATGATATTTTAACCAAAATAAAAATAAACTTCTTTAAATGGTATAATAGTGATCTCAACAAATATATATGCATACATACACCTTCTTTATTTGACTTAAAAAAAATATACAACATTGTATCAATTTTCAGAGTAAACTTTCAATTTCACCCAATTAGACTTTAGTTAAATGTCATTCTAATCTTGTATTTAATTTTCATTAATTCATCAACTAAATGAATAACAAATAATAATTTAAAAAAAAAAAACATTGTGGCAGTATTTATAAACTCACTAAATTTAATGATATTAAATTTGGAACAAATTTAAAATTGGTTAATATCCAAAATAAAGTATTGAATAACATTGTGAAAACTTGCAGATTTTAACCAAAATATTATTAATAATAAAAGTTATAATGTTAGTAGTAATATATATATATTTTCAATGGCAAGGTTAATATTGCAATATTTATATAAAGTTGAATGAAAATTTCATGAAGCTCGAATTGCTACAATTTGGGAACTGAGAAGAGCGATGGCTTTCCCGCGCCGCCGGTCTGCCAACCCTTCTTTCCCAACCACAATGGCTTCTTCTCACAGAACAAACTCTCCATGTCAGTTCCGTAGAATTTCTTGACGTCGCCAAAGCTTTCCCCTCCACCCCTTCAATCGTTCGTTTACAGTGCGCTGCCCAGGATTCTCGTTTATAAATTCATCCTCCTCATGTTTTACAGGTGATTCTCTCTCTTTTTCTTTCAAACTTTAGTTGTAATCAGGTGAAATCATCTGAAATTTCGTTCTTACACAGATATTTGCTCCAATTTCGTAAAAGTTGAGATTTAGGTTTTCATTCCCGTTCCAAATTTCTCGGCTCGTCGATGTTTCTGAGTTGGATAGTGGTTTTGGAGATTTCCCGTAACCTTATCAGTTAATTGAATCCACTATTATTTAAGAGAAGAATAAGTTACGAAGGAAAATTTGTTTTATGTTTTGGATGATGAAGATTGCATTTAGCAGGTAACTGATGAATGTTTTGTTATGTTCTTAGCTTAATTGTAAATCTGGTGTCATAAATTTCTTATATTATCTCATTATCAAGAGAAAGTACACCGCTCTTTACAAAAGTTGTATGCTTAACTATGTATTTGTCTGCCAATCTTTAGTTTCGAAGATAGATTAAATGACTGTCTGTTAATATATACTTATTGCAAGCAGTTGTAAGTGGTTTACGGCCATGATAGCTTACTGGGTAATGCTAGTTCAACTTATGTTTGCGTTTTGAATTGGTATAGTTTCAGCTCATATGGCTTATCCAGGATTCGTACTTTTTTAATTTGCAATTATTGATCTCTTGCACGTTAATCTGATATTTGATTTAAATTT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mRNA sequence

ATGGCGCCAAGCTTCAGTAGAATCATAGACATTACTTCTGCAGAGCGATGGCTTTCCCGCGCCGCCGGTCTGCCAACCCTTCTTTCCCAACCACAATGGCTTCTTCTCACAGAACAAACTCTCCATGTCAGTTCCGTAGAATTTCTTGACGTCGCCAAAGCTTTCCCCTCCACCCCTTCAATCATGCTTAGGGAATCACAGGAGCTGTTATATTCGATACAATCTCGAAATAATTCAACCAGAAGTATCGATAAAAAGCAATCAAAGATTGAAAATTTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGCCAAGCTTCAGTAGAATCATAGACATTACTTCTGCAGAGCGATGGCTTTCCCGCGCCGCCGGTCTGCCAACCCTTCTTTCCCAACCACAATGGCTTCTTCTCACAGAACAAACTCTCCATGTCAGTTCCGTAGAATTTCTTGACGTCGCCAAAGCTTTCCCCTCCACCCCTTCAATCATGCTTAGGGAATCACAGGAGCTGTTATATTCGATACAATCTCGAAATAATTCAACCAGAAGTATCGATAAAAAGCAATCAAAGATTGAAAATTTGTAA

Protein sequence

MAPSFSRIIDITSAERWLSRAAGLPTLLSQPQWLLLTEQTLHVSSVEFLDVAKAFPSTPSIMLRESQELLYSIQSRNNSTRSIDKKQSKIENL
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G024970.1ClCG01G024970.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableunknownCoilCoilcoord: 76..93
scor

The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
ClCG01G024970Lsi01G001100Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwcgB127
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None