ClCG01G011230 (gene) Watermelon (Charleston Gray)

NameClCG01G011230
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr01 : 18273772 .. 18284703 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGTAGTAGGGACGGGGGACGGGGAAGCCATCTCCGATCCTGCCCTACCCTCATGGACATCTCTAAGTCTACCCCACAGTTAATGAATGGAGGTTAATTAAATAATCTCGAATCATTGGAGCTTATAATGTGTAGGCAAAGTTCTTTTGCTAGCTCATAAAGTACCAACAAGGATCAAGGTATTGATAGATTAATTTGAAGTGTTCCAATTAATTTAGAGAAAATGCATTTATTTTATTAAATACAATTAATGTAAATTATAATGTATGTAAATACAATTAATTATATATAGTTAATTATGAATACGGTTCAAATTAGAACTATACGATATGGGATAATAAATATATTTAAATATGATTCAAATAATTTCTTAATTTTATATAAATGAGATACATATTAAACCTAGGTATTCATGGCAGTTCAATGTATTATAATATGATTCAAGTAATTAACAATTTAATATAAATAAGATTTATTTTAAAACTATAGCTTAGGAGTGAAATATAAATTTGAATAGGATTCAAATGAATATTTATTTTAATATAAGATATTAAACTAAATATTTAATAGAAATTAGTTTTTAACCTAATTAGGCCCTATTTATAGAACCATTGTAAGAAGAGAGATAGATCTCTAATTCATTCTCACGTAATTTTATAAAAGGTGGTTTCGTATTCTCTCTAAAAAACCAGAGAACTTCTGTAACTTTTTTTGATCTCCAGTCTCAAAATTCTCTATCTTCTCTATTAGACTCGCACAAGTTGATCCTTGCTAAGAGATATAGCAAGGAAAGCCTATTGGACTTTTTCAACCAACGTTGGAGGAAGATTTTTGTATCAAAAGAATTTCTACAAAGGTATATTTTCTTTCTAATTTTTGGTGCTTAACCTTTAAATTACAACATGTTCTTCTTTCAGTAATTTTATTGTATTTTTCTAAATTTTTGCAATTTTTGCTTCTAATCCATATGAAAGCAAAGGCGTTAATCTTCTTCCATGGGGGATTTGATCCATTCATTTGGATCTTCAAATGGATGAGAAAGTTGTTGAACAACATCCAACCATAAATGATCTTGTGTTTTAACTGACTAGAGGGGTGAAGAAAGGCTAGCCTAAGAAGGGGCAATTGTCTACTGATAGGTGGGGGTGTGCAGCAGCCAATCGGAGTCGATTTTTCGACCAAACTGCCACTGAACCGATGATTGTCTATTTAATAAATCTTCAAATCGACCTCGACCATCAAGGAGTTAAACGGCCTTCAGTCGGTCAGTCAGTCAGTTTAGGTCAGTCTTATTCTTTGAATTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAATGCCAATTTGAAAATTTCCAAAGTCCTTCCTTTTCTTCAACCGACTGCCTTTGTTCAGTTAGCTTTGGTCGGCCAGTTCGATTTTTCAGTCTATCATGCTCACCCGTACTAATAGGTGTGGTAAATAGGTGCCAATCTTCTCATACTTCTTGCATCTCTACCACTCTTGCTAGCCTAGTGTAACAGATTAGTATTAGATCCAAGTTTAACTATGGTGCGCTTTGTTAAATTAGGTCATCCGACATGTTGGGTCCCAAGCTATGCAATTAGCTATATGCTTTCCTCAGCTAATTTCTGGATCTCGTTTAGCTCAAAATTCGAATATCCTACTTCCTAATGAATCACCTAGTCATGCTCTTTTTCCACTCACCTTTAGCTACAAGTTCTATTAAGAAAAACATGTGGTTGATCTTGTGCATACAGTGTCTAAGCACCTAGAGAGTGCACCAAGTATTTCTGAACTCATCTTTTAGAAAGCATATCATACATATTCTAACGAATGAATTCAGAGATTTGGGTCTGTTGATTCTGCGTTTTATTGAACAAAAGTCTAAGATTGATGGGAATCTTCAGTTAATGCACTTATCTGCTTCTTGTACTTATCTGAATTCTTTCTCTAGTGGACAAGGTGATGTTGGTGGTGGTTTTGAGTGTTTTTTTTTTAAAGTTAGACAAAGAGGGAGATTAGTCCCCATGCTTGTTCTCTATTTGTATCTGTTTTCTGACTCTATGCTAGTTATATTTCTGGTTCTGTTAAGACAATTTGTGGTAGTTTATGTTGTTTTAGTTGTAAATGCTTCTTTGTCCTTGAAAATGGCTGACATCTGATGAATGATGTGATGGTTTTTGGGTTGTATGATTCTCCTGTTGTTTTGGATGTTTTGCCTTAATAGATAATTACCAAAGGGTGAGTTTGTTAGAGATTTGAAGTTGACAATATTTGTTTAAGGTTGGCCTATGTTTGCTTTAAGATGTGTTATCCTTTAGTGGTTGTCTTTGGAATGTCTTAACATGTGTCACTTCAGACAGTTTGTTGTTCTCTTCTAGATGTTTCTACAGATTGATTGTTGTCTTATCAGGAAGATTTTATAGTAGTTTATTTCTTCGATTATGTTTCCTTTTTTTGATCTGCTCAAAATATTTTGTTAGGGTTGTCTTTGCGTTTCACAATGCATATTTAGGGGTTGCCTTTGCATCTGTTAGGGTTGGTCATTTTTTGTGACAGAAGATATTGTAGTCGCTGTATTCTAGGTTCCATTAGAATCGAAAGTGTGTAACCTTCTCTATGAAGGTTGTGTATTCATTTTTTTTTAGTGAATGTTTAAGCTTTGCATCATAATTGATTCTTTAACAATTGTTAAAACTAAACAAACATGGTGAAGCTCACCTGCTAAAAAACAAACACTTTTGTTAAAAAAATCTTGAATACTTTGTTAAAGAAAAAGTACCTACTCACATGGTTTTCTCTCTCATTTATGTTTTCACACTTTTTTCTTTATATACTTCAATTACTTTTGTCACGATCTCATACCTTTTGTTTTCCAACTCTATGAATATAGTTTTACTTAAGGAGTTAGCAACATAATAATCGAAGCAAGTAGGATCTAAAGCACTATAATTACATCAATTTTGAAGATTAAACATACTTCTAAAAACCGAAAAACAAAGGAAGAACACTTGTTGTAGTTCAAAATTGAATCAAATTCTTTTGAGTTCTTGACCACCAACACTTCGTGGACTACCACAAGAGTCTTTCTTATCATCCCCAGGCTTTAGAACGGATTGTGGGATCCAAATTGAGTTCAATTTGAAGCAACAAAGTGATCAACACACTGTTTTTTTAAGTTTTGAGTAAGGCAGAGTTTCAACACAAATTAGCTAAAATGTTTAACCCATTTCTTCAAATCTTCTCTTATGTTTAAAGAAGAGAACATGCAGATCACGTCTCCATGCATGAACAACAAATTAGCTGATTAAATCAACCAATTTGGAGGTGGAAGAAGAAGAAGGTGTTTGCATGATGAACACCACCTACTTCACATGTATAGTGGAGAATCCATAATCCAATTTTCTAATTGAATTTTGACTTTTTCAATTTCACAAATTGAACTTTAACTTTTCGATTTCACAAATTGAATTTTAATTTAAAATTAGTTTTCAAAAAATCAATTTTAATTAATTAATTAATTAATTATATTAAATTAATTATTTCCACTATTTTTGACAAAATTCCAACCTGATGAATCTCTATTCAACCTAAAAATATTTAAATCACATTTAAATATTTCTCTCTCTCCAATTTTGTCTAATTCATAATTAAACGAACAAACCATATAATTTGCTCCTCAATTGATTTTGAACATTGCAAATTAACTCAATATATTGGGGACCTAATAGATCTACAGATCATGAGCTCACAACGATCTGAAATTAACCAGCTAAACTCTTTAACATAGTTAATTAATATTCGTTAACTACCGGGACACTCCACTAAAGCCAGTAGTTGCACTCTCCTCACGGTAGATATATTTTTGTCTACTTGATATAACCATAACAAATAAGTTGATCATTCACAAGTTGTTCATAATTATACTTGGGTCAAAATTACCGTTTTACTCCTGTAATTACATCTCATTCCTTAAGTCTCAATGATCCTCTAATGAACAATTAGTTTGTGGTTCAAGTCCCGGAGTCAGTACTTAAGGGAATAACTTCTACTATCCATAAATAAGGTAAGAGCAAATTCCATCTTGAGGACTATGTCCCCAGCTATTTGCCTGATCTTATCCCTAAATGGGAGACATATTGAGTTGGTGAGACTGAGCTTGCTTGTGTCTGATCTAAGCCTATTGCCTGCCTATCCCCATCTTTTTCAAGCGGACTCAATGTCTCCCACTGAAACTAGTATCTTATCCTTGACCACCAGTAGCATAGCTTCGAAGAACTTTCTTTTTATTGTCTACAACTACCGATGTTGTTCAAATGCTTTCTTTTGTTGTTTGGTTACAACATCACTTGATTGAAGAAGCCATTAGCGCCAGATCTGAGGGCTTCTCTTTTCTCAAGAATGAAAAAAAAGATCCTGTTCTTTAAGAAGCAACAACATTCTCATCTTCCAAACATCTACATTTAGAGGTTCCATTTTGCGATCCTTGACAATCGTATACGTTAATGCTGTAATCATATCAGCAACTATAGATCCAGAAGATTGTATCGCTACCATATCTGCATAACCTAGACTCTCATACCAGATGATAAAAATCTTTAGCTGAAAGAAAGAACAAATTTTTAGGAATGAGCAGAGCTGAGATCTGCTGTTGTTGAGTGGCAGCAAATAAGAAATCTCGTTTGATTTGATTTGAAAAACTATATATATATTGATATTTATATCAAAGTCGAAATATGAAAATCGAAAACTCTTTGAGATCACTCCACTCTCTCTATCCCACTTCCTTCTATTCAAAAAGGTGAACATCCCTTACTTAAACAAAAAGGCCAAATTCGGGGGCTCCTCTTTATATATTACATAAGCCCTCAAGTAGATAACCCCAAAAGGCGAACTCCGCTACTTTTTAGGAGTTGGTTTTGGCTTGCCTCTTTTTATGTTATTAGTAAAGCGCTAACGAGCAAGAAAATGGATGTGCTAACTTCTTGACTTTCGATATGGAAATGCA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TAACTTGATCCGTGCACTTAAAGAATCGTGCATCAATATTTAAGATGTGTAATTGTCAAGAATGCGTGTTTAGTTTGAGTAGGAAATAGGTCGAGTTTAGTTATGATTCAATCTATGGTGCACCAAAGGTTATTGTAACGAAAGATAATAATTAATAGGACCTACAAAATAGAAAAATGTTAGGTATAACTTGGCCATGCTACAACAAAATTGGAATTTCATGACACTTAAAATCTTTCACAATTAAAATTCATGATAGTTATTTTCAGTCATTTTGTGTCACCTATCAAGGTATGAGTATCAATGACGCTTTTGAATAAAGTCATAATTGAATATTTGAGCAAGACAATAATGTCATAAATAGATGGCCAAGCCTAAAGGGTGTCGAGGCCTTCGAACTAGTCAAAATAATTTTCATGCCCACGCTAATTCAGTAACAATAGTGGAGTATAATTCAAACCTTAGGGAGACGATCAATTTCTCAAAGAAAATGCTTCTAGTTGTCATAACCAAGGGGGGAAGTTGGTTGGTGAAGGTTTTAAACTAGGATGCCAACGTGGCAGGACGGGCCTGGGGATGCACTCCCCATCCTTGTACCCATGGGGATTTAATACTCGTCCCCACCTTATTCTCCGTTTTGGGAAGTCAGGGTCGGGGTCGTGGGGAAAATCCCCGTTTTTTATTTTATTAATTTTGATAGCACTTAAAATGTGTTATCTTAGTGCCTCTAATTTCGCCCATTTATGATATTTAATGTGCTTAAATGTTTATAGTTGTAGGATATTGAGCATGTGAAGCCATTAGGATGGTTCAGATGCATTTCGAGCTTAAATGGGAGAATTAGCAAGCAAAACTTAGCAAATGCGCAAGGAGGCCAACAAGCAGCTTGGCACTGCGGCGCTAGCCTAATACTAATGTTGCGCTTTTCTCAG

mRNA sequence

ATGGACTCGCACAAGTTGATCCTTGCTAAGAGATATAGCAAGGAAAGCCTATTGGACTTTTTCAACCAACGTTGGAGGAAGATTTTTGTATCAAAAGAATTTCTACAAAGTCATTTTGTGTCACCTATCAAGGATATTGAGCATGTGAAGCCATTAGGATGGTTCAGATGCATTTCGAGCTTAAATGGGAGAATTAGCAAGCAAAACTTAGCAAATGCGCAAGGAGGCCAACAAGCAGCTTGGCACTGCGGCGCTAGCCTAATACTAATGTTGCGCTTTTCTCAG

Coding sequence (CDS)

ATGGACTCGCACAAGTTGATCCTTGCTAAGAGATATAGCAAGGAAAGCCTATTGGACTTTTTCAACCAACGTTGGAGGAAGATTTTTGTATCAAAAGAATTTCTACAAAGTCATTTTGTGTCACCTATCAAGGATATTGAGCATGTGAAGCCATTAGGATGGTTCAGATGCATTTCGAGCTTAAATGGGAGAATTAGCAAGCAAAACTTAGCAAATGCGCAAGGAGGCCAACAAGCAGCTTGGCACTGCGGCGCTAGCCTAATACTAATGTTGCGCTTTTCTCAG

Protein sequence

MDSHKLILAKRYSKESLLDFFNQRWRKIFVSKEFLQSHFVSPIKDIEHVKPLGWFRCISSLNGRISKQNLANAQGGQQAAWHCGASLILMLRFSQ
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ClCG01G011230.1ClCG01G011230.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
ClCG01G011230Silver-seed gourdcarwcgB0052
ClCG01G011230Silver-seed gourdcarwcgB0485
ClCG01G011230Cucumber (Chinese Long) v3cucwcgB021
ClCG01G011230Cucumber (Chinese Long) v3cucwcgB024
ClCG01G011230Watermelon (97103) v2wcgwmbB089
ClCG01G011230Watermelon (97103) v2wcgwmbB093
ClCG01G011230Wax gourdwcgwgoB235
ClCG01G011230Wax gourdwcgwgoB241
ClCG01G011230Watermelon (Charleston Gray)wcgwcgB085
ClCG01G011230Cucumber (Gy14) v1cgywcgB321
ClCG01G011230Cucumber (Gy14) v1cgywcgB552
ClCG01G011230Cucurbita maxima (Rimu)cmawcgB180
ClCG01G011230Cucurbita maxima (Rimu)cmawcgB341
ClCG01G011230Cucurbita maxima (Rimu)cmawcgB578
ClCG01G011230Cucurbita moschata (Rifu)cmowcgB171
ClCG01G011230Cucurbita moschata (Rifu)cmowcgB342
ClCG01G011230Wild cucumber (PI 183967)cpiwcgB023
ClCG01G011230Wild cucumber (PI 183967)cpiwcgB025
ClCG01G011230Wild cucumber (PI 183967)cpiwcgB456
ClCG01G011230Cucumber (Chinese Long) v2cuwcgB020
ClCG01G011230Cucumber (Chinese Long) v2cuwcgB022
ClCG01G011230Cucumber (Chinese Long) v2cuwcgB435
ClCG01G011230Melon (DHL92) v3.5.1mewcgB137
ClCG01G011230Melon (DHL92) v3.5.1mewcgB143
ClCG01G011230Melon (DHL92) v3.5.1mewcgB517
ClCG01G011230Watermelon (97103) v1wcgwmB155
ClCG01G011230Watermelon (97103) v1wcgwmB161
ClCG01G011230Cucurbita pepo (Zucchini)cpewcgB064
ClCG01G011230Cucurbita pepo (Zucchini)cpewcgB065
ClCG01G011230Cucurbita pepo (Zucchini)cpewcgB456
ClCG01G011230Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwcgB125
ClCG01G011230Bottle gourd (USVL1VR-Ls)lsiwcgB169
ClCG01G011230Cucumber (Gy14) v2cgybwcgB019
ClCG01G011230Cucumber (Gy14) v2cgybwcgB021
ClCG01G011230Melon (DHL92) v3.6.1medwcgB126
ClCG01G011230Melon (DHL92) v3.6.1medwcgB135
ClCG01G011230Melon (DHL92) v3.6.1medwcgB512