ClCG00G000280 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTCGAGCTCTCTGTTGCAGCGGTACCGTCGTGACCGGCAAAAGCTGTTGGCATTCTTGCTATCCTCGGGTTTGATCAGAGAGTTGAGGACTCCGGCCGGTCCTGTCACTAATTTCTCCGCTGTCGACCTTGACTCTCTGAGTGCTAGCTATGTTTTGGAGTGCATTAAATCCGGTAATCCTGCTTCCTCGTGTGTGAGAGATGAATGCAAGTTCTTGTAATTTCTTTAGCTTGGTTTGAGTGAAAGATATGGTATCGAATTTGCAGTTTAATTCTATAGCTAACACTTGGAATGAAGCTGGAATTCTGTGTCATATTCTTTTTTGTTTTTGCAGTTCTTTTAGTTTTGTTTTTCAGTAAAGTGGATTGGACTTCATTGTTTGGGATCGGAATGTTTGTGTTAACCGTTCTGTGGCGGAGTGTTAAGCTGTTTTCCATTTTTTTTAATAGCGCGTTCTCTGTTTTTAGTTGACCGAGTAGCGTAACTGCGAACAATTGTAACGAATTTAATTTCGTTGTTATTTTCTTGCTTAGGTGGAGTTATTGACATTTCTACAGCAGCTAAGAAGAAGCTACATGAATCTTGTTACCCGACCATGGTAAGAATATGCCTGTGAGAAGTTACTTGAATTTGTATTTTCTTAGCGATTAACATTCTGCTGCGTTGTTGTTTTTTCGAAAGAAAATATATCGTTCTAATGCTTCCGAGCAATTTAGATTCTGAAGCGGACTGTTTAGTTTATGCACTATCTGTAAATGCTGGATTGAAACTTAAGCTCTGCCGAAGTTTCTGGTGATTTCTTTTTTATATAACGATTAGCAAGCATTTTTCTCCCGAACTATCTCCGTCGCATTTAATGACGCATTTATTGTCTGTGCGCCGTAGTGGCAATGAGCGTCTTTACTTTGTTTGAGTAGTTGATCATATACATAGCGAAGGTGCGACTTCCACAAATTTGACTTTCGAGTTGTACCAAAAAGATTTCGATTTTGAACGTGTTTTTCTTTTCGACGATTTAATAGTGGTAATCCATGCTATTTTGCTCATAGTAGTTAGTAGTGTAACGATTTTGTTTCAGGAAATTTTATTTCATTAGAATTGGTAGGAGGTTTATATGCATGTTTGTATTACTTACTAATCTGATGTATATGCAGATACAATCTCGGTCCCGGACTACTTATTTTCTACATTCTCATCCAGATTTATCTGGATCACCTCCTCGTCGTGCACCACCACCAATAATGGTGGAAAGGTCCTCTAGTAGTGACATATCGTGTTCATCTAGGTCGATTGAGTCGTCAATTGATGACAATATTGAAACCTCTAGTGATGACTGTGGTCCTCAATCTAATGGAACAACAGCCACACCTTCGAAACTAGGGAAAGATTTTGAAGTTCCGGCTTTAGGACTACCTAAGTTGTATACAGGTATTTGATGCTTTTATTCTTCTATTGAAACGAGATTTTGCTTCAGAATGTTTCAGAAACTGACATTATTAACCTTTCAGATTTCCCATGAAAAGGAATTATCTGATTAGTTGTTTTGGTTCTGGTTACCTTTTTTTTCTGTATAATTTTCCAAAACAATATCTCAAGGTGGGATATCTCATCTCCCCTCTCTTGATAATGAAATGTTTGTTTCGTATAAAAAAAAGAAAAGGATCTCCAAAACAATGTTTAAATTTGTCTAGTAAGCTTCCCCTCCTAGCAACAGTTCTATTAAAAATTGATTGGTAGTTTTATGATGATCAAAGGATTGGCAGATGGTGACTTGGATGAAGCAGCATATATAATCTTGTTTGCATCAATGGCATTTTCCGGGTGTGTTCTCTTCTTATGGAAATGTCTTTTTTTTTTCTCCCTCTTTGTAGTTTTGTCCTGCTTATACTTGCCAGATGCTGTGCTTCCTTCCAGAAAAACCTCAACTTGAATATGTGTTCATGTCTCTTTCTTTCTTTTCCTGATAGTGGTACGGAGAATAAAATGTCTCTGTCTTCTTTATCATTTTTTTTTGTTATCTCTCTCTCCATCACCAGGATCGAAATCTATTCATTTGAGGACACAAAGAAAGAAAATGTTATTAAACATAGTGCAGGGGTGAAAAGTAAAAGGGAAGAAGTAGATGTTCAATCAGAGAATTTTGAAAGACATTTGAATTTGCTTCACACTGTCCGCACCCAGATGCAGGCAAGGCATAAACTCATTCCATAAGACGATCTTATCACCATTTCTTTTTTACATTGAGGCCATGCATCTTAAACTTTACAATCCATTAAATAAAATTATAATTATAGCTACTTTGCTACATATAGTGACATATTTTCTGTTCTCCTGGAGAGGTTAACAGAAGTTTTCTAATTCATATATGTTGATGTTTGTAAAGTTTATGGTTTCTCTTTTCTAACTCATAGCGTATGCCATATAGTTGTTTATTATATATGTACTGATGACAAGCCTTTATTGTGTGGTAAATAGTGAATGTAACTTCCTTGTCACAAGCTGGCCTTGAATGACTCATAAAGCAGGATAAATATATGTATAGATGTTACATATCCTCCCTATTCTCCTTCCTCTCTCGTATCTCTTCCCGCATTAACTTGGCCAGTAGCTGATTTTAACTCAATATTTACATCATTTGACCAGATTTCAACATTTGCTGATGCATGCATGAGGAAACGGTTAATGGAATTGGCTGCAAGGAGAAACTGGGGAAAAATTAGTGTTCCTCAGATTTTGTTGGCCCTTTTGCATGGAGTTTTCAGATCTGATTTTCCTAGTGAGAAATCTTACATGCAATGGAAGCTTAGACAGGTAATTAATAAACTATGGACAATTGATGGAAAAAAAAATCTTTGCGTTTCTTATCGTAGTTAGAATGACTCAAAAGCTCTCTAGTTCTTTTTTATGTGTTGCTGTTTTTAATTATGGACCACACACACCTAGTAGGGAGCAACCAATTGTATTATCTTGGGCGCCTTATGGCCATGCAGCTGTAGAGGCTCATTTATGGATGCCTTCTGAGAATAATGAACGTATACATATTTTAGAAACCACATATTCAAAAACTGAGAAGAAGTGAACAACCTTCCAATCTAGGTATTCACACCTTCCATATGTTGTAGTCCAGACTTGGGCTTTTGAAACTTTGAAAACCTTGATACTTTTAGTAGAGTTGACGTATCTGTTGGGGCCTGCAGTTATGAGAAGTTGGTATGGTGGCAATAAAGTGAAGGACTTAATAGATAGATACTGCAGTTTTAAGACTAATGGTTGTCCAGTACTTGAAATGAGCACAATAAACCTTTCTTTTTGGGTTTCTTAGTTGAAAAAATTTTATGCTCAAGATGTTGGCTAATATGAACTGTATGTTGAGTAGCCAATTCAAGGCTGTTACTAGAACAGATGACTGAAGAATTTTGTATCGGGTTCTGAAGTTAGATAAAAGTTTCAGATCACAGTTGTGGTCTGTGTCATGACATTACAATGTTGAAGGAAGTGGATGTAATTTGATATTGTGTAATGGGTAGCATTGGTCTGGGTTTCTTCAAAGTACATGCACAAAATGAAAAAAAGGAAAAAGGAAACCTACACGTAAGAGTATGTACCATTTTGAAAAGATTGTTAAAGAAATTAACTACATGTGATTGTTTATTATTATTTTTGATCAACTAAATGAACTGCAATGGTCAGAAGTTACAACTTTCGTGTGATAGCTGTTATAATTGTGAATCTCCTTAGAACAGATGAGGTATCATGTAGGAGTAGCAATGTGAGTAAAGTTTGATATAGACATAAAATGTCTTCTCCTTTCTTTAACTATGATGTTTGGTGTCTGCATCTATAGGTCAATATTTTGGAAGAATTCTGTTTCTCTGCTAATCTTGTGGCATCTGAACGTCGAATCTGTGAAAGCTCTCTTATGATGATCAGAAGCACAAAGGTTATTATGCCTTTTTTTTTTTGTTACTTTAATCTAATATAGAGTATTTAATGCTAGTTGAGAGTGGTTAGCTTTTGAGTTTTCAAACTTTCCTCAATGATCGATCTTACAAAAGAATCTGATTTATTTCATTGTTGAATATGGTAGGAATGGGATATCAATATGGTTCCATCTGAGCGTGCTAAAGTATTATCGGGTATTGGACAAGTACTGTCAAAGTTTTCAGACCTTGCTGCTTATCACTTTAACATCAGGTTATATGAGAAATTGCTTTTTGGCATACTTGGTGGTCTTGATGACAACCATCCCATTATGGTACATATTTCCTCTAACTTTTGTTTGAGTTGATTTTGCATGCGTTGTTAATTAAGGCTCCTAACCTATGATGATTAGTTTCTTTCCTTTGTATAGGAAGTGGATGACAGTCTGGTCCTTGTCAAATCGACTTGGTCTACTTTAGGAATCACTCCGGAAGTACACAGTGTGATCTATGGGTGGGTCCTTTTCCAGCAGGTACTCTTTGAAGTGACTAGTTGGGCTCATTTTCTTATAACGAACTGCACGATTGTATTCTTCATCAACAAATTAAAAATCTAAACTAAGTTATTTGTTTATGATTTTTCACTACTTAATAACTTCTTTGTTACAGTAGGATAGGTTAGGCATGCCACGTAATAGTTTCTTTTATTCTCGAGCCATTGTTGATTCTTTCTTCTTGACAACCTGTTATTTTTGTTGCAAACCTGCAGGCACAAAATTTGATTATTCTTCTTTGTGATTGTATACGATTTCTTTACATGTCAGTAGAGTTCCATTTTTCTTCAATGGTTCAGGGTTCATGTTGAGATGTTTTGGTTGAAGATGTTAGAGTATTAATCAAAGATTAGACATGTCAAACTATTGATTTAAAATTTTGAGTTTAGTTAGAATCAGAATAAGATCATGTGTTAAAACCTACAATGTTTTTCTTTCTTAATTGTGCTATCCTTGGAGATGTTTATTTTTTATGGTTATATTTAAATTTTAAACATGTTCCATTGCGAAGAAAT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MDSSSLLQRYRRDRQKLLAFLLSSGLIRELRTPAGPVTNFSAVDLDSLSASYVLECIKSGGVIDISTAAKKKLHESCYPTMIQSRSRTTYFLHSHPDLSGSPPRRAPPPIMVERSSSSDISCSSRSIESSIDDNIETSSDDCGPQSNGTTATPSKLGKDFEVPALGLPKLYTGLADGDLDEAAYIILFASMAFSGIEIYSFEDTKKENVIKHSAGVKSKREEVDVQSENFERHLNLLHTISTFADACMRKRLMELAARRNWGKISVPQILLALLHGVFRSDFPSEKSYMQWKLRQVNILEEFCFSANLVASERRICESSLMMIRSTKEWDINMVPSERAKVLSGIGQVLSKFSDLAAYHFNIRLYEKLLFGILGGLDDNHPIMEVDDSLVLVKSTWSTLGITPEVHSVIYGWVLFQQFVKTDEVPFLDNAILELQKVASPKNDDGKEEQYLRSLSCSISCNGNEMKLSLAEAVFFLISSWCDIKLQAYHLHFCKKPSYFGKVVSLLSTVGVVISYDCNAVKLTRLDGLKVSGARKLRTYVERSIEAAYNAAENSVNSESKESTHPLALLANRLRLVAEKEINVFFPVLRQLCPDSGIIAAMLLHQYYGEKLVCFVNSFCKILCFANSGFLLFLCLHILDVYFIKLQKPFLKEVSTLSDDVRSVLPAAYSLDCDLTHLFTSASKESRLSPLLKEDLDHYPIVQIAKPIILDWMIDQLEQTSEWTERAFKLEKPFLKEVSTLSDDVRSVLPAAYSLDCDLTHLFTSASKESRLSPLLKEDLDHYPIVQIAKPIILDWMIDQLEQTSEWTERAFKLEDWEPISFQQNLAASVIEVFRIIEETVDQFFDLNLPMDITHLQALLSIVYHSLDGYLSGLLNQLVEKNCLYPPIPPLTRFVETATTGKKKLPECHLDEHVSRKLNGLTISKLCIKLNTLGYIQKQIGTLEDGIGKSWALLGGSAKHKQAKVEVSTTANGGIGTFNDEANELFATTFNNIKSFTAKSISKFCDFTGIRVIFSDLRDEFLSYLYRGNVEAARLEGFLVHLDVVLNNVCGMIDDTLRDLVVLSICRASMEAFTWVMLSGGPSRAFSDSDIVLIKEDLGILKDFFVADGEGLPRTLVEKEAKFAEEILGLYSLPSETIIQLLMSSSGKISTELDPCSNNGSLQFNDSQALVRVLCHKKDTEASMFLKRKYNLPASSGNFFSPSLRFHIF
BLAST of ClCG00G000280 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L2K3_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G038750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 999.2 bits (2582), Expect = 4.3e-288 Identity = 524/658 (79.64%), Postives = 556/658 (84.50%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L2K3_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G038750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 856.3 bits (2211), Expect = 4.5e-245 Identity = 433/474 (91.35%), Postives = 451/474 (95.15%), Query Frame = 1
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BLAST of ClCG00G000280 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2QUE7_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_003G160900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 597.4 bits (1539), Expect = 3.8e-167 Identity = 345/752 (45.88%), Postives = 465/752 (61.84%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2QUE7_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_003G160900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 511.9 bits (1317), Expect = 2.1e-141 Identity = 277/499 (55.51%), Postives = 354/499 (70.94%), Query Frame = 1
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BLAST of ClCG00G000280 vs. TrEMBL
Match: A0A061G664_THECC (Uncharacterized protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_016195 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 516.9 bits (1330), Expect = 6.5e-143 Identity = 277/473 (58.56%), Postives = 342/473 (72.30%), Query Frame = 1
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BLAST of ClCG00G000280 vs. TAIR10
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BLAST of ClCG00G000280 vs. TAIR10
Match: AT5G06970.1 (AT5G06970.1 Protein of unknown function (DUF810)) HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 3.5e-79 Identity = 176/470 (37.45%), Postives = 261/470 (55.53%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 270.8 bits (691), Expect = 4.1e-72 Identity = 202/655 (30.84%), Postives = 316/655 (48.24%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. TAIR10
Match: AT2G25800.1 (AT2G25800.1 Protein of unknown function (DUF810)) HSP 1 Score: 175.6 bits (444), Expect = 1.8e-43 Identity = 126/481 (26.20%), Postives = 226/481 (46.99%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 102.8 bits (255), Expect = 1.5e-21 Identity = 102/401 (25.44%), Postives = 176/401 (43.89%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. TAIR10
Match: AT2G20010.2 (AT2G20010.2 Protein of unknown function (DUF810)) HSP 1 Score: 174.5 bits (441), Expect = 4.0e-43 Identity = 136/518 (26.25%), Postives = 241/518 (46.53%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 119.0 bits (297), Expect = 2.0e-26 Identity = 116/437 (26.54%), Postives = 195/437 (44.62%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. TAIR10
Match: AT2G33420.1 (AT2G33420.1 Protein of unknown function (DUF810)) HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 1.4e-32 Identity = 131/496 (26.41%), Postives = 218/496 (43.95%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 91.7 bits (226), Expect = 3.4e-18 Identity = 101/408 (24.75%), Postives = 172/408 (42.16%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. NCBI nr
Match: gi|449460507|ref|XP_004147987.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101213131 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1135.9 bits (2937), Expect = 0.0e+00 Identity = 597/738 (80.89%), Postives = 633/738 (85.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. NCBI nr
Match: gi|449460507|ref|XP_004147987.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101213131 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 856.3 bits (2211), Expect = 6.5e-245 Identity = 433/474 (91.35%), Postives = 451/474 (95.15%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 1118.6 bits (2892), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/738 (80.35%), Postives = 623/738 (84.42%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. NCBI nr
Match: gi|659096171|ref|XP_008448959.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490971 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 865.1 bits (2234), Expect = 1.4e-247 Identity = 438/474 (92.41%), Postives = 454/474 (95.78%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 999.2 bits (2582), Expect = 6.2e-288 Identity = 524/658 (79.64%), Postives = 556/658 (84.50%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. NCBI nr
Match: gi|700200820|gb|KGN55953.1| (hypothetical protein Csa_3G038750 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 856.3 bits (2211), Expect = 6.5e-245 Identity = 433/474 (91.35%), Postives = 451/474 (95.15%), Query Frame = 1
HSP 2 Score: 836.6 bits (2160), Expect = 5.3e-239 Identity = 531/1226 (43.31%), Postives = 712/1226 (58.08%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG00G000280 vs. NCBI nr
Match: gi|1009156419|ref|XP_015896237.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107429969 isoform X2 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 628.2 bits (1619), Expect = 2.9e-176 Identity = 362/757 (47.82%), Postives = 468/757 (61.82%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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