Carg26179 (gene) Silver-seed gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGTCTCCTATTCCCAGCCATCTTCACTACAATTCTTCTCTCTCCACTCTCATTCCCAACCTCCATTGGACTCGATGCATCCAGCTCTCCCGCCCAAGAGCTAAGTTTTCTGGGAAAGCTAGGGTTTTAGCTTTCCGGGTAAATCCTAGGGGTCGACGCGGCGTATCCTCTTTTCGTTGCTTCAGCAGTGCGGGGACAGAAGTTCAAAATTTATCGCGCCTGGAAGAAAGTGAACGACCGCCCTTCGATATCAATCTCGCCGTTATTCTTGCCGGTTTCGCGTTTGAAGCATACACCAGCCCCTCTGTAATTGGATTATTCTGCATGCTTCATTTTTTTTGTTGGTTTCGTTTTTTGTAGAATAGGAGAGGGTTAAGAACATGAATTTTAGTGTTTTAAGTGTTGGATGAATTGTTAGTTTGAAAATTTCTGTGATCTTTATTTATATATTTCTCCTGTTTGGTACAGGAAAATTTTGGGAAGCGTGAAGTTGACGCTGCAGGTTGTAAGACTGTATTTCTTTCGGAGTATGTAATCGCTGTAATAAACTTTAAATTGACTACACTGGTGCAGAATGAAGTCTTAGATTCCTTTTTTAATTGCATATACATACTGCAACGGCGGTTCATAATTCTTTTTGCTATTAAGTGTAAATAACTTTCTTGCACTTCATCTTTGGACGTGACAAGTTCTATTCATGAATAAAAATGCAGGTCATTTGTTAGAGAGATATATGATGGTCAACTATTCATAAAATTGAAGAAGGGCATTGATTTTCCTGCAATGGATCTATGGGTAGCTCCTTTTCCCCTTATTATTATCATTTTTTCCCCCCGTAGGAAACTTAAAAAATCAAGGTCTTATAAAAAATTCAATTTTGTATTGGTCTCTCGTCTTTGGAAAACATGATGCTGTTGAAAAAAATGCAAGCTCTTACACCCTTTTACCTTTACCCACAATGACTGAGACTGCTTTATGTAAAAGAGCTTGAGAAAACAATGATCATTTCTTCTTCCATTTCAACCATTTGGGGAATTGTGTTAGTACTTTTAGCTTTCCTCCCTTTTGCTATTGGTTTTAAACCCGAGGCAAAGCTGAAATCGTTTTTGATTGATACCATCTTGGTTGTTCTCTGGGAAGTTTGGAAGGAAAGGAATAGAAATATTTTCTTGAGAAGAGAAGCTCCAAAGACATTTGTGCTGAGGTCTAGTTTAGTGTTCAGTTTGTCTTTTACTGTCCAAAAATTTGTGGCTCTTATCAACAATGAAAGCCGTTGAACTTCAGACTTGCTAGCCCCCGTTTATTATTATTATAATTATTTTAGTTAATATGAATTTGAGGGTACTCTTTATTTTATGTATTAAATTTTCTCTTCTAAAGTTTACATCGTTTCTTTTGGCCTCTTAACACGAAATAAGGCAGTATCCTTACTTATCTCCCTACTGGTGAGGAGTACTATTTTTTAAAAAAGCTCTGAACTTTATACAATCACCACTTTTTATTTTTATTTTTTTTTATCTTATCTTATCTTATTTTATTTTACTGATAAGCCAAACTTTTCATTGATAAAATGGAAAATACAGAATCTTATCAATGATACTAAAAATAAAAAACTAAAATTTAAATTAAACCCAAACTTATAACCAGAGACTGATCTTAAGGATACCTCAAGACACATATCCCTACTAAACAAAGGCACAGTAAATGACAACTGCTAAATCTGGACCAATTAGTACTTGGTCTTCTTTATAGACTTCTAATGCTATATGTTTTTTGCAACTCCTATTTGATAATATTTGTTCCTCAGGGAACCAGCGATCCATATGTGGTGTTTCAATTGGATGGTCAGGTTGTTAAAAGCAAGACAAAATGGGGGTGAGCAATGTATTCAGACTGAAATCCTTCATCTTGTAAAAGTGGTTTTACACATCATTAAAAATATCAAATATTTTTGCCTTAATGAACAAATAACAATTAATGAATTTCACTTGGTCTTCAAGTCTACGAACATGGGTCTTGGAAGAGCTTTGGTAAAGGTTTTTACAATATGAAGCTATGTAGGTGTGCAAATGAGAGGTGCAAACTTTTTCTCTTTAGTGAAATGTCAATCAATTTAATATATTTCATACAATCAAGATGAGCTAGATTTTTGGTTATATTTATAGCAACATGATTACCGTTTTTGAACTGGGAACAAAACTTTGCATATTCGGTCATGTGATATGATGCTCTAACATCAATTCAAGGCTTCAATTATTTTACTAGATGTTAGGCAATAAATGTAGTTCCTTGTGTCAACAACCTTAGTCTCGTCACTGTCTGACGCAGTATCATTTGCATTGTTTCTATCAATATGGAGTTGTCTCTACCTCTCTACCTTCTTTAATTATCAGAGAGGAGCAGTAGAGGTTGTAACTTATATGAGAAAGTACAAATAAACCACCAAAAGCAAAGGGATGACCGGCATTTTCTTGATGGCAGATCTCTATTGAGAACTCGAGGTGAACAAATTCTTCTCTCTACAATAGGAATGAAGGTTGAACTAAATCTAATTGAGTAAAAAATTCAAGCTAGGCTGGAGATCGATGACAACAACAATATGATAGAGATAGTGACCAGGTATCTCATGGTAGTTGAAAACTTGACTTATGAGGTGGTTGGAGAACAAACAACTTGAACTCGTTATGTTGTCAAATGAAGACTAGGGCATAATTGGCAATGCATAGTAGGATCTACACAAATGCATGAAAAATGATGACAAAGATGGTCTAGCATAGGAAAATTCACGAACACGAAGATATTAGAACTTGAAGTGGCAATGAGAACTTCGAGTGGCATATGAATGTAGGCAACAACACCAGAGATTCTAGATAGAAAGAATGCAAAAAAGAGATTTTGTTGCTGTCGATGGAGGTGTCATCAAAAGAAGTTGTGTCGGTGGGGAATGACGATGGCAGCTAGGGTTTCAACAACTAGGTTTATGATCATTATGGTTTTGATGTGATACTATCAAGTTTTTGGAAGAGAATACTATCGAATAACCTGAAGAGCTCTCGAAAGTGCTTTCTCCTCTTTCCTTTGTCTCCCTTCTCATTTAAAAAATCAGCCTTCATCTTGCAGCATCTCTTTTCTTGTGGATTAAGTATTCTCATAAGATTTGTTCTTCCAAATAAGATTTTCTGCTCGTTTTAGTTCTTATTGACCAGCTTACATCTTTTTTCGCTATGTAAGTGAGTAGTTGCTGGGCTATTACTTCGTTCTTCTGTATTTGGTGCGAAGACGAAATTTATTTATTTATTTTTATCTAAGACTCTAAGAACAGGTTTATTAATGTTCCCATTGCTCTGGATCATCTGCGTTGTTTGCTTTGGTTTAAACGCTCGTTAATAGATCTTCTACAACTCCCAATTTTAACAACTTTCTTGCTAGAAGGCTGTGATGATAGAGAAATAATTGGTTGTCCAAATGTAGATATTTTTCAGGATGGTTTGTTGGTTTGTGGAATGCATAGTATACCCAATTTTTGGTGGAAGAAAGATGATTCAGGTTCCTGTGGGCTTTGAGAAAAAGGATGGGTTGTTTTTTGGGAAAAGTTTCAAGGATTTTTTTGAAGAATTATGAGAAAATCACCGAACTTCCCTTGCTTTTGATTAGTAGACAGTTGAGAGAAAATCCTTCTCCAGTAGAAATATGAAGACAGGGAGGATGAACAAACCCTCTATTAGTAGTTATCTAGAGTTAGTAAAAAAGAATTTGAAGGGAAAGCAAAAGTTTGAGAGGTCCGTTGTTGAAACTGCAAATGGACTTTTAAGGAATGCTGTTGTGCAATCTATTTCACATCCTCTTTGGATAAGAAAAGATCATAAGGTGTTTCACCAGAATGTTAGTGAGCTCTTGGTATCTAGACTGTTTACTCCTAATAGTTGGAGGGAGATTAAGGAACTTTGCAAGCACTTTTTAGGGTATCTGTTTTGATTAACCCTTTCATGGCAGACAAGACATTGATGAGAATTGAGGAAGGAATATATCTCCAAACGTCAGATTCTTTTGGGAAATGATGATATATGGAGATTTCCTTTAAAATTAAACAGTGGAGTTTTGACAAACACTCTCATCCAGAAGTTATTGAAGGGTATGGTGGGTGGATCTCCATAAAAACCCACCTTTAACCTATTGGGAACGCAACACTTTCAAAGCCACTGGTGAGTACTTGGGTGGATTGGTCAGTATTTCCTTTAATACTTTAAACTTGCTAAATTTGACTGAGGTTCATATAGAAGATAAAAAGAAATTGTGCGGCTTCTTTCCTTTTTCTATTGAAATCATGTACAATAGAAACATGGACAAGTTGGTGATATTGACTCTATTGGTCTCATATGTCCTCCATCGAGAGCCTTTTTTAAAAGAATTTTCAAATCATTTGGATTTATCACGTTTACATCAGGTAATGGTTGATAACGGGGTTATTTCAACGAACGAGCAGAGTAATAATGTGGCATTAATGTAGAAGTTAATGAACATTGAAATGCCCATTATATACATGATTAGAATTCTCACGGAGTCCTTAGCATGTAAGGTCTGGTCGAACTACTGGTCTCCCTTGTTATCCTAAATGGATTTGATGCTGCCAGCATTGTGGTCTTGAATGGATTAACCGTTTCTCACTCAAGTCCCAAAAGTAATTTAATTGTTAATGGGACTTTTCCCGTTGTTCTGGATCCAGAACCTTCGCCAAGATTTATTCTCTCTCTCTTTTGTAAACCATTAGCATTGAGTACTGAGGATGTTGGAAATTGCATAATGGTCGAATCAGCTTTAAATGTTACAATTTTTGTTGAAGGATTGATTAATGCGGAGCAAAATAATAGTTTTTTCTTCCTTGAATGATGCAGTTTTAACTTGTTTTAGTTGAAGACTTTGATTATTCATTTGCCTGTTGAGGCGTTAAGTCCTGAACATGTTCAGTGCTGAGCGATTTAGTAAAGCCTATC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BLAST of Carg26179 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg26179 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg26179 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg26179 vs. NCBI nr
Match: XP_022994042.1 (uncharacterized protein LOC111489848 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1597.0 bits (4134), Expect = 0.0e+00 Identity = 803/839 (95.71%), Postives = 810/839 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg26179 vs. TAIR10
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BLAST of Carg26179 vs. TAIR10
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BLAST of Carg26179 vs. TAIR10
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BLAST of Carg26179 vs. TAIR10
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BLAST of Carg26179 vs. TAIR10
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BLAST of Carg26179 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Carg26179 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Carg26179 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P19515|LIP_RHIMI (Lipase OS=Rhizomucor miehei OX=4839 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 2.4e-12 Identity = 57/181 (31.49%), Postives = 84/181 (46.41%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P61871|LIP_RHINI (Lipase OS=Rhizopus niveus OX=4844 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 4.1e-12 Identity = 57/188 (30.32%), Postives = 90/188 (47.87%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P61872|LIP_RHIOR (Lipase OS=Rhizopus oryzae OX=64495 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 4.1e-12 Identity = 57/188 (30.32%), Postives = 90/188 (47.87%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CCU0|A0A1S3CCU0_CUCME (uncharacterized protein LOC103499378 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499378 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1369.4 bits (3543), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/836 (83.01%), Postives = 748/836 (89.47%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CE13|A0A1S3CE13_CUCME (uncharacterized protein LOC103499378 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499378 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1163.7 bits (3009), Expect = 0.0e+00 Identity = 587/690 (85.07%), Postives = 628/690 (91.01%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CDA2|A0A1S3CDA2_CUCME (uncharacterized protein LOC103499378 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499378 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1110.9 bits (2872), Expect = 0.0e+00 Identity = 564/663 (85.07%), Postives = 603/663 (90.95%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5FAU0|A0A2P5FAU0_9ROSA (Fungal lipase-like OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_094120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1057.7 bits (2734), Expect = 1.3e-305 Identity = 538/859 (62.63%), Postives = 655/859 (76.25%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26179 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5AGY5|A0A2P5AGY5_PARAD (Fungal lipase-like OS=Parasponia andersonii OX=3476 GN=PanWU01x14_333220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1055.8 bits (2729), Expect = 5.0e-305 Identity = 545/879 (62.00%), Postives = 661/879 (75.20%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of silver-seed gourd
Date Performed: 2019-03-07
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |