Carg25674 (gene) Silver-seed gourd

NameCarg25674
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma (Silver-seed gourd)
DescriptionUnknown protein
LocationCucurbita_argyrosperma_scaffold_291 : 68068 .. 76666 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
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ATGAGTGAAAAAGAGATGTAAGTTTGTTATGTGTAAACAGAGCGTGTTTCTCTGTAATTACTTCTTTACAGTTTAAAACAGACTTGAATGGAAGTGCTTGCCTGTGTTCTATATGGCATCTAGTATGAACTGTCAATCGAGGTTTTCAGTTCTACTTCTCAATCGAGGTGGGATCTCACAATCCACTCCCTTCGGGGCCAACGTCCTTGTTGGCACTTGTTCCCTTCTCTAATCGATGTGGGACGTTCTTGCTGGTACACCACCTCATGTCCACCCCGGCACCCCCTTTGAACTTAGCCTCTTCACAAACACACTCTGATATCATTGGTAACATTTCAAGTTTACCACTATCAGATATTGTCCTCTTTATACTTTTCCTTCTGAGCTTTTCAGGTTTGTCTCCTCGAGAAAGGTTTACCCAACCTAGAGAAAGATGGAAACAAGTACGCTGGAGGGAACAGCTATGGTGGCTTACTTAGGCCTGCTTTTTTTTTTCCTTTTTCTGGAATTAGTAGTCACTAAACCCAAGTATATTCTGAGGCTCTAATACCAATTGACGTAAAGTTAATAGCTCTTTGTACTGGAATTGCTATTGTTGAGTTCTTTTTACTTTCTACGTCATGAGGTTTCTAGACACGATGAGAATGAAGAGCAAATTAGAGAAATTTTGAGATGTACTCTTTTTTAAGGTTAGAAGTTGAAATCTATATCCTTACATTTATTGTACTAAAAAAAATAATATTTTTATAAAATTGAAATCTCAACAACCTAATTGAATCCAAAGCTTGGGCAACCATGGGGTTATTATTTGTTGTAGGATTACATTTGAAAAGTATGCAAAAGATTGCACATGAAATGGGGGGGAAATGCTGTAGGACCCCACCACGAACCTATGTGATTCTCTACCAATGTACCAAAAGATATCAAAAGATGGAAAAGCGAAGCATTAATGCTACCTACCAAAGCTCCTTAATATTTTCATCTAAGATTTTGAATGTCATTCCAGCCAAAGCGAAGCATTAAGCCTTCAGGTCCTTCTACTTTATCATTATTTCATTTTCTTGTGGGCTTAGAAGGTTGTAGAAGGCCCAAGAAGTGAAAATATATAAATAACAAAAGATAGATTAGTTCTTCCCTTAGCTAGTGCATTATTTTTTAAACTTTGAAGGATGATGATATCGGATCATATGACTGTTAATTTCTTTTTTCTCCAATCGCTGTTAGAACTCTTGTTTTATCAAACTTGGGTGAATGAGGATGATATGCTTCTCTACTTAGTTTTCAGTTGGTTGTTTGTGAACATTTTGTTTCTCAATTCTTCAAGAGAAACTGATATTTTCTATGCAACCAGGTTTCTCAATTTCGAAGGAAATTGGTGACTGTTAAGGCCATTCTTTGAGAGATTAAAATAGAAAAAGAATATTTTAAAAAGATCTTCGAGGATAAAACTAGAGAAATTAAAGATGTATGGAAAGGGCACTCCACCAATTCCTTCGAAAGACTGACCCTCCATTAATTTAATTAGTGGCTCGTCAAGTTCATTTTGGTTAAGTATATAGAGAAATTAACCCTCAATGCAGCAGCAGATAATTGGTTAAGCATATAGCGTGAGTCTGTGTCATGTTGGGTTTAGTGCTTCGGTTTAAGTCGCCGCCGTCGGAAATGCAGAGAATTAATTGAATAAGACTAAAAATGCTTATAAATTTTAGATTTATAGTGAAACTTCCTAAGTTTCATTACTCATGACAACCAGTTGGTACAAGTATGGAAAATTGAGTTCAGTTGAAGCTATGAATATGTAGATGCAGAGATACCTTGGGTAAACAAAGATTACTGCCTCTGAACTATCAATATCTTATAAAAAAATGATAAGGACACAGTCTTTTCCTGGATTTATCATATATGTAATGCTGTATTACACTACACAATTGATATCTACATCTACTGTCCTTCATTGTTTCTCACCCCTTCCCAAATTTACTTGATAAATCCGTATTTTATTTGACACCTTCTTTAATCAAATTTGAATCATTCTGCAGTTACCTTGTTATAACCTATACTCTAAGGAGAAAAGGCGCAGAATATACTTGTACACCTACAGTTCAAGTGTGGGAGGCATCATGACAAGGGTTTAGCCTTTTTGAATATTCTTTGACCTGGAGCAAGTATTGCCAACGGGTCATAAGCCATTTTTCTCTCTACATATGTTTCCCACATTGGCCCAAAATGGGCCTGCCATTCTTTCCTTGTAGTGTAATGTGGACAAAATACTTATAGTTTTGCTCCTAAATTGGTGTTTATAACAGTAATTCCAGATATTCTCGAATAGTTGTTCTGTTAAGCTTAAATGTATTGGCTAAGTCATGTCGTATTCCTCTAGAAACTCGGACTGCAGGAAAGGTCAGGAAAATGGCAACCAGGTACGCAAAGATAACTCTCTCCTCTGGGAATAAACTAACGGATTGTGTCTACCAATTAGTCTCCAACCTGGAAAAACTCAGTATACAATTAATAGAATCAGTATATTCAAATGAATAATAACTATATAATAAATAATAGCAAATATTGGCCAAAGCACAGTTTAACAATTGTTACGCATCATTAATTACTTCTGATTTGTTAAAAACACGGTAGAATTAGGACTGCGGCCGATTATGCTTGTTCACTTCAGGATATTGCCAAAAAAACCCATCGCAAATTCCTGTGTATTATTATCTTAGCTTTAGGGGATAAGTATACAATTACAGACCCATGGGTGTGGGACTTCCCACAACCCTTTTGACTGTAATTTCACGGCTGATACTTGAACTCTGTCCAGGAATTCCACGTATGTAACTTCTGATATGAAAAGCGTTGATGGGATATAACTCAACCGAGACAACAACCGCTTGACTTCCTGCATGGTAAAAGCATGTTCATGTAGCTGCCATTTATTTTCACATTTTTCACATTTTACATTTTTCACATTTTTCACATTTTTCACATTTTCCATTAGATTTATTTAGTAGGGATACTTCACCTGATCGACATTGTTGTTGTCCTTGTTGTGGTGAAAGTACTTTGCCAATTCTAGGCAGTAAAGAATTTTTCCTTCAGACTTGAACTGGCTTGCTTGAACAGGGTCTTGTGGATCGAATGATGATCTCCAATTATTTAGAAGACCAGTTCTGTTTATTATCACGAATCCTTCAATATAATCGAATGTATTTTCTCCAGATATTAACAGCTCCTGCTCTCTGGTAAATGTTGTGAAGTCAAAGTACAATACTCTTATCCATTTTACCTGTCAAGGATAGAAGAATTGGGTTAGAACAGCCCTTCATAGTTACTTTAGACTAGATTCAAAGTTCCTTTAGAACACTAATCTTACCATAGTTGGCGCTGGTTCAAGTAGAATTTTTGCCCGTGTGATAATTCCAAATTGGCCTAACCCTCCAAGAACACTGTAAAAGAGGTCACTGTTCTGTTCCTCTGAGCAGTTTACCACGTCCCCTTTTCCTGAAGTCAGTTTCACTCCATTTGTCAGTTACCATAACAATATAGCATCCAGGAAATGGCGTTCGCCATTTACCTTGCATAGATTTCCTATCACATTACTTTTGTATATGTATAGCATGATGTATATGGCAACGAACCTGTTACAACCTCCAGCTGATGAACGTTGCTGATCTGAGGGCCATGTCGAAATGCCTGTCCACTGATCCCTGCATTGGATAAAGTACCCCCAACCGTTAGATGTAGGTAGTCTGTCCATGATTTTGGTGTTAGTCCATATTTCAAGCTCTCCTGCAGGATATTTATCCATAACTCCCCTCCAGAAACATCGATGTATTTGAAGCTTCTGGTATGAACAACCTGCATTTGAGGGCCCTGGAGTGATTCCATGTTAATCACGACTCCTTGGTGGGCCTGTGCTTGGCCATGAAGTGAGTGGCCATGGCCTCTAGCTGCAACTGTGAGCTCTGAACCAGGTCCCATCTTCCAAATATGCTTTATTGTCATGGCGATATCAGAAACTGACGATGGATGCAGTATTGCTGCAGGGTAGTATTGATATCTATTACCAAAATCTCTTGCAGCAAATTCCACTTTGTCAAATTCAAAATGGCCGTTGATGTAAAGCATTCTTAGCGAAAAAGGGATGCCTGTGAAGCATAGATTCATCCTAACAGTAATACAGCTCAGGAACAAAATCATGAAGCTTCGAATCAAAAGCATGTTGGTTTGTTTGAGGAAACTAACTGGTGGGTATCGTAATTTTCTCTGGCTACAAGTCTCTGAAGTTAAAGATGAAAGGATTGGTAACATGTTTTTGTTATTTCTAAAGAGGAGAAAAAGGCAGAGGAGGTGTAGGAGGGCCTAGAAAAGGCTGAATTGGAGGTGGTTTTAAAGGGAGGTTAAGATCATAGTGGCCGAGTCAACTAGACTTCAGTTAGGAGAATACGTATGAAGACTGCCTACTTAGGGAAGAGTTAGGAGAAATCGTTGCACTTTTTTAAACAGTTAAGCTTTTCCCACGAAAGACAAACAGGTTCTCATTAACCTTGTTAAGGATTGTTTCCCATTTTTAGAAAAGGAAAAAAAGGCAAGGCAAGGCCTTGGCCGGAAAACGTATTCCTCTGCCTTTTCTCTGACTGGTAATGCATATGCTTGTGTCTCACTGACATTAATGATGAGGCTACTCTAATCCTTGAATCCTATTATTGTCGGAATTTAACATTGCGTATCTAGTTTCAGATTCAGTCAGAGGAGAGTGGCCCATGTTGATTCATTGGAGACGAAGACAGAAGGATCAGAGGGTCACCAGAGGGTCCATCATACACGTGATATTTAACTGCCTGCATGCTTTTTAGGGAGAAGAGATATGATGGGGATTGTGTCGGGGCCACTCTTACGGGTTAAGCAAGGGGAAAGGAGAGCGAACATGGGGCTGACACCTTCTTGGTGGAACTCAACACCACTCTTACACCTATCCACTTCCACAGGTTTGAAAGATTCGA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mRNA sequence

ATGAGTGAAAAAGAGATATATTCTCGAATAGTTGTTCTGTTAAGCTTAAATGTATTGGCTAAGTCATGTCGTATTCCTCTAGAAACTCGGACTGCAGGAAAGGTCAGGAAAATGGCAACCAGATTCAGTCAGAGGAGAGTGGCCCATGTTGATTCATTGGAGACGAAGACAGAAGGATCAGAGGGTCACCAGAGGGTCCATCATACACGGAGAAGAGATATGATGGGGATTGTGTCGGGGCCACTCTTACGGGTTAAGCAAGGGGAAAGGAGAGCGAACATGGGGCTGACACCTTCTTGGTGGAACTCAACACCACTCTTACACCTATCCACTTCCACAGGTCAAAAAGTCAGTTCCCCTCTGCCTGCATCTAAGTGGTGTATTCAACCACATTAAACTTGCTTCTTCAGTCTATAGGATCTCGTGTTTGAAGATCTTCTTCGTGCCTTTTGGATTGGATTAACTATGGGGGAAAATAAGTGAGTTTCACATTCTCAACAGTCAATATAGGTAAATATGGTTGCTTAGAAATCGAAGCTTAAAAACATGTTTTTAGAGTTCAACATTTGAGGGTAGTGATTCAAACTTCTGCTCTGTAAACTCGTTCATGTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTGTTCCCTAT

Coding sequence (CDS)

ATGAGTGAAAAAGAGATATATTCTCGAATAGTTGTTCTGTTAAGCTTAAATGTATTGGCTAAGTCATGTCGTATTCCTCTAGAAACTCGGACTGCAGGAAAGGTCAGGAAAATGGCAACCAGATTCAGTCAGAGGAGAGTGGCCCATGTTGATTCATTGGAGACGAAGACAGAAGGATCAGAGGGTCACCAGAGGGTCCATCATACACGGAGAAGAGATATGATGGGGATTGTGTCGGGGCCACTCTTACGGGTTAAGCAAGGGGAAAGGAGAGCGAACATGGGGCTGACACCTTCTTGGTGGAACTCAACACCACTCTTACACCTATCCACTTCCACAGGTCAAAAAGTCAGTTCCCCTCTGCCTGCATCTAAGTGGTGTATTCAACCACATTAA

Protein sequence

MSEKEIYSRIVVLLSLNVLAKSCRIPLETRTAGKVRKMATRFSQRRVAHVDSLETKTEGSEGHQRVHHTRRRDMMGIVSGPLLRVKQGERRANMGLTPSWWNSTPLLHLSTSTGQKVSSPLPASKWCIQPH
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Carg25674-RACarg25674-RAmRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of silver-seed gourd
Date Performed: 2019-03-07
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 111..131