Carg23420 (gene) Silver-seed gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAATAGCCATCATCTAAATGATCGAAATACCGTCCACGCCCAGCTGCTCTGCTGATTCAATCGCTTCCCGCCGATCTCTTTGGTATTCTGTCCGATTCGTAGTTCTTCATTAATCCGGTCTTACAGAGGTCAAGAGTTCGGTCGTTCTTACGAGGAGTTCTTCTCTCTTTCTCTAATGATTCGTTCTCAATTCCTTCAGCTGGCATTTCTGACCCAACTTGATTCGGAGATGCATAGTTACGCCCAGATCGCCATATGTTTCGCGAATCTCTCGATATTCTGAGCAGCAAGAGTTGGAAGTGTATGTTGAGATGTACCATAAAGCTGGGCGGGAAGGTGGGTTCGAGAGAGAGATTAGGAAGCATATGCTATGAGGTAAGAGAACACTGGACTCAATATGGCGGATATACTGTGCCATTGTACGCACGTCTCATGTGCCCTTATGTGACTAGGTGCTTTATCCGTGCGTGGTCGGCACTAGTATATCACTCTTCAGAGGAGTGAGATAGTCGCTGTGCATTGCTATGTTGAGGTGAACTGTGCTTCGTGTCATGTTCTGGACGTTCTTTCAGCTGCTGTGTGGTTTAGCGGTTGATTCCTCAAATCCGTCATGTTGCATATCAGTAGCATGTCAGGTGCCGTTTCTACAACATCGATTCTTTTCTTTTTCAAACTTATGGTTTCGGAGTTGCACTCGAATAGATAGATGCTTATGTCATTGTATGTGACACATTGCATCTCCTGAGATTAAGCCTTTGTCATATAGTGTTATGTGCACGTCACAGTTGTGAACTGACTATATGTGCCAGCATAACTGGTAAAATATTAACTGTTTCTGCACTATATCTTATCTATGTTCTGCTGGATTTGAGGTGTACTATTCAACTGCACGCACGACATATACTTATGTCATGTGAGTTTAAACAAATTACCCACTTTCCTCTGTATTGACCATTTTCCACTGTGTATGATTTCGGTTTCCAGTGAAAATTAAGAATCCCCTGTATGCTCTTGAACTTTGATCTGAAGTACGGAGTTATTGCATCTCATTGAATATTCGTTCACCGCAGTATTTATCTTATCCATAGAAATCACGCCACTATTGAATCGCATTTTCAAGCATTAGAGCATGAGAATCTTACTAACACTTTTGCCTATCTCTGGTTACCAGTTAGATGATATGTAGATGAATTGCTATGATTGAGTGGTCATTCAATATAAAGTTTGGAGAACTCATATGTGAGAGTGAGTGTAGCCGTAAGATACTATATTGCTTAATCAAGCATTAAGTAGTGTGATTTGAGCTTTCCTTTCATGTAGTGAGTACTGATATGCCTATTTCTCGATCGTACACATGATCACACGCAAACTGACTGGATTTAAAGCGCTTATGTTAGTCTAACATGAGCTACTGTGAATTTTTATCATAATATTTTCCTTGAATTCTATTATCGTTAGTTTATCATTGTAGTAAACTTGGATAGAGTTATTAACCATTTGATTTCCATGGTTCGTGATGTCGGTCACGATAAAAATTTAACCTGCTAGAAATACACCTTACACAATTCTGCTCAGTAAGAGATGCGTTTTTAGTCTTGAGACCACTCATATTACAACTAGTAACTTTCTGTAAGTTTTTTGGATAGACAGCTCCTGATGGTGTTGTCTTATGGCAAATTAGTTTCGCTTATTAGCTGCTCCTCCTATCTCTTCGCCACTCGCATGTGTTGAAATTGAGAGATTGACTATTGAAAGAGATCCTGTTGTGTTCTATCCAATAATTGGATATATTGCGATATCTGTACTGGAGGTTGAAATAGGGAGGTTAAGATGACAGAATTTTTGATGGTAGAGTCTATCTTAGGTCCTCGTTAGATGTTGCAGTGAGAGCCTATCCATCTAATGTGATTTAAACTGGAAGGATGTGGCATCGAACCTTAGAATTGTTTGTGAGGTGAACGAGTGTACTTAGTTTTCTCAGGGGGGTCTTTTGTGTATGGTTCCTTTGAGCACATCACCTTGGGGCTCCTTGGTGGAGCTGAAACCAACAAGGGTTTGCTTTTGTAAATTGTTAGTATTAATACGACATGGAAAGTCTTTTTATGATTGTATTCTATGGGAGGAAGTTTCCTTGTTCCCTGTTGTCGCATTGATATAATTCTCGATCACTTCCCATCAAAGAGAGAAAAGAAGGAAAAACCATTTCCTCCATGGTTGACGTGCTTTCTACTGTTTTCACTTAGAAATTTTATATTTTTAAAGTTCAAACTGATCTCTTTTCTCATACTTCTTTATTACTCGGATTCGTTGAAAAAATGTTTTGAATGGTAAATCGTATCTTGCATTTAATTAGTGTCTATCCCTGGGTTGGGTATTGACTTAAAATTTTATAATTTAGAATGAGAATGTATCAATAAAGTTTTTGTAAGAGTGTGAGTTCAACTATAGTGAAATGTTGTTGAGCAATTGGATTGCGTATCTTCTTGTAGCATGAGGGTTAACTGAGAGTAAATGACACCGAATAGCTGATGCCACGCGATAGATAGAGTCTCTAGGAACGCTAATTAAACTTATGATCTCTAACGTGAGACACATCGAAAGAAATAGTTGGATTTCGGACCTCAAGTACTGATTTTATATGTTGTTGAGCATATCAGGATCGCTACTGAGGTTCTTGATTAAGTGTGCATTTTTTGATTACTCATAGATCTCGCAGTTGAAAGTTGATAACTAGGTCACTTGAAAATAATTGTAGTGTTTGGCATTAACCATAATAGCAGTGGGTGATATAATCACTATGAGTCTTGACACCTGAAGCGCACACCTTAATTTTTTAATTTTTTGATTGGAGGAGAGAGACAATCAAAATAATATACCACATGGAATGTCAATCAGCAAGCATTTATGTACGAGGACCACTTTTGATGGTAGATGAATTGTTTAACAAGACAAATTTAAGAACATTGCAATAATAATACCTATCTACGGTTCATCTGATATCCTTATAATAACTCTTCTATCCGAACGGTCGTAGTTAACTAGAGCTCAAGTAACACAAATAAGAAAACAAATTATTTTTTATTTAACTAGCAGTGTACACTCAGATTTAGCTATCACGTTAGTTCGATTCATATTGTTATTTTTTGATGTATCTATTATAGATTAAATCGATGGACGAGTTGTTGGTTTAAATGAGTTCTATGAGCAATGGACACAAAAAATTTAAAATTGCTATGAATTTTTGGATGGAACAGATTTTTACTTCAAGATATTCTGCCTAATGAATAACTGATAGTTCTTGTTGCTTTGTTTTCTCCTCCTGTTATTTGTTCTTTTGGTTATCCTATGGAGGAAATTCTTTTTCTTATTTTATTTCGTTTTCACTTCCCATCATGTATTTTTGCGTTATTTATTTTATTCGGTTTTTTCCAGGGATATTCAGAAGGCTACAGAGGAAGAGCTGCTATTCCACCACACTCCATCTTGTGCACTATATTGGGGCGAGTGATCAATGACTTGGCTCTATCATATCGATTGCGCAATTTCCAAATTTCTATATTGTATTAGCAATATTCACTATGCAATACAGTAGAGGAAATCCGAAAACTCAATGGATTTTGCAATAGGAAAGTTAGCGAAGAACTGTGTTCTGGATGTGTATCAAGGTCTTCCCTGCACTCTGAGTTCGTACTGTATTGTATTATGTCACACTACTGAGTGATACTGATAATACATGTTCTGACTATAGATCGGCACCTATAGTGAGGGTGCTCTTTGCATTTTGCAATATTGCTGCCTTCACGGTTTCTGCATAATGCAGTGGATTACTGAGGAGATCTACCGTTGAAATTTTTCATGTATACACAGATCCAATAGAGGATTGTGAATTGTATTCTGAAGAGAAGGAGTATCGCTTCGCTAAGACATACTTCCTTACCTCTATACTAATATAGAAAACTGTTTGGTCCTACTTCACTCTCAAAGAACACCGGCTAATGCGAGACAGTGACACCTATATGTATTTGAAGGTAAAGTCCTATTGACGTAAGCTTAGTTCACCACAACTCTAAAAATTATGTGTGGGAGAGGATGATTTGAGGGATATTCTTTGTTGGTCTACCGCCAAGAGTTCTCCAAATATGCAGGCTACACTTATTTACTTCATATAAATAGACTGCTTTAAAGCTCTCAAATTGAATGTGTATCCTGCATATTGCTCTCAATCGACTAAGCGGCCACTTGTCTTGATGGGGGCTTCGTACTAATTCGCTAATGTGTATACATCTGGTGAAACTAGCAAAGATAATGTTTCCATAAACAGGTTTACATATAATGATAGCGAGATCTCTATCCCCTTATATTCCGAGACTTATCGTGAGTATGGAAAAATCTAGTGACTATTTCTCGGGCTGATAATGTGTTGTTGTGAAGTGGTCCAGTGATATCGATACTAGATAGGATTACCGTTTTCGTTGTTCAACAACAGAAGTAAGACCGCGTGAGTAGTAAGTCAGGAACGCGGAGCTTGGACCTAGTGCAAGAATAGGAACCGTGTAATTTATAATAGTGTGCTCAGCCATGGGCAGTATAATGATGCTGGAGTATTGTAATTTGATGAGATTGCTATACATGACTTCAGGGCATTCCTGATCAGGTGGCACCAAAAGGTTAAATTGGTTTGTGCGAGACTTGATCTGTGGATGTATTTTCAGGACCCCAGCATTTAGTAATCCTCAATGGATTATTTCTTAATACTTTGTGTAAACTTGTGTGTAGAGAATTTAAAATAAGTAGATGACTTCACAATAGTTCTACACGAGCCAAATATTGGATGTGTAGGAATTGACTATCGATGAAGATGAAGTTTGCTCTAGAAACCGATGTACACATTCTTACCTACAGTGTCAGTAGAGTGGTCTCGCGCTAATACGTCTATTTATGAGTACCTGTAATGATTGCGCCACTTTGACTTATTCTTTACGAATATACATTCT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MLFMFESTMAKSRLKTLSELRRVRVDTQTLMVHRCGKWVKLPGTELLPGDVVSVGRDSGRSGEDKSVPADMLILAGSAIVNEAILTGESTPQWKVSISGRGIEEKLSAKRDKSHMLFGGTKILQHTPDKTFPLRTPDGGCLAVVLRTGFETSQGKLMRTILFSTERVTANSWESGLFIMFLVVFAVIAAGYVLVKGLEDPTRSKYKLFLSCSLIITSVIPPELPMELSIAVNTSLIALARRGIFCTEPFRIPFAGKVDICCFDKTGTLTSDDMEFRGVVGVSDKEDLETDMTSVSLRTVEILASCHALVFVDNKLVGDPLEKAALKGVDWAYKSDEKAIPRKGSGHAVQIVQRHHFASHLKRMAVVVRLQEEFLAFVKGAPETIQERLTDIPSFYVETYKKYTRQGSRVLALAYKSLPDMTVSEARALDRDVVESDLTFAGFAVFNCPIRADSATILSELKGSSHDLVMITGDQALTACHVASQVHITSKQILILNSKKGTEEYEWLSPDELQTVPYREKEVGDLSEMYDLCIGGDCIEMLQRTFTVLDVIPYVKVFARVAPEQKELILTTFKTVGRMTLMCGDGTNDVGALKQAHVGIALLNAVPPQSGNSSSEASKDDAARSAKSKKSKLSSESSGKPLLAGEGSSKSKGSAKLDSATEQASNRARTPAEMQRQKLKKLMDELNEEGDGRSAPIVKLGDASMASPFTAKHASVAPTTDIIRQGRSTLVTTLQMFKILGLNCLATAYVLSVMYLDGVKLGDVQATISGVFTAAFFLFISHARPLPTLSAERPHPHIFCSYVLLSLLGQFAIHLFFLMSSVKEAEKHMPDECIEPDSDFHPNLVNTVSYMVSMMLQVATFAVNYMGHPFNQSVSENKPFLYALLAAVGFFTVITSDLFRDLNDWLKLVPLPAGLRDKLLAWALLMFLCCYSWERLLRWMFPGKIPAWRKRQRLAAANLEKKKQL
BLAST of Carg23420 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg23420 vs. NCBI nr
Match: XP_022946270.1 (probable manganese-transporting ATPase PDR2 isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1833.9 bits (4749), Expect = 0.0e+00 Identity = 955/964 (99.07%), Postives = 956/964 (99.17%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. NCBI nr
Match: XP_023545960.1 (probable manganese-transporting ATPase PDR2 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023545961.1 probable manganese-transporting ATPase PDR2 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1833.5 bits (4748), Expect = 0.0e+00 Identity = 958/964 (99.38%), Postives = 959/964 (99.48%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. NCBI nr
Match: XP_023545963.1 (probable manganese-transporting ATPase PDR2 isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023545964.1 probable manganese-transporting ATPase PDR2 isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1833.5 bits (4748), Expect = 0.0e+00 Identity = 958/964 (99.38%), Postives = 959/964 (99.48%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. NCBI nr
Match: XP_022999108.1 (probable manganese-transporting ATPase PDR2 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022999109.1 probable manganese-transporting ATPase PDR2 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1803.1 bits (4669), Expect = 0.0e+00 Identity = 951/965 (98.55%), Postives = 954/965 (98.86%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TAIR10
Match: AT5G23630.1 (phosphate deficiency response 2) HSP 1 Score: 1465.7 bits (3793), Expect = 0.0e+00 Identity = 758/966 (78.47%), Postives = 840/966 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TAIR10
Match: AT4G37640.1 (calcium ATPase 2) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 6.9e-22 Identity = 146/623 (23.43%), Postives = 233/623 (37.40%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TAIR10
Match: AT2G22950.1 (Cation transporter/ E1-E2 ATPase family protein) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 1.5e-21 Identity = 144/622 (23.15%), Postives = 238/622 (38.26%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TAIR10
Match: AT1G27770.1 (autoinhibited Ca2+-ATPase 1) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 2.6e-21 Identity = 145/608 (23.85%), Postives = 232/608 (38.16%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TAIR10
Match: AT1G07670.1 (endomembrane-type CA-ATPase 4) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 2.7e-18 Identity = 159/687 (23.14%), Postives = 270/687 (39.30%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9LT02|PDR2_ARATH (Probable manganese-transporting ATPase PDR2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDR2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1465.7 bits (3793), Expect = 0.0e+00 Identity = 758/966 (78.47%), Postives = 840/966 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9HD20|AT131_HUMAN (Manganese-transporting ATPase 13A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATP13A1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 744.2 bits (1920), Expect = 1.8e-213 Identity = 423/946 (44.71%), Postives = 603/946 (63.74%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9EPE9|AT131_MOUSE (Manganese-transporting ATPase 13A1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Atp13a1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 738.0 bits (1904), Expect = 1.3e-211 Identity = 416/929 (44.78%), Postives = 595/929 (64.05%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P90747|AT131_CAEEL (Probable manganese-transporting ATPase catp-8 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=catp-8 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 723.0 bits (1865), Expect = 4.4e-207 Identity = 422/965 (43.73%), Postives = 589/965 (61.04%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P39986|ATC6_YEAST (Manganese-transporting ATPase 1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SPF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 684.5 bits (1765), Expect = 1.7e-195 Identity = 420/984 (42.68%), Postives = 593/984 (60.26%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C1S0|A0A1S3C1S0_CUCME (Cation-transporting ATPase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495641 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1741.9 bits (4510), Expect = 0.0e+00 Identity = 906/965 (93.89%), Postives = 926/965 (95.96%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0LFL6|A0A0A0LFL6_CUCSA (Cation-transporting ATPase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G013310 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1732.2 bits (4485), Expect = 0.0e+00 Identity = 891/965 (92.33%), Postives = 912/965 (94.51%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TrEMBL
Match: tr|B9RHM6|B9RHM6_RICCO (Cation-transporting ATPase OS=Ricinus communis OX=3988 GN=RCOM_1761870 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1609.7 bits (4167), Expect = 0.0e+00 Identity = 819/966 (84.78%), Postives = 877/966 (90.79%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4DPJ8|A0A2I4DPJ8_9ROSI (Cation-transporting ATPase OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108982215 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1606.3 bits (4158), Expect = 0.0e+00 Identity = 824/964 (85.48%), Postives = 880/964 (91.29%), Query Frame = 0
BLAST of Carg23420 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A067L3Z2|A0A067L3Z2_JATCU (Cation-transporting ATPase OS=Jatropha curcas OX=180498 GN=JCGZ_05130 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1600.1 bits (4142), Expect = 0.0e+00 Identity = 811/966 (83.95%), Postives = 879/966 (90.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of silver-seed gourd
Date Performed: 2019-03-07
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene:
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