Carg05585 (gene) Silver-seed gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGATAACCCAAACCCTCTCATCGTCTCTCCTTCTTCACGTCGTCTCCTCCGACCTTTCAGCAGCTTAGTGTCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCTCTCTCCGGTCTACTGGTGTCGCCGGAGCTCCCTCCGGGTTTGCGCTGATTTTATACTCTCCTATTGTTACTGCAATTCTCCCAATCTCCATGTATGTCTTTTTTTCTCACTTGAAAATATAAATTAGGATTGTCTAACGAAAGCATGGATGATTCTTTTTCCTTACATAGATTAGTAGCTGAATAGGAGGGAGGGGACGGGGAGCAGCCTTGTGGAAAACTGAGGCTTTTCGTTAATTGAGGCTTTAATCATCCGTATATCTCTTTGGTCTCCGCTGAATTTTTTTTTGTTTATGGGACCAAGAATTTTCCAGCGTCTCCCTTCTTTACTTAGCAGAGAATCCTTTAGGAATCTATCGCATTATCCAATTCTCTTTAAGTCCTTATCTTGTAGGAGTTTGATTCACCGAACAACCTCAAACCATATTTGTATTAGTAGATTATAGTTGGAAAGAATACAATGTCTGTTTTGAAAATTAAAATTATCTTCGTCAGATTTACCAATACAATCATCAACGAGACTTTGAATTTATTGGAAGCAAAAGTCGTCTATATGCGTTCTACTTCATGTTAAGTCATTGGGGAGCTCAAAATAAATTAATTGAGTACTCATTGAATCTTTTGGTTGGGAGGCTTGTTAATTATGTTGGATGAGAGCAAGGTGAAGGTTTTAGAAGTGTTAAAAGGTGGCATTTCCTCCCGGTAAAGTATCTTTTCAACAAAATAAAGTTTGTTGGATTTCAAATTTATATGGGTCCAAAGGTTTACAGCAAATGAGAGAACGGAAGATGTTTGGAGTGAGTTGAGATCTCTTCATTCATATTGTGAAGATTCATGGTGTGTAGGGGGTGATGAATATAATCCGTTGGGTTCATGAGCGGCTCCCAATTGGAAGACAGACTAAAGGTATGAGAGAGTTTAATAAAATTATTGATGTCTTGGTTTGATGGAAATTCGTCTGTCCAATTATAATTCACATGGATTAGGAAGGTGATGGGCTTCACTCTTTGTTATATCGTTTTTTTTTAATCTCAAAAGAACGGGATGTCATGTTTGAGAATTCAAAAGCGTCAAAACTGGACCTATTGCTTGGGATACCTCTTTGAAGCTTCGTTTTCCTAAGCTTTTTGCTATGTCTGCTTGCTTGGTTTTGGATTTATGGGATTCTCATTTTCCATCATGGTCTCTAGTTTTTTGAAGGCTTTTGAAAGATGTTAATTCATTACTTTGCATCATATTTTGGGTCTTTTGAACACTATTAAAGTTGGTTCTATTGAAGATTCACGATCATGGTCATTAGACTCTTTTGGTATTTTTTTCTATGAAATCTTTATCAAAGAACTTGCTTCTACATCTCCTATCCAAAAGGATCTGTTTCGAGCCATCTGGAAGACTAATAATCCTAGAGAATTAATATTCCGCTTTGGATTATTACTAATGACTATCTTAATCTTTTTGAAATCTTTTCAATTGGGTTTTCTCAAGTGTGTTAAAAGGGTAACATTCTACAGCTGGTTGTTGGTCATTTGCCCACAAAACTGAAGTGGCTAAATGTGGTTAATGCTCTATTATCAGAATTGTGGTTGGAAAGGAACCATAGTTATTTATTTATTTTTTTATTTTTTATGACAAGCATCTTCCATTGTTTGATTGGTGTTTAAATTTTGCACGATTAAAGGCTACCTCACAGTGTTCTTTTTCCAAGCCTTTTGCTGATTTTTATTTATATGACATTTGTTTAAATTGGAACGCATTTATTTTTCCTTTGTTATTTCTTTTGTTTATTGTTTTTCTCTATTCACTCCTTCGTGGAGTTTGTATCTTTTTAGCATAAGTTTCTTTTCATTTCTTCAATAAAAAGTTTCCTTTGTTGGTAAAAAGAAACCTTCTTAGGTATGTGGACATATGGAGGATTGAGGTCCTTAGCGTCTGGGAGTTGAAAGGCAAGGCTAATATCTTATGGAAGTTTGCTTCTCGTGCAACCTTATGGGGAATTTGGCTAGAATCAAATAGGAGAACTTTTAAACATTAGTTGACAGTTTTTTCTACTTTTTGGAATATTGTACAACTCAATGCTTCTGGGTGGTATCACAACTATAGCAAATTCTCTGCTAATTACCCCTTTTCTGATCCTTCTAGATTGGCGAGCCTTTTTGTAGGTAGCTTTTTTGGGAGGAGGGGAGCCCTCTTCCCTCACACCCTAGGCTGTCTTTTGGTTTTTCTATTGCTCAATATATTTTCCAGGTTTCTTATATAAAAAAAGAAAAGAAGAAGAGAAAAAGAGATTGAGTACTCATTACCTACATTTTATGTTAAAGTGTCTATAGATACATTTTTGGGTTGGGTCAAGGGTTAAGGTGAGCGGTTTGAGGTTTAAGGTTTACGGTAAGAGTAGATATGCATGAATCTTTATGTTGGGAAGGGATGAGTCTTTCTATTCAGAGTGTTTGGTCTTGCAATTGGTCTGACAAAGAGCATGGATGGTTGCCATTTCAATGCTCTAAATGATTGGACTCTTAGTAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATAAGAGACAATTTCATTGATGAGTGAAATTTACAAGAGGGATGTATAATCCATGGTGTTTACAAAAGACCTTCCCAATTTGCAATGAGGGAGGTATAACTATAGGAAGTACAAATATCAGACAGTTTACACCTTAGTAGGAAATGATTGGGGTTGTTAGTTTATAAGCAATCATAGACATGCTGAAGATAAGTTAGTTGAGCCTCATACTATTTGTAGCAATATACAACTATGTGCTTCTCAATGGTGTTATACAAAGATAAAATTCTTTTGTAACTATCCCTTCTTCATAATTCTTCATGATTGGAAGGATTTCATGTAATTAACTCCTTTTTTGTTGTTAGTACATTTTTTGGGCTTTATATTTTTTTGTTATTAATACATTTTTAGGTTTTATATTAAAAAGATTCACATAAAAGTTATCCCAAGCATTGTGTGTGCATATATATACTAACAAGAAACTGAGTTTTCATAAATATGATATAACAAATTAAGTAGTAAAGGGTAAAGTTTTGTAGCAAGATAGTTTTTTTCCCCTTTATTTTGTGGAGCATTTAAAGCAAGAGAAATAATAAAAAAATTTACGGAGATTGAGAGATCGGGTGAGGATATTTGGCCACCTTATGGGCTATACAGTTACTAAACCTTTTTGTAAGAGCCAAGTTTTGCTCTTCTAGATTGGAGTCCATTTTTGTAGTTAGTGTCGTTCTGTTTTCTTTTTCGTTGTGCCTTGTTCTGTTTTTTGTATGCCCCTTTATATTCTTCAGTTGTCTCAATGAAAACGTGATTTCTTAAACATAAGAAAGAAAGAAAGATTCTCAGCCTCTCTGGTATGTTGTTGTATTTCAACACTATGTTTTTACAAATTAGTTTTGCTTTAATATTATAAATTTTGATATTTAGGAAACAAAGACTAATAAATGAGTAGAAAACAAGATTAGTATACAAGCAATTATTGTAGATGAATTAAGGAAAGAAAAACTTAATAGATTGAGAAAGTTTCTTCTCCCATGATTGTAAGCGATGAGGATGTTGTCAAACTTCCTTCAAGAATTGTACTAATTATGAACTGGACCAACTATTAGATTGACATCTTTTCTGGATCATTTGGATGAGAAATGTAGACTTGGTTAAGCTGATATATATGTATATATATGTGTGTGTGTAATATTTTCTTAAACAATCGAGCTTTAATTGAGATCAAATGAAAGAATACAATGTTTTAAGGAAAAAGTAAAGAAGAAAGAATACAAGGAGAATATAAACAACCCCCAACAAGAGCAAACTAGCATAAAAGGGTCTCTAATTAAGTGAAATAAAACCTAAAAGATAATTACAAAAGCTTTGCACACGGAGGGCTAAAGAGAGTTGTGAAATCTAACAAGGGGCCTCAACTTAGGCCACAACTCACTCCAACGTCTCTTAGACCCTCTAAATATTCTGTTGTTTCTTTCTTTCCAAGGACCCCACAAATAGCACTAAAGCTTGCGAACCCAAGAAGCAGCCCTTTTCACAAAAAAGGGATGGAGAAGAGGCTTCTCCACCATGAAACTGTACCCTCTAGGTCAGGGCAAGCTAAAGATGAATGTCCTGAAAAGTATCTTCACACCAACCTAGACAAATCACATGACCATACGAGATGATGAGGAAACTCACAGCCATATTTTCAGCCACGGTACTATTGCATGATATATTTGTTGTAGAGTGTTTCAAGCTTTTGGATGGTTCACAGTTCTTCCAAAGTATACAAAAGATCTCCTCAACACAGTCCTTATGAGTCTCCCATTTTGTGGGTCAAAGCCTTGTTATGGATCTTTAACCATCGTGAGGCACATATCTCAGACCTTCTTTTGGATCCTTTGGAAAGAGAGAAACCAAAGAATCTTCTTGGTCAAAACTCTCCCTTTTGATGTGTTCTTCAACCCGATTATTTACTATGCTATTTTTTTTTGGTGTAAATTGTCTAGACACTTTGCTTCTTACACTTATGCTTCCCTTTAAACCAATTGGAAAAATCTTTTATAATCGTTGTAGATCTTTGATCCCTTTTGTAAATTGTACATCAATGAAATTATTCCTTGTAAGAAAAAATAAATAAATAATAAAGGACCACAGAAGATGATTCATATCCTCAGCTGCCCCTGCAAAGGAATCAAAGGATACAACATAAGGACCCAATCAGATGAGGTGAATTCCTCTGAACATGAACTAGGATATTGACTCTGCTTTGAAGGAATTTTTTTACCTTCTTTGGGAATTTAATCTTCCATTGCGTGGAGAAGATGGAGACACTTGGAAAACATCAAAAGAAAGAACTACAGGCAAAACCTTTTAGAAGGACTAAGGTTCCACAG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BLAST of Carg05585 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg05585 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg05585 vs. NCBI nr
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Match: sp|Q6DIR8|PALD_XENTR (Paladin OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 3.5e-39 Identity = 191/802 (23.82%), Postives = 347/802 (43.27%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8JHZ8|PALD_CHICK (Paladin OS=Gallus gallus OX=9031 GN=PALD1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 1.7e-38 Identity = 192/794 (24.18%), Postives = 332/794 (41.81%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q803E0|PALD_DANRE (Paladin OS=Danio rerio OX=7955 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 159.8 bits (403), Expect = 1.9e-37 Identity = 189/814 (23.22%), Postives = 347/814 (42.63%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P70261|PALD_MOUSE (Paladin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pald1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 127.1 bits (318), Expect = 1.4e-27 Identity = 179/792 (22.60%), Postives = 313/792 (39.52%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C832|A0A1S3C832_CUCME (paladin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2359.7 bits (6114), Expect = 0.0e+00 Identity = 1180/1256 (93.95%), Postives = 1218/1256 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KB71|A0A0A0KB71_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G001780 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2336.6 bits (6054), Expect = 0.0e+00 Identity = 1170/1256 (93.15%), Postives = 1209/1256 (96.26%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A251PW22|A0A251PW22_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_3G000300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2072.0 bits (5367), Expect = 0.0e+00 Identity = 1036/1254 (82.62%), Postives = 1127/1254 (89.87%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A251PSW4|A0A251PSW4_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_3G000300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2061.2 bits (5339), Expect = 0.0e+00 Identity = 1031/1247 (82.68%), Postives = 1121/1247 (89.90%), Query Frame = 0
BLAST of Carg05585 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5B396|A0A2P5B396_PARAD (Protein-tyrosine phosphatase-like OS=Parasponia andersonii OX=3476 GN=PanWU01x14_276040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2053.1 bits (5318), Expect = 0.0e+00 Identity = 1022/1260 (81.11%), Postives = 1131/1260 (89.76%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of silver-seed gourd
Date Performed: 2019-03-07
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |