CSPI05G15900 (gene) Wild cucumber (PI 183967)

NameCSPI05G15900
Typegene
OrganismCucumis sativus (Wild cucumber (PI 183967))
DescriptionUnknown protein
LocationChr5 : 17019344 .. 17020523 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGTGCGAGGTCGGGCGAAGCATGGGCGTGGAGATAGGTCTATGGCGGAGAAGGAGTTGGAAGGGAGAGGATAGAGATGAGATGATGGTAGAAGCTTGGCCGCCATTAATGTGGAACAGAGAAGAGAGAGAGAGATTTTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAGGCAGAGCCACAGCCACAGCCACAGCCACAAGAAAGAAGAAAAAGATAAAAGCATTGATTTTGGTTTGCTTGTGGAGTGAAAAATCACTCTATACGGCATCTTGTGGTTGCCGTTTACTCCTAAATTGGCTCACTTGGATTGCACTTTCATGTTTGAGCCGACTTCTAATTTTTGTTTTTGCTTGGTTTCTGAATTCTAATTTACACTAA

mRNA sequence

ATGAGTGCGAGAAGCTTGGCCGCCATTAATGTGGAACAGAGAAGAGAGAGAGAGATTTTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAGGCAGAGCCACAGCCACAGCCACAGCCACAAGAAAGAAGAAAAAGATAAAAGCATTGATTTTGGTTTGCTTGTGGAGTGAAAAATCACTCTATACGGCATCTTGTGGTTGCCGTTTACTCCTAAATTGGCTCACTTGGATTGCACTTTCATGTTTGAGCCGACTTCTAATTTTTGTTTTTGCTTGGTTTCTGAATTCTAATTTACACTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTGCGAGAAGCTTGGCCGCCATTAATGTGGAACAGAGAAGAGAGAGAGAGATTTTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGAGGCAGAGCCACAGCCACAGCCACAGCCACAAGAAAGAAGAAAAAGATAAAAGCATTGATTTTGGTTTGCTTGTGGAGTGAAAAATCACTCTATACGGCATCTTGTGGTTGCCGTTTACTCCTAAATTGGCTCACTTGGATTGCACTTTCATGTTTGAGCCGACTTCTAATTTTTGTTTTTGCTTGGTTTCTGAATTCTAATTTACACTAA
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR005819Histone_H5
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0000786nucleosome
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0003677DNA binding
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006334nucleosome assembly
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006334 nucleosome assembly
cellular_component GO:0000786 nucleosome
molecular_function GO:0003677 DNA binding

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CSPI05G15900.1CSPI05G15900.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (PI183967)
Date Performed: 2017-01-17
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR005819Histone H5PRINTSPR00624HISTONEH5coord: 74..93
score: 6.1E-6coord: 52..69
score: 6.1E-6coord: 22..36
score: 6.
NoneNo IPR availableunknownCoilCoilcoord: 10..296
scor

The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None