CSPI02G07900 (gene) Wild cucumber (PI 183967)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGGAACATGATATTGGTTCATTCATATTTGTCTTACTTAGCTCTCACTAGGTGTAAATTGAACCCCTTGTAATCATGGTTTAACTACATTTATTACCCATTTGAAATGTTTCTGAATTTTTTTGGATAGGAACGCCCATATTTAATTTCATTTGTTTCCTATAAAAATGTCTCACAAGTATCTATCTTTATAAATTTTCAGCAAAACTATATAATCTTGGCCGAGGCAGATATTCAACAATGTCAGGAGGAAGACATCACAAGAGTATCCACTGTCCTTTCTATTTCAAAAGTAGCCGCTAGCATCCTGCTCCGATATTACAACTGGTATAAATTTATCAACTGTATGTGAAGTACTTGAATACAGATGGTTTACATAGTGAACCCTATTAATGAAAAGTACATGTCTTAACGTTTTTTATTACATAACATTGTAGATTTAATTATTACACGACAATATTGTCTTGGGGACCTTCCGTAATATGTTCCTCACCTGCGTTCACTTCATGTTTTCTCCACTTTGTAAATATCGTATGCCCAATTCCATATTCTAAATTCTGCGGATTCTACAATGATCTTGCTTTGCAGGAGTGTCAGTAAAGTGCATGATGAATGGTTTGCAGATGAAGAAAAGGTTCGTAGATCTGTTGGCTTACTACAGAAACCAGTTTTGCGACATTCAAATGAACTAGAAGTAAGCAATCTCATTTTTTTTGGTTTTATTGAGATTCTGTTAACTGTTTTTGCATAAACAATTGATTGGTAAAATTGAGAATGTAAACAGCATTATGATATATCTTATCTTTTGGCAGCTACCTTGTGGTATATGTTTTGAAATCTATCCACGTGATAAGATCCAGTCAGCTGCTTGTGGCCATCCATTTTGCAATGCTTGTTGGACAGGTTTGCCAACTAATAACAAACCATTTTTGTTATACTTGCTTGGTTCTAGCCTTTTTTTCTGTTGCATAAGAAACATTCAAGGACAATATATTCCAAAAAGGTGAAGCAGAACAACCTAAGGGCCTGGATAGAGAGAACAGCACCCCCCTCCCCCCACAAGCGCACACACATTGACAACAACAACAACAAGAGCTACACAAAAGAGCCTTTGAATCTCTAATAATAAAGGACAGACTGTAATTACAAAAGAACAATTGAAGTGTAATCACTTGGGAGCATTTCATTTTTCTTTTTGAAATGGAAATAAGAATTTTCATGGTTTGAGAGAAATCTACAGGTCTTTCACAATAAAGCATCCTCTTGGTTTGATAGATATGAGTTCGCACGTCTGGATGCCTGTTCATAGTGCTCTCTAAGTAAACAATTTATAGACTTCTCTATGCAAGATATCTTATTAAACTGGCAGGCCTTTATCTTTCCCCCTTGTTGATGATTCAGATTGGATTCACATCCTTCAATTTTTTTTTTTGAAATGGAGACAAGCCTCTTTATTAATAATGGAAAATGAGACTAATGCTCAAAGTACAAAAGACTTATACTAAATAAGAAAATAAAAAAACATCCAAATAAACTGCCAATACAAGGGAAAAAAAACGACCAATACAAACAATCGCGAAGAACAAGCTAAAAAGGCGAAAACCAACAGAAAAAATGAAACTCAATTAGTTGCGATATGAAGTGCTGCTTGATTATCACAACACATTTTTTCTGGTGTAGTGATTTCAAATCCCAACTCAACAAGAAGTTGATATATCCAAATCAATTCACGTACAGACTTTGTCATTGCTCTAGATTTTGATTTCGCACTTGAACATGACACCACATCTTCTATTGGTGTCTGAGAAACATTGGTACTTCTTAATCTCCTCATGGTTTATTATCTTTCGTCGCTTGCTCAAAGATGATGAAATTTTGGAATACGAAGACTTGTTAGAGCTAATTTCTAGGAAGGCAGTGTCGGATAACCTAGACAAATGAATTTGGTCATTAATCCTACGGGCAGATTTTCAGTAAAGTCGTTATCCTCCCATCTCTCTCCTTCCTTGCCGATAAGCAGCTGCCTTTAAAAAGCATTATGGAAGACTAACACCCAAGGAGGGAGGTCGAAAATATTTTTAGTCATAACGTACAACAGTTGTTATCAGGGCACTCTTTGAAGAAGAAACAACGGTTGTTATGGGAAAACGTGGTCAAAGTACTGCTTGCAGATTTGTGGTTGAGAGGAATCAAAGGACATTTCATGACAAGGAGATGAGGTGGATAGATCGTTATGAGTTGGCAGCCCCTAACGCTTCAGCTTGTTCCCTAAATAAAAACTTTGAAGCCTATAGCATCTAGGAGATAAGCTTAAATTGGGGGTTTTTATTTTTTCCAGATTTATTAAACATTCTGTCTTGATTGTAATAAGCTAGCTATTTGAATTTCTTTACTTATTCTCAGTTGTAGCTTTGTTGTATCACTGTTCCCTTAGATTATGGGATAGGGAAGGAGTTCGACTCTTTGATTGATTGATATTTTGGCGCTAGCATATTTTTGGTGGATATGATGAGGATTCTAGGGGGTGTTAACCTAGTTGAGATGTTCGGGTGTGTCTACTGATTTTCAGTCTCTTCATCTAAGTGCTCTTTGGATAACTCTCATGTACTTCAAGCATTAGTCTCGTTTTATTAATAAAATTTGAGACTCGTCTCCTTTTCGAAAAAGGAAAAAGAAAAAGAATTTTAACCTTCTGACATTTGACCCATCACATTTTGAAATTCAATAACCTCATCATTTTTTAGCAAATGATGATGTACGAAAGGTTAGAATTTAAATTCTCTTTTCACTTGTGATATTCTTATCAAAGAAAAAAAAAGAGAAGAAAAGAAGATAATGTTATCTTTTTTTTTCTTATTGCTCTTGTTGTAGGTTACATTAGCACATCTATCAATGATGGTCCAGGATGTCTAATGTTGCGATGTCCAGATCCATCTTGTGGTGCTGCTGTCGGTCAAGATATGATAAATTTATTAGTTTCTGATGACGAAAAAAAGAAGTACTTTCGTTATTTTGTTCGATCCTATGTTGAGGACAATCGGAAGGTATTTTGCAATTTGAACTCTTATGTTTACAAATTTATTTATTTATTATTTTTTATCGTAATACGCAAGAATAGCTTAAATAATGATTAGGCATGCATTGAAATGTTGGATGTTCCATGGTTTATTGGAGGACCATATATCTGTTTTGTATCAAAAAGAAAAGTAACAGGAAGAACGCCCAACATTGCATTTGATTAAACAAGAAGTAGCTGCTGAAAAAACACAAATTTGCCTCTTTAAGCCATCTAACATAAATTAATCATGCATTGAATTTGAAGATGAGCTCGTTCTTACATTTACATGATTTTGAAATCTTTCATTTCAAAAGCATCACAAATTATTCAAGAAGAATATCATAAATTATTTCTGTTCCTGCTCAATGATTATATTTCCATTTAAATATTTCTGATGTATAATAATTATCCAGTTACGTTGGGCGTTTGCTTCAGCAAAGTTGGTGTTCACATTAGGCATAGCTAATGCCATATTTCGGTTTCTTTGTAGACCAAATGGTGCCCCGCTCCAGGATGTGATTATGCTGTAGATTTTATAGTTGGAAGTGGAAGCTATGATGTTACTTGCAGATGCTCCTATAGCTTTTGCTGGAATGTGAGTCAGCTTCATACTGTTTATTAACTAGATTTTTTATTCAACATAACTGGATAGAAGTTGCTTCTTAAGTTCTTTTTGAGTTCTATTGGCTATGGTTAGCCTTGAACTTGGACATTATTAGTGATTTTTTATCAGGTATGGATATGATGAGGGTGTGGTGTTAAGGGTGTGTCTAGTTGAGATGTTCAGGTGCATCTCCTGATCCTTGGTTTGGGTGCTCATTGTATAATCATCTTGTACTTGAGCTTTTGTCTCAATATTTATTGATAAAATAAACGAGGCTGTTTCCTTTTTTGAAAACGTACTGTAATTTTCATCTATATTTATCATTATTTCTCAATCTCATAGAGTTATTATGGTTAGATTACTTTATCTACCAATGGGCTTCTGTAAGGAAAAGTATGATCTCTCTCTCTCTTCTATGGAGGATCAATATAGAATGAACTTGTAGGTTTATTTTGCTAGATGTACGCTGAACCTGTGCGTCAGAGGTCTACTTTTGATAATTTGGATGGGTCTGACCCACAAAAGTTGTGGAAGTAATGCCTTGAATCCCAATTTATAGAACAGAAGCTACACAAGGCGGAGGTGGGAAATTGAAGTCAGCTTGGTGAGGGCAGTATAGCCTATCAGTTGTTTGAAAGAGCTTTGAACATTTTGAAATCTGACTTAATGAAGGTATTGCAACATTTTTAGAAAATGAGATCATCCGTATGATTCCTACATCTTCTAATACTCAAGAAACTGAAGGGAAATCGAGTCGCTGAATGTAGACCCCATCTGCTCGGTTTCTTCTCTTTACATAGTAATTGTAAAGAGTCGTTCCCTTATAATGATGATCTGCAGGCTAATCATGCCGAGGAATGGCTTATTGAGGTTCTTAGTTTGATTTAAGAGCTCAAGAAGACGGCAGGTTTTTAATGGTTGTTTATTTCATTCCACTCAGTACACAAAAACGTTGTACAAGCATTAACCACAAAATCATCTGTGTGCTGGTTGAAGTTCTGCTCTGCACAAGCTGATTGTGCTGTGGTGTACATGCATTAAAACCCAAAACACAGATTTGTTAATGATTATTTTGACATACAGTCAAAACAATTTACAATGTTTTTTTTTTTCCCAAAGCCAATTAAAACGTGAAATTTAATATAAGATCAGATAGAATTAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAGAATAAGACACCCTTTGCTGCACATGCTAAAATAGGTATAGAAATTTTTGGGATTTTCTGGGCAAGGAGGTTCATGTTTCCTGGGTTTATGATTTACTGATGATGCTAATATTATGTCGACATGGTCTGTCAGGTAGAGCAGAA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Match: ARI5_ARATH (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI5 OS=Arabidopsis thaliana GN=ARI5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 765.0 bits (1974), Expect = 5.5e-220 Identity = 355/502 (70.72%), Postives = 426/502 (84.86%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. Swiss-Prot
Match: ARI6_ARATH (Putative E3 ubiquitin-protein ligase ARI6 OS=Arabidopsis thaliana GN=ARI6 PE=5 SV=1) HSP 1 Score: 718.0 bits (1852), Expect = 7.7e-206 Identity = 330/499 (66.13%), Postives = 412/499 (82.57%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. Swiss-Prot
Match: ARI10_ARATH (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI10 OS=Arabidopsis thaliana GN=ARI10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 589.3 bits (1518), Expect = 4.1e-167 Identity = 270/464 (58.19%), Postives = 346/464 (74.57%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LHB9_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G091790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1007.3 bits (2603), Expect = 7.1e-291 Identity = 484/509 (95.09%), Postives = 486/509 (95.48%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TrEMBL
Match: A0A061EZ86_THECC (IBR domain-containing protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_025075 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 979.9 bits (2532), Expect = 1.2e-282 Identity = 462/533 (86.68%), Postives = 490/533 (91.93%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TrEMBL
Match: A0A067JVS8_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_18071 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 978.8 bits (2529), Expect = 2.7e-282 Identity = 458/533 (85.93%), Postives = 489/533 (91.74%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TrEMBL
Match: M5WKX8_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa003187mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 973.0 bits (2514), Expect = 1.5e-280 Identity = 458/533 (85.93%), Postives = 487/533 (91.37%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TrEMBL
Match: A5BJA5_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VITISV_023021 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 973.0 bits (2514), Expect = 1.5e-280 Identity = 455/535 (85.05%), Postives = 495/535 (92.52%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TAIR10
Match: AT1G65430.1 (AT1G65430.1 IBR domain-containing protein) HSP 1 Score: 864.0 bits (2231), Expect = 4.9e-251 Identity = 401/531 (75.52%), Postives = 459/531 (86.44%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TAIR10
Match: AT2G31510.1 (AT2G31510.1 IBR domain-containing protein) HSP 1 Score: 820.5 bits (2118), Expect = 6.2e-238 Identity = 381/505 (75.45%), Postives = 441/505 (87.33%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TAIR10
Match: AT1G05890.2 (AT1G05890.2 RING/U-box superfamily protein) HSP 1 Score: 765.0 bits (1974), Expect = 3.1e-221 Identity = 355/502 (70.72%), Postives = 426/502 (84.86%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TAIR10
Match: AT2G31760.1 (AT2G31760.1 RING/U-box superfamily protein) HSP 1 Score: 589.3 bits (1518), Expect = 2.3e-168 Identity = 270/464 (58.19%), Postives = 346/464 (74.57%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. TAIR10
Match: AT2G31770.1 (AT2G31770.1 RING/U-box superfamily protein) HSP 1 Score: 588.6 bits (1516), Expect = 4.0e-168 Identity = 272/472 (57.63%), Postives = 348/472 (73.73%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. NCBI nr
Match: gi|449442245|ref|XP_004138892.1| (PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1120.5 bits (2897), Expect = 0.0e+00 Identity = 530/531 (99.81%), Postives = 530/531 (99.81%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. NCBI nr
Match: gi|659082300|ref|XP_008441769.1| (PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1109.7 bits (2869), Expect = 0.0e+00 Identity = 523/531 (98.49%), Postives = 528/531 (99.44%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. NCBI nr
Match: gi|778668058|ref|XP_011649031.1| (PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1053.1 bits (2722), Expect = 1.6e-304 Identity = 503/531 (94.73%), Postives = 503/531 (94.73%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. NCBI nr
Match: gi|659082302|ref|XP_008441770.1| (PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1045.0 bits (2701), Expect = 4.4e-302 Identity = 497/531 (93.60%), Postives = 502/531 (94.54%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07900 vs. NCBI nr
Match: gi|700206216|gb|KGN61335.1| (hypothetical protein Csa_2G091790 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1007.3 bits (2603), Expect = 1.0e-290 Identity = 484/509 (95.09%), Postives = 486/509 (95.48%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (PI183967)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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