Spg032343 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg032343
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold2: 35169023 .. 35176944 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg032343
SyntenySpg032343
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGGTGGGTTTGGTGAGTCTTCAATTTGGCAGAAATTCAGTATGTTTCAAGCTCCATTTCTTCAGCCATCTTATTCCCTTTTATAGATGGATTAAAGATGAAGGAAAGCCCCAGCAATTGACACTCAATCAACCAAGGTATAGTGGGAATTTTGGTCTCCAACATGAGGGGAGTGCATGGGTTTAGTCACCATGCATTCCACCGCCAAAAATTCAATCTTTTTGAATTTAATTAAATAAATAATTATCCTTGATTAATTGGATAATTATCTGAATTTTAATAATCTGAAAAATTAAAATTGAATTTCAATTTTTCAATTTTAAATTAATTCAAAATTAAATTAAAATAATTATTAAATAATTAATTAATTATTAATTTAATATTAAATATTAAATTAATATTTTGCCACCAATCCCGAACATTTCCAAAATGTTATTTTCAATCATGAATCCCTATTCATGTGTTCGGTATTTAAATCATATTTAAATATCAAATACTCACCTACACGGTTTTCACAAAAAACGCGACGTACCGACAACGCCTATCACCTCTACTCTTTTTTCTCAACATGAACTTAAAGTAATTCATATTTTATCCATCATATTGTTCCAAAGGTTAGTCTTGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACTGATCATGGGCTCCAACGGTACGAGGTTAAACTAGCCAAACTGTTTTAACCTAGTTAACCAACGTCCGTTAACTACCGGGACACTCCACTATAGCCTAGTAGTTGAACTCCCCTCGCTGTAGATATATTTCTGTCCACTCGATATAACCATTATTATTAAGTCAATTCTTCACAGGTCGTTCGTTACTATAGATAGGTCAAAAGTCTGTTTTACCCCTATAGCACATCTTAGTTCCTTAAGTCCATTGGTCCTCTAATGAACAATTTTGTTCATGGTCCAACCATAAAAAAAGATCCCTCTCGGGCCAATGAGAGGGTGGGGCCCCTTCTTCGAGCCTTGGATTCAACACTTAGGCAAACAACCTCTCCACTATCCCTGAATAGGGTAGGAGTGAATTCCGTATTGCATTACTATGTCCTCAGCCATCCATCTAGTGTTATCCCCAAAATGGTAGGATTATTGAACGGAATTTTATGACCACTCTCACCCATGCAGATCAAAGGATAACCCTAAACGAACAGGAGTTCATAGTAAGCTCAAGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGCATGAAATAATCAGTCTTAACATTAAACGACATTATAAAGTAAAAGTGACTTATTTCTCGGTCCAGTCTTGTGTAAACATCTTTTACACAGGATGCCCCTACTTGCATGTCTTTACATGAACGATCTAGGATCAAGTCGTTTGCCTTATTAGAAAAGTAGGTCGCATCCATAGTGTTACCAGAACAAGGTACCCAACCTTATTCATTTACTATAGACTATTTAGGTTATGTACTCGAACTTGATCCCTGTCCATATATACAATATAGTTCGAGTATCTCATATTATAACCATGGATGTTTCTATTGGATTATAAGATATAAATAAACAATTTCGCTCAATAACGTCTTTATTTATGTAAAGGATAACAAAACTTGAGTTCTAGGACATAAACCCCAACAAACTCCCGCTTGGACTATAACTCAAGTGAGATTACACTATTGTGAGGTAACTTAGCATTATATCATATGCTAAAAGCTCGTAGTCCTAAATTCTTGAGATGTCCCTCAAACACTTTAGCCGTGAGGGGTTTTGTAAATGGATCAGCCATGTTCTATTCTAAAGCTATCTGGGAGATGATCACATCTCCTCTTTGTACTATCTCCTGTATGAGATGGTATTTGTGTTCAATGTGCTTTCCACGTTTATGGCTTCGAGGTTCCTTTGGATTTGCAACTGCTCCACTATTGTCACAACAAAGAGTGACTGGCAAGTGCATGTTTGGAACAACTTCTAACCCATTTAGAAATTTTCTAAGCCACACAGCTTCCTTTGATGCTTCACAGGCCGCAACATATTCAGCTTCCATTGTGAAATCGGCAATACATGTTTGTTTAATACTTCTCCACACTACTGCTCCTCCATTCAGAGTGAACACAGATCCCGATGTAGATCTCCTTGAGTCTATGTCGGTTTGAAAATCTGTGTCAGTGTATCTAGTAAGGCTCAAATCCTTAGAAACATACACTAGCGAATAGTATCTTGTTCTCCTCAAGTATTTTAGGATATTCTTAACTGCAGTCCAATGTGCCTGACTAGGATTGGACTGATATCTGCTGACAACACCTATTGCATAACATATGTCAGGACGTGTGCATAACATTGCATACATTATACTTCCGACCGCTGATGCGTAAGGAATTCATTTTATTTCCTCAATCCTTGTCTAAAGGGCAACATTCCCCTTTTTGGAATTCTACAACGAATATTGATTCAGAATTTTATCGATATAGGATGCTTGAGACAGTTGATAGCAGGCAAAAATGCTGCTATTTTGTACCTAAATTAATAGGCTTTTGTGTCCTTTTATGATGTTGTATATCGAAAATCTATTTAAATTAATTATTTTGTCCCTAGGAGCAATTTGTGGAAAAATGGTGAAAAAGAGCCCAATTTGGTGAATTTCAAGCCATCATCTTCAAGTTGGGTCAAGGAAGAAGCCCAAGATCCAATACATGAAGCATTTGGGCCAAAGGAGTAGTGGGAAGCCCGAATTTCAGCTCAATTCCACTTCTAGAAGGTTCTAGAATTGGGACAGCGTCGCGACGTTGTCCCCGTGGCATCTCGACGCTGTCCTATTCTTGTCGCACAAGACAAGATGACGACATACCCTCACGACGCTGTCCTCTTTGAATCGCGACGCTACCCTATTTCCAAGCCTATAAAAGGTGCGTTTTGGCTCCCCATTTGATCTTCAATCACCATTCCATTTCCTTTCTTTAGTCTTTCTAAAGGCTCTTAAAGCCTTTTTGAGGGCTGAGTGTGAGAATTAGTGGGAAATCATTGTAATGAGCAAATTTGGAGGGCTTGGGATCTTGTTTCGAAGACGATCCATAGCGCAAGCAGGGGGTTCTCGAAGGTCATTTTCCTAACTCTTACTTTGCTCATTTTTATGCTTATTAGTATGTATATTTGGGAAATTTTGATCATGTATAGCTAAATCCCATTTGTGGGTCTTGAAATGAAAGTTTATAGTTGATTATTATTCTTAATTGCCTATCTCTTGTCCAAATACTGATTATTTGTGTGGATGATCTTAATCCTTTATATGATCTGGCCAATTGTATATTGATTAGATTCCTAATGGAAACTCGACGGAGAGAAGTTAGGGTAGATCACAATCCACTCAACTAAGTTTAACTACTCCTAGTGACAGCGAGAGTAGTTGGTTAGACTTAGAGACCAAAAATGATTAAGGGCTAATTAATTAACGAATTTAATAGCGCTAAGGACACTTAGGTTATTAATATGAGTTAATTACAATTAGGGGAAACCGAAAGGAGAACCTATGTGCTAAATGGAGATTCTAGGTTTATAATTAGTCGGCCATGAGTTAGGACAATTAGAATAATTTATTAGCTATAATTTGATTTTGAAGACCCCGTGTCACATTCGTTTCTTTCTCCACCATTTTTATTTTGATTGATCACTTGGATTCGTTTATTGCTTTATTTCTTGATTTGCTTCATCATTATGTTTTATCACCTAAATAATATTTTGTCTTAGTACTATTAGTGCTCATTTTATTATCTTGCTTAATCACCGTCTTCCTCCCTATGGATTCGATACTCGGTATACTTTACCGTTTTATTATTACTTGCGACCCGTGCACTTTGAGGTCATCAAGTTTTTGGCGCCGTTGCCGGAAAGGATGGGTTTGTTTAAGCAAAATAATTTTTTGACATTAAAAAGAACAGATTGAATATTAATTTAGGTTGTAAATATTTTTCTTTTATTCATTTTGTGAATATTTTTATTTTTGTTTTTGTTCTGATAAGCATGGGGGCAATTCTATCTAAGACTGTTACGGATGCTAAAGAACTCTTGGAGCAAATGGCTACAACCAGTTATCAATGGCCCACGAAGAGGGGAACAATATCAAAGAAGGTTGGTATCTATGAAATTGATGAGTTAAGTTCGTTGAAAGCACAAATGGCGTCGCTAACAAATGCATTAAACAAGTTAACTTCTTCTGAGGTGGTCAAATCTATTTCCACCTTGGCAGAGGGATATTCGAAGAATGAAAGTCAGGACGTGGAGGAAGTTCAATATGTTGGAAATCGAGCATTACTCAAGGACTGTCGAACTTCTACCACTCGAATTTGCGCAATCACGAGAAATTCTCATATTCAAATAACAAGAATGTTTTACAACCACCACCAGGGTTTGCTTCCACGAGTACACAAGAAAAGATAAGCAACCTTGAAGAGATGGTGACTCTCTTTATCAAAGAGCAGAAGGTTCTAAACGTAAGCCTCCAATCATTAGTGAACACTTTAGTGACGATCGTGAATAATCATGACGTAGCTCTCAAGAACATGGAGGTGCAAATGGGGCAAATTGCAACTGCAGTGAACGCCCTTCAGAAGGGCAAGTTCCCCAGCGATACTGAGATAAACCCTCGAGAGCAATGCAAGATGGTTTCATTAAGAAGTGGGAGACGTTTGGAAAACCGCTCAGATGAAGAGAAGAAGCTAAAGAAGGAAGAGAAGATGAGTCGGGATGAAGATGAACAGACTGAGGCGCAAAAAAACCTCCATAGACAGGTCCCAAAGTCCTCCCTGCTCTTTTGATTTAAATTTTGGTTTTACTAACAATCGTACAGGTAAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGCTTGATGAAAAAGAAAAGTTGGAAGAAAAGATGGATGACGAAGAGGTGATCCCATGCAGACATCATGATAGAGGGTCGCACATTAGCCCGTCCAAGAGGAGGGGCGAATGTCCAACCTTCGATTACAGCGAGTTACCTTTTCCCCATAGGT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mRNA sequence

ATGGAGGTGGGTTTGGTTAGTCTTGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACTGATCATGGGCTCCAACGATCAAAGGATAACCCTAAACGAACAGGAGTTCATAGTAAGCTCAAGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGCATGAAATAATCAGTCTTAACATTAAACGACATTATAAAGTAAAAGTGACTTATTTCTCGGTTCTAGAATTGGGACAGCGTCGCGACGTTGTCCCCGTGGCATCTCGACGCTGTCCTATTCTTGTCGCACAAGACAAGATGACGACATACCCTCACGACGCTGTCCTCTTTGAATCGCGACGCTACCCTATTTCCAAGCCTATAAAAGGTAAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGCTTGATGAAAAAGAAAAGTTGGAAGAAAAGATGGATGACGAAGAGCTAGGGGATTTGCATATGGATGATGTGAATTTTGATCCTGATGAGTTCTTTGATGATGCATTGTTTGAGAATGAGTTGCTTGATAGTGTTGAGATACCTGCTGTACATATTTATGAGCATTATTTTCCTGCACTAAATTTAGAAAAGCACGTGATAGATGACAGTTTTGAATCTGATCCTGAAATTGTTGAATATTTTGAATCTGATGATGAGGAGTCAAATGATAGCCTTATAAAGTCTGATGTGAATGTTGTGTCTCATGAACATATAGAGATAATACCTGATGAATGGTCCGTTTTAGTTGATAGACCACCTCAGGATCCGAGACCAGTTGATATTATGATGCTTGATGACTCAGTGGATAATTGTTTTGTGGATAGGGATTTAGAGAAAAAATTTGACACTGTTAAATTTGTTATGACTTCTTATTATGATCACTTGTTTAGCGATGACGGGCCAGGGGAAAGATTTTTTACTCCCCTGTTTACAGTTCTGGAATTGGGACAGCGTCGCGACGCTGTGCCCATAACGTCTCGACGCTGTCTTATTCTTTTCGCACAAGACAAGATGACGTCATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGAGGTGGGTTTGGTTAGTCTTGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACTGATCATGGGCTCCAACGATCAAAGGATAACCCTAAACGAACAGGAGTTCATAGTAAGCTCAAGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGCATGAAATAATCAGTCTTAACATTAAACGACATTATAAAGTAAAAGTGACTTATTTCTCGGTTCTAGAATTGGGACAGCGTCGCGACGTTGTCCCCGTGGCATCTCGACGCTGTCCTATTCTTGTCGCACAAGACAAGATGACGACATACCCTCACGACGCTGTCCTCTTTGAATCGCGACGCTACCCTATTTCCAAGCCTATAAAAGGTAAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGCTTGATGAAAAAGAAAAGTTGGAAGAAAAGATGGATGACGAAGAGCTAGGGGATTTGCATATGGATGATGTGAATTTTGATCCTGATGAGTTCTTTGATGATGCATTGTTTGAGAATGAGTTGCTTGATAGTGTTGAGATACCTGCTGTACATATTTATGAGCATTATTTTCCTGCACTAAATTTAGAAAAGCACGTGATAGATGACAGTTTTGAATCTGATCCTGAAATTGTTGAATATTTTGAATCTGATGATGAGGAGTCAAATGATAGCCTTATAAAGTCTGATGTGAATGTTGTGTCTCATGAACATATAGAGATAATACCTGATGAATGGTCCGTTTTAGTTGATAGACCACCTCAGGATCCGAGACCAGTTGATATTATGATGCTTGATGACTCAGTGGATAATTGTTTTGTGGATAGGGATTTAGAGAAAAAATTTGACACTGTTAAATTTGTTATGACTTCTTATTATGATCACTTGTTTAGCGATGACGGGCCAGGGGAAAGATTTTTTACTCCCCTGTTTACAGTTCTGGAATTGGGACAGCGTCGCGACGCTGTGCCCATAACGTCTCGACGCTGTCTTATTCTTTTCGCACAAGACAAGATGACGTCATAG

Protein sequence

MEVGLVSLELARGPNGPTDHGLQRSKDNPKRTGVHSKLKIKIELPRSSHEIISLNIKRHYKVKVTYFSVLELGQRRDVVPVASRRCPILVAQDKMTTYPHDAVLFESRRYPISKPIKGKEEEKKKLDEKEKLEEKMDDEELGDLHMDDVNFDPDEFFDDALFENELLDSVEIPAVHIYEHYFPALNLEKHVIDDSFESDPEIVEYFESDDEESNDSLIKSDVNVVSHEHIEIIPDEWSVLVDRPPQDPRPVDIMMLDDSVDNCFVDRDLEKKFDTVKFVMTSYYDHLFSDDGPGERFFTPLFTVLELGQRRDAVPITSRRCLILFAQDKMTS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 116..142
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 11..33

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg032343.1Spg032343.1mRNA