Sed0012333 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0012333
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG12: 30099582 .. 30104831 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0012333
SyntenySed0012333
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTGTATGCTACATGTAAGTGGAGAGGTCCAAAGAGTTTCACAATTGGGCCTACATTTGAATGAAGAAAAGCCCACAACCTTATCTGGCCCTAACAATTTCTAGATAAGCCCAATTCTAAATTAAACGGGCAGATACCAATACATTCATATTTGGGCCTAATGGATCTGGAAATTCAGAACCAATGGGCTTGGATCCATGAAAAGGCCCAATAAACCAAAACATAAATTTAGTTTGTTTTAAATATTCCTAAAAAAGATTAAAGAAAACTGTCGGTATTTCACGTACTGCCCTCAGTTCTCGGTTCCCCTTTGCCGCCACCGCTTTCTCGTCGCGGCTCACTCGCCGGAGCTCAGATCGGTGCCGCCGGCCGGAGCTAAGCCTTGTTTGATCCTTCGTAACTCTCAATCTGTATCTTTACCGCTTCGTCTCACTGCAATCGGAGGTGAGGGATCTCGAATTTTGAGTCATTTTGGTACCGAATTAGATTTTGTGTTGTTCCTCAGCGTCTGTCGTTGATGGATATGTCCCTCAAGCTGTATGATTGATGATTGATCCAATCTTCGGTTTCTGATTGGTGATTTTGGATTTCTTTAACCCTATCTGCTTGGATTAGATGCATTTTTTTCTGTTTGATGTGGGCAAGATCTTTGTATAATCTTCAGTCTACAATCTTTTTATCATTTTTTTTCATTTGAATTGGAACGGTAGTATGGACATCCATCTCAAAATTAATTGGCGATGAGAGAAGTAGTCCAACTTTCTTGTAAATTGTTATGAGATCTCGTTTTCAACGGGTTATCTTAACGTAGTCCTTGAAGATGTCACTTTTGAGCTCGTCAATCTTGAATCAGATCTCAATTTCATTTTTTATTGGACCGAATATTGTTTTGGATTTAATGGACTCTAATACCATATTAGATAGTGTTGACGTCCATGTCAAAACCAATGGTGATGAGTGGAGTAGGAGAACTTTCTTATAAATTGTTCAGATGTGATGTGACCACCACAGTACCAGAAAAATCCTTTTTGTTGTTCATGGAGCCTGAATGCATCTCTTGAGAATTGAGATAATAAAAGTGTCAACCATCCTGTGTTGTCCTAGTGTAAGGGCCATGCAAACAATAAAGGGCTTGGAGGGAGGGAATGAGTTCAAATCATGTGGTTACTAATTTAGGATCTAATATCTGCAAGTTATCTTGTCAACTTAAACAAATGCTGTAGAGTTAAACTGTTATCCTGTGAGTACTTTGTCTAGTTCAATTAATTGGAGACTATTGACTATGTAATTCACGGCGTCGTAGTCCTTTTGTAATGTGTGCCATGTGATCATCCTTTTAAAATTTTATGTGCACTTTCTTGAATTTCTGTGTATGGCTGCAAAGTGAAACGAATGTTTTATTGATATTTTAGCAGTGTCTATTCATGCGGTTCTGGTAATACTTGCTATTTGTAAAAAGGCTATTTTTTTTTAGGATTTTAGTTGCATACTTCTTTCATGTCAATTATCAGACTCTATCTTTGCACAAAGTTTCTAAGGAATAAAGATATCTCAGAAGAGTTAAAATAACCCAAATTGATGTAATAATTATTTTATAAAATTTGGAAGGTCATTCTTGGTGAGTAATATCCTTTAAGTTGTTTGACTCTAATGTTATAGACTTACATATACTTGTGTCTGTGTGAGACCCAAATACTCATGGACGACGAAAAAATCCTTATAGTAGTGGCTACTTATATGATATTTTATTATCTTATGGATTTCGAGATGTATAATTTTGTACGGTTAGCTCATGGACGTACGGATTTTTCTGGATGCTTGTAAATAGAAATGACTCTTGGAGCTTGGAAATTTTCTTCAGTATGTGACGATCGAAATTTATAGTATAGATACACTACTGTAGGAAAAGACAAAACTCACCTTTCTTTTAAAATGGAAGGGAAATAAAAGCCCCTTCATTTGAAGTTAGAAAGAGTCCTCCAAATCTCATGAGATTTTGTGCTATTTCAAAAAACATTATTTTGATTCTTATTGTAATTCTAATTTCTCTCTAGTCAGGTCCCCAAGGAGTAGCACAGTGGTTGAAGACTTGAGCTTTGAGGATATGCTTCCCTCAAAGTCCCAGGTTCGAGACTTAGCTGTGACATTACTCTTTTGATGTCTCTCGGTGCCTGGCTTAAGGACGGGCGTGGTTACCCCTTGTTTCAAAAAAAAAAAAATTCTCTGCAGTCAGGTCGAAGTTGGAAGGCTGAACTTCGACTTAAGTCTTGGGATGATCTTAATAAGCTATGGTATGTCCTGTTGGAGGAGAAAAATATGTTGATGACACAACGCCAGATGCTTCATGCGCAAGATCTAATGTTTCTTAACTGAGAACGCATTCCCTAGGTAAACTTGACATTCTTGTATTTGCTTTCTGTGTTTTGTTGTATCGGTAGGTTCCCTTCTCCCACCCCTGCCGTTGTGTGATCTTAGAGCTGTTACTAGCACTCCTTTCATGCCAAAGTAAGTTTACCCCAACGGTAATAAAACATGTATCTTTGACCCCAAGGGGTGGCGCAGTGGTCGAAGACTTGGGCTTCGAGGGTATGCTCCTTTTAAGGTTCCGAGTTTGAGTCTCACCTATGACATTACTCCTCTGATTTCTTCGGTGCCTAACCAAAGGACGAACGTGGTTATCCTTATTTCAAAAAAATAAGCATGTATCTTTGACCCAGAGGTTGTAGGCACGAATCCCCCAACCCCAAATATTGTTAGAAAATATCAATCCTTTCTCTACTTTTCTATTCTGATGTTGATGGTCGTTGCTGATGATCATAATTTAGGTCAGGAAGTCAATGTGTCGAATCAAGCAAGTGCTCATCGAGAGAGCGATTGAAGAACCAGATCCTCTCCTTTGAAGATCTGCAGAGATGAAGAGGATGGTAAATGCTCTGTGATAAGTTAATTGGCGTTTCAAAGCCAGCCTGTATCTACTGGAGTTAACAAAGAGAGGAAGCATTAGCGAGATAACGTCTCTTCGATTCGGTTCACTCTGTAATCACGGATCCCATTAGAAACCTAGAAACTGTTTCATGATCTCTAATCCAGTTTTAACCAATGGTAATCAAAGATTTGGAGATGTTTTAATTTGTGCCAGCATATCATCATGGCCAAGTTTTTTCTAGAAGATTTGGAATACAAAGATTTAGATCTGATGTGTGTGTGTGTGTGGAGCAAAGTTGAAAATGATAGAGTTGACAAAAAGAAGAAAAGAAAAAAGGGGAAAAAAAAATGATGCTTTGATGTGTTGGGAAAATGAAAGTGTGTGTCATGAATGTTTTGGAGGGCCATCAAAACAAAGGTAGAATGTGTGTTGTTGGTTTGGGTTTGATGATCCTGTGCTATGCTCATTCCAATTCTATTCCCTACACAAGGGGGCAAACCCACATGATTGGATTAGACAGCTTGCTTTTTTCATTAGCTTCTTAATCAAGATTGTTTATTCATGAGGGGGGCAACACAGACGACCCCACTTTTGAACTATGCAGCTTATGAATGAGTTAAATCCCGACTCGACACGTGGCGCTCTCCGATTGGGATGTTGTAAACAAACTCACTGATTGAGATTGGGTTCTGATGTGTGTGTATATATATATATGCATATATAAAGCAAAGATTAAATATTGTGTCTTCCCTTGAAATAGTAGTGTGTTGGAACAGCCCAAGACAACCTTGACCTCTTTGATGGATTTTGGGGACAGACAAGGCCAAGCATCACGGCTGGGTAACCCAATCGGAACTGAGTGCTTGAAAGGTTTATATTTGTAAATTTGTTTCCTAATTTTAATTTAAGAAATTTGTTTTAGGTAGTAAATTGTAGTATCCTATTTTAATTGGGCAACTTTTTAAAAATATTTTATATTCAATAAAATATTTCAATTTTTATTGCTTTGAATTGATTTGATTTTAGTGTTTTCAACTAGTTTAAGCTATATAGCTTCAATCAAGTTAATTCAATCAATTTTGTTTAATTATTTTCTATAAGTTTCATTTGAAATTATTTGGTGTTGAAAGGTCGCATGTAAGAAATATTCTTCATAATTTTTGTTATATTTGAATTTTTTGTTTCTAAAATTTTGACATTAATGATTTTTGTTTTGTTTTTTAAATATTCATGAAAAGATTTCCTTTAATAATTCAAATATAACAAAATTGGTTGAATCAAGTTAAATTAATGACCTTATTAAGTCCACAAAACTGATGAACAATGAAATTAAAATATTTATATTTTTAGAAAGTTATTGTAATTAAAACAAAAATGCTAGAATTTGTTACCTATAATAATTTTTTTAATTTATGTATTAAAAAAATTCAAAATTAATCTATATGATAAATTTGAATTTAGGTTCAATTCAATTGAAACTGGATTAACAATATTAATAAAAAAGAATTATAAAAATAAAGTTAGCAGAGAGATTTTTTTAAAAAGTTTACTTAAAACTAAAATTGAATAAAACTAATATAATATTTTTAAAATTGATTTTTAAAAAAATTGAGGAACATTTAGGAGAATGTTCTAAAAAAATCACTAGGGGATGTTTGTTTGATATATTTAGGCACGATTTAGCTTAAAATCATTTTGATTGATTTGAAATGAATAATTGAAAGTAAATGGTTAGAAATGATTAAGAATGAGAATTAGTTTTAAAAATAAGAATAAAAAAGAATTGATAAAAACTAATTTGAATATAAATTTTTGAAGAAGAATTAATAAATTATAAAACTAAATCTTTTATAAATATGCCAAACAAACAGTTCCTAGGAGCTAATTGCATCGCTCAACGCGTAGTTCCGAACTGCCCGAACTGCCCGGTCTGCCCGGTGTGGGCTCTGTAGTTAGTACACATTTCGTTTGTGCCGTCTGGTTTTCTCTTTCCTTTCTCTTCTCTCGCAAAATCCCCATCTCCCGTCTCTGTGCTCATTCCATTTTCTCTCTCTAGATTCTCTCTCTAGATTCTCTCTCCATCTCTCTCTACGTTGAAAAGACGGCTCGAAAATCTGCAATCCTGTTCTTCCATCTGCTTCGATCTGGAACTTCAATTCGATCCCTATGCGTTGTTGAGGTAAACCCTAGAAATCGTACTTGTTGCCGCTACGCCGGAGTGGGGGATTTCCCTCCGTTTCTATCGGGCCACGATGCCGGGGCAGCTGTTTCTGTTGATCTAGGGTTTCGCGGCGAAGCGGGCAGCTTTGAATTCTCCGATTAG

mRNA sequence

ATGTGTATGCTACATTTCTCGGTTCCCCTTTGCCGCCACCGCTTTCTCGTCGCGGCTCACTCGCCGGAGCTCAGATCGGTGCCGCCGGCCGGAGCTAAGCCTTGTTTGATCCTTCGTAACTCTCAATCTGTATCTTTACCGCTTCGTCTCACTGCAATCGGAGGTTCCCTTCTCCCACCCCTGCCGTTGTGTGATCTTAGAGCTGTTACTAGCACTCCTTTCATGCCAAATAGTGTGTTGGAACAGCCCAAGACAACCTTGACCTCTTTGATGGATTTTGGGGACAGACAAGGCCAAGCATCACGGCTGGGTAACCCAATCGGAACTGAGTGCTTGAAAGATTCTCTCTCCATCTCTCTCTACGTTGAAAAGACGGCTCGAAAATCTGCAATCCTGTTCTTCCATCTGCTTCGATCTGGAACTTCAATTCGATCCCTATGCGTTGTTGAGGTAAACCCTAGAAATCGTACTTGTTGCCGCTACGCCGGAGTGGGGGATTTCCCTCCGTTTCTATCGGGCCACGATGCCGGGGCAGCTGTTTCTGTTGATCTAGGGTTTCGCGGCGAAGCGGGCAGCTTTGAATTCTCCGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTGTATGCTACATTTCTCGGTTCCCCTTTGCCGCCACCGCTTTCTCGTCGCGGCTCACTCGCCGGAGCTCAGATCGGTGCCGCCGGCCGGAGCTAAGCCTTGTTTGATCCTTCGTAACTCTCAATCTGTATCTTTACCGCTTCGTCTCACTGCAATCGGAGGTTCCCTTCTCCCACCCCTGCCGTTGTGTGATCTTAGAGCTGTTACTAGCACTCCTTTCATGCCAAATAGTGTGTTGGAACAGCCCAAGACAACCTTGACCTCTTTGATGGATTTTGGGGACAGACAAGGCCAAGCATCACGGCTGGGTAACCCAATCGGAACTGAGTGCTTGAAAGATTCTCTCTCCATCTCTCTCTACGTTGAAAAGACGGCTCGAAAATCTGCAATCCTGTTCTTCCATCTGCTTCGATCTGGAACTTCAATTCGATCCCTATGCGTTGTTGAGGTAAACCCTAGAAATCGTACTTGTTGCCGCTACGCCGGAGTGGGGGATTTCCCTCCGTTTCTATCGGGCCACGATGCCGGGGCAGCTGTTTCTGTTGATCTAGGGTTTCGCGGCGAAGCGGGCAGCTTTGAATTCTCCGATTAG

Protein sequence

MCMLHFSVPLCRHRFLVAAHSPELRSVPPAGAKPCLILRNSQSVSLPLRLTAIGGSLLPPLPLCDLRAVTSTPFMPNSVLEQPKTTLTSLMDFGDRQGQASRLGNPIGTECLKDSLSISLYVEKTARKSAILFFHLLRSGTSIRSLCVVEVNPRNRTCCRYAGVGDFPPFLSGHDAGAAVSVDLGFRGEAGSFEFSD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0012333.1Sed0012333.1mRNA