MELO3C033218.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTGGTGGAAGCGAAGAGGAAGGTAATCCCTTTCAACCTCCCCAAACGTGGCCGACCAAATCACGATTCCAACATCTAGCCTTCGGCCATTCCTCGCCCACCGTCCGTCACGAGCATTCCTCTCTAGTCGTCCATCACCGGCATTCCTCGCAGCTATCGACCATTCCTCAGGTTAAGTTTTTTTTTTCACTTGCATCCTTAGGTTAGTTTTGCATGCTCTATTCGGCATCGTCTATTTCCTTTACTATTATTACGACCTCCAAATCTGTAACGCCCCAACAATTTTGTTTTTTTTTTCATTTATTATTAATGTTAAGTGCGGTTATGGAAAATTCGAATTTTGAGGAACTTTATCATTTTGATTTGTGATTAATCAAGGTTTAGAGGCATATTATTTTGATTTGGATAATTAAATTGGTAAAGGTTGTTATGAGGATAAAATAATTGAGTTAAGCTAAGGTGATATTTGAGTTCGAGTGGGACGACCTAGACTCAAACAGTATAAAAGCATAGTGCGCGAGTGGGACGACCCAGAGTCAAATAGTATAAAAGCATAGTGCCCCAAGATTGGGAGTGTACCTGTCACCACTGTATCAACTCACTCGGCCTCCTGACGGGTAGTGGCAAAAACTCTTCCCTACTGGGAAGCAGAAGGCTTGTGCGTCGTCGTCTCAAAGGGCTTCAGAGGACACGCGTCAGCGGTCCCCGGTTATCTGCACCTGAAGCAAACTCCACTCCCGGCCAAGCATCGACCTCCATGGGCTTTCCCACAGGTAGTACAGACGGGTAGCTCTCTCAGGGTCCTCCCAACTGCTGCAAGCTCTCGTCGGTGTCTCTGAAAGACACCTCCTGACCTCAGAGTTCGCTGCGGTATCACGTCAGGCTGCGACTCAACCTTTCTCTTCTGCCCCAGGGCTGACCCTCTGCCGGCAGCCTTAGACGAATCAGCTCTCTCATGCAGGCTCAAATCCAGTGCTATGCGTAGTGCATCCGCATGAGTGGCTGGCCGGAGGGCTCGGACAATGCCCTGAAGGTCTAGTCTAAGACCTCTAACGAATTTCTCAGTCCTGGCAGCCTCATACCTTACCACATCGGGAGCAAAACGGGATAGCATGTCGAACTCGGCGTCGTACTGCTCCACGGTCATGTCGCCTTGCTCTAAGTTTAGGAACTCTTGCAGCTTGGCGTGCTTCACATTGGCAGAGAAGAACTTAGCGTAAAAGTTCTCCTTGAACTGCTCCTAGGTTATCTTGCTGAAGTCGCCCCCCAGCATCCTCTCAGCAGTCTCCCACCAGGCGGTGCCCCTATCCTCCAGGAAGAAAACTGCACACTGCACCTTCTGGTCTTCTGGGCACTTCATGTATCGAAAGATAGTCTCTATGGACGTCAACCACATTTGGGCCTTTGTGGGGTTGTCCATGGATCCGTCAAAAGTCTTAGGATTATACTTCCTAAAGTCTCTTAAGTGCTTGGCCTCAGCCGACAGTTGAACTAGCACGGGCTGAGCTTCCACCGGGGCTGAAGGAATGACGGTCTGGGCCTGAACAGGGGCGGCCTGGTTCTGCTAGGCAGCGAGGAAAGGCGCTAGAGCAGCTTGCAGCATGTCCTGATAACGCTGCTCCATTGCGGCGAGATCCGCCTGGGTGACCGGTGCGTTAGGGTCGACCGCCGGCACAACATGTTGCTCCTCCGGCTGGCCACGATCGGCTCCTCTGCCTCCCCTACCACCTCCTCGGCGTGTACCTCTACGTGGCGACATTCTCCCTAAATTTCACCGACAAAACTTTTCACCACAAGAACATAACACTCAGATTTCTATGTCTAGTCTATTCAGGCAAGATTATAATCTTAACATTAGCAAGGCTTTGAGACATACCTGGCGAGTGACGTAGGACTGTATAGCCATATGGTGCAGTAAAAACAAAAACAAAACAATGACTTACATCGTAGGTCAGTCTACTGAACCTAAAACCCTGGGCTCTGATACCAACTGTAACGACCCAACTCCTTATTCTGAGCCGAAGTCATTACTAAATGTAGACAACATGATTTAAGTCATAAAGTTTAGTTAAAACGAATAAAACCTCATAATTTTATTTATAAAATCAAATCAGGGTAATATGCAAAATGTAAATAATGTTAAAATCCTACTCGGGCCCTATCTACTTTGAAAGAAATGAAATAGTAACTAAGGAAGAAAATAAAACTCAAGTACTAGGAACGAAAATCGGGTCTTTGGTGTCTCGGGGAGCACCTAGGACATACTAGTCTGTAGTGAACCCGGAAGAAACACTAAGACAATCGGGCTGCGAGGATCCCGTCGAATCACTCGAATCATATCTATATCCATGCTAGACTGGCGTCCCATAGGACCACGCAGTCCTAAATAGGTGGTGATCCCGAAGGACACCCATGCAGATACGACTCTAATAGGCTAAGCTAACAGGTACCCTAACCATAGCATACATATACATAACATCATCATGTAATCAATCAGTCTAATCATCATCTCACATCCCATCACAATATCCAACATACAGTCATAACAAGTCATGTCATCACATTACCATGCCATCATATAACCACATCATCAGTCACATCATGCTCCCATAAATTTACATATGTTATACAGTCTAGTCCTTAAACATGAATAACTGGAGGTGTATGCGGTCTTATGGTTTTAATCATAGGGCTAGTAGGAGAAATCTCTTACCTGGAGATTTGCTCGACGAGTCCTAACAGTAACAACACGCTTCCCCAAGCGGCACAAGTCCTAAAGGGTCAAAAGTTCACAATTTAGTAATTTACCCACAAGGGAAAATTTGGTCAAACTTACTTGAGGCGACTTACCCACGGTCGAGGTTGCAACGCTTGAGCCCCTACTGAATTTATCCGACACTCCAAGGTCACTCGGTCCAAGACGTTCCTTAAGCGATAATTTAATTTAGTCCAAATAAAATTATTTAGATTAAAGTTTCATTTAAGCGCGGGTCGGGTTGCGGCAGGGACGCGAGTTGGGCAACTTCGCGCGACTGCGGACCTGCAGACGTGCGGGTTGCGTCTTCGCGCTCGAAGTCTTCAGGACGGGTAGAAGACGTGGTCGACGGAGCGTTTCGCTCGGCTACCCGATCGGCGGTGCGGTCAAGTTTTCGATCCGCGGGGAAACGATCCGTTGGCGACGTAGGGGTGGAGCGGCGGGGCTTCACGACTACAGTTGGAGACGCGGCTGAGCTGATGGAAGAGCTTGGGCAAATCGGTTACGCGACGGCGGCGACGACGAGCGGCGGCGAGGTTTCTTCCTCTTCCTTTTCTCTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTGATTTTCTGGTGCACGGGTCCCAAGGCTCATTTATAAAAAAAAAAACCCTTTATCTTTCCCTTCCATTAAATCAAAACAAACTTTCTCTCTCTCCAACCAAAACTCCCAATATCTTATTTTTTCAAAAAAAATCATCCAATTACAACATTCCCTTAAAAATGAATCTATTCTTTTCCAACTCAGATATCACCCTAGCTTAACTCAATTATTTTATCCTTACAACAACCTTACCAATTTAATTATCCAAATCAAAACAATATGCCTCTAAACCTTGATTAATGACAAATCAAAATGATAAAGTTCCTCAAAATTTGAATTTTCCATAACCGCACTTAACATTAATAATAAATGAAAAAAATCAAAATTGTTGGGGCCTTACAATAGGAAGTCTCTGATTTCAGTGTTCATGCCTTCAATGTCAAATCCGATTTCAGTTTATACACTGAATTCATCGTTATCATTAAAGCAGATAACCCAAATGAAAACATTGGTTTTATTTATGGGAAAGATACCTCTGTTTTTTGTTATGTACTCTAAATCGGAGCTCTTTTCTGGGTGCAGCTGACGAAGAATGTGACGGATATAAGTATTTTGTTGAGTGGGAATAGTGAATTTGGAAGTGAGTTACAAGAGGCGTTGATGCAGAAAGACATAGTGGGAAAATTTCGCTGCTTGTTGAGGTGAAAGTGCTAGTGACGGTGGTGATCGGGAGATTGTTGTTGAACCAGGTTAACGTGTTTGTTAATTGTTCATTGGTGGTTGATAATTTGTCGCTGAATAAGAAAGTTGAGATTTTGTCGAGTAATTATACTTACGGTGCTTTGTGAATTTTAAAGCTTTACCCATAGTTTTGTTGCTCTTTCGTTTTTGTGCTATTTAATGGGAATTCCTTTTTTCACTCTTGCTATGTTCTTATTAATCTTATATATTGCGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTACTTGCTTGTGATAGATTGGTGTGGAAATAGGTAAGAGGAAAAGCCTTTTTCTTCCTGCATCTTTTTCTTTGTTTCGAAATGTCAGGATACAAACAGAGGAATCTAACTTCGATTTTAAAATTGATAGTTTGAGTTCATGTAGATTGAGTTATGCTCAAGTTGGTGTTAGTTTATAATTATTAAAAAATTAGGGAGGAAAGCTGTGCCTCTCACAATTGAAAATCCAATCCAACATTTTGTTCAAGGGAATGCATCTATTTGTTTTTTCGGCCGTGGAAGAAGTTCTGACATCTGAGATCTATTAGAAAACGTTTTCAGTCCTCTCTATGGTTTCTATCTTCCTAGACAACTGTGTTGATTCTTCTTATCTGAGATTAAAAGATGGAAAAGGTAAAAGAAAGTGAACCTCTCAAATTCTCCTAGTAACTATTAGTTGCCTAAAATATGTCATGAGGAACTGTAAAGAACATAAGTTTTCAACATTTTTCTGGTGAATGAAATCGTTCAGATTCATCAATCAGATAATTTTTTATATTTTTCTTGCAGCCTTTATAGCCTCGGGCAAGTTTTTTCAGTGCCAGTGAATGGTGTTGCGCCCACAACAAAAAATAACTCTCAATCAACAGCGTCGGTATCATCAGCTACTCCTTTGCAATCGGAAGAGTATGATTTCTCCTCTTTAACACAAGGTATGTTTTCAA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ATGTTTGGTGGAAGCGAAGAGGAAGGTAATCCCTTTCAACCTCCCCAAACGTGGCCGACCAAATCACGATTCCAACATCTAGCCTTCGGCCATTCCTCGCCCACCGTCCGTCACGAGCATTCCTCTCTAGTCGTCCATCACCGGCATTCCTCGCAGCTATCGACCATTCCTCAGCTGACGAAGAATGTGACGGATATAAGTATTTTGTTGAGTGGGAATAGTGAATTTGGAAGTGAGTTACAAGAGGCGTTGATGCAGAAAGACATAGTGGGAAAATTTCGCTGCTTGTTGAGCCTTTATAGCCTCGGGCAAGTTTTTTCAGTGCCAGTGAATGGTGTTGCGCCCACAACAAAAAATAACTCTCAATCAACAGCGTCGGTATCATCAGCTACTCCTTTGCAATCGGAAGAGTATGATTTCTCCTCTTTAACACAAGACTCTCCCGATGCACATAGTGCCGTCGGAAAGAACATCGGTAGCAGTATGTTGGCTTCGATATTCGCAATGTGCAAACGGGACAACATTGAGAATGCCCTACTCCTGATGCCTTACATGTCAATGGACGATGTATGTCGACAATAG ATGTTTGGTGGAAGCGAAGAGGAAGGTAATCCCTTTCAACCTCCCCAAACGTGGCCGACCAAATCACGATTCCAACATCTAGCCTTCGGCCATTCCTCGCCCACCGTCCGTCACGAGCATTCCTCTCTAGTCGTCCATCACCGGCATTCCTCGCAGCTATCGACCATTCCTCAGCTGACGAAGAATGTGACGGATATAAGTATTTTGTTGAGTGGGAATAGTGAATTTGGAAGTGAGTTACAAGAGGCGTTGATGCAGAAAGACATAGTGGGAAAATTTCGCTGCTTGTTGAGCCTTTATAGCCTCGGGCAAGTTTTTTCAGTGCCAGTGAATGGTGTTGCGCCCACAACAAAAAATAACTCTCAATCAACAGCGTCGGTATCATCAGCTACTCCTTTGCAATCGGAAGAGTATGATTTCTCCTCTTTAACACAAGACTCTCCCGATGCACATAGTGCCGTCGGAAAGAACATCGGTAGCAGTATGTTGGCTTCGATATTCGCAATGTGCAAACGGGACAACATTGAGAATGCCCTACTCCTGATGCCTTACATGTCAATGGACGATGTATGTCGACAATAG MFGGSEEEGNPFQPPQTWPTKSRFQHLAFGHSSPTVRHEHSSLVVHHRHSSQLSTIPQLTKNVTDISILLSGNSEFGSELQEALMQKDIVGKFRCLLSLYSLGQVFSVPVNGVAPTTKNNSQSTASVSSATPLQSEEYDFSSLTQDSPDAHSAVGKNIGSSMLASIFAMCKRDNIENALLLMPYMSMDDVCRQ Homology
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008454632.1 (PREDICTED: probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.17e-11 Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAA0036779.1 (putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.21e-11 Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. NCBI nr
Match: TYJ95847.1 (putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.29e-11 Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_031738942.1 (ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 5.18e-11 Identity = 41/49 (83.67%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004150098.1 (ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN59876.1 hypothetical protein Csa_001028 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 5.43e-11 Identity = 41/49 (83.67%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZ67 (probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494997 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 1.05e-11 Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T5X5 (Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold20G00650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 1.07e-11 Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3B9N9 (Putative ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold110G001380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 1.11e-11 Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LIL4 (Arf-GAP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G851770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 2.63e-11 Identity = 41/49 (83.67%), Postives = 43/49 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C033218.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FEN5 (probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443384 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 2.52e-09 Identity = 37/51 (72.55%), Postives = 41/51 (80.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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