Chy8G150950 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCGACTTTAGAAGGAGGTGGAGGAGGTACCCTTTCGGAGATATACCAAAGTGCGAAGAGGCTGCTTTTGAGGACCAGAGATGGGCTTGAGAAGCTTGAGCGTCTTGAATACTCGGCGGCTAGCGGTATGGATTCCCCCGAGCTTTCCTTCTCGATCAAGAAGGATATTACTCAGATCCAGTCTCTATGTGTTGAGATGGATAGGTTATGGCGGTCTATTGCGGCCAAGTCTCAACGTGATTTGTGGAAAAGGTTCTTCTTTCATTCAATTTGTAATTGTACTGTTTCCATGTTCATCTTTTATGGGCTGAATTTTGAATTAGATGGTATTTATTTTGTTTTGCTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTGAAGATTTCCTTATTCTTTCTGAATTACTTGTTTTGTTAATTTATTCAAATGTGGTGGATGTTATGTTCTCCTGTTTGTCTGTTGTGGCTTTTTGTTTCATTGGAGTTGAACCGTTGTTTCTTCCATCAAAGAAAAGAGAAAAATGAAATGGGGTGGTCTCTTAGATCCTGAATTGAATTTTGTTCGGGTTACTAATGGGATTGGGATTTTATTATAATTATGCATGACCTTTTAAGGCTTATGCCCATTTTGATAATGCCTAACCTTGATGTGTTACAACTTGGAATTGTCCTACAGAAAGGTGGAACAAGTTGCGGAGGAGGCTGATTCTATGAAACAAAGTTTGGACAAGTATTTTCTTAGAAACCAGAAGCGGATGACGGAAGCAAAGGAGAGGGCAGAATTGCTTGGAAGAGCTGTAAGTACTTATTTTTAGCTACCTGTGGCTTCTGGTTAGCTGAACCTCTTTTTTAACCTTTCATTTTGAATGGTCTTTGGTTTTGGCTTTTGTAGAGTGGTGACTCTGCTCACATTTTAAGAATTTTTGACGATGAGGCACAAGCTATGAACTCGGTTCGAAATTCATCACGGATGTTAGAGGAAGCTAGTGCAACCGGAGAAGCTATCCTTTTCAAATACTCTGAGCAGAGGGATCGCCTGAAGGTATGTTCATAACTGAGAGCATGTAGATAGATATGTTTTTATTTACTGAGGCTTCTGTTCTGTTAACTGTTAAATCAATCTTTGAAGACTATGGATGGGTGTTCCCTTTAAATGTGAGAAGATTTATTCTATAATAGTCTCTAGTTGCTTTAGGAGATAGCTGCAGTTATGGTGCCCGAGTTAGCATTGAAATTTATGGAAGTTACTTACTACATATGAATATTTACTGAAGTTTGTGTCTATATTTTGGAGCTATAGATTCTCCTAAAGTAAAAACACTCTGATTGGCTTGAGATTACGTGCATTATGCTACATAATTACTCTAAAAGAATGATTGGCTCAGAGTTTAAACAATCTTTAGTCGATGAAGTCCAACTTCATGTGAACTATGACGAGATAGTGTGGAAAAGAATGTATAAATTTAGGCAGGCATGACTCTTGTTTTCTGTTTTAATTTGTAGTTAGTATCTAGGATTGGATAAAATAAATTTAGTGATACAAATTTAGTATGGGGGATTTGTAATCTTATAACCTACGATAATGCAAATCTAAACTTATGACCGAACATTCCTTCACAAGTTTTGATGGTGCCTTAATTATCGTTGACTTCCGTACTGATAGACTAGGTTATCTTACTAAGCTAGAGTACTTTCTTAATTTCATTCAATTTTTTCTCAGACTGAGTAAAACATGCAATTATAAACCACGGTAGGCTGAAATGAAATCCACAGCTACTTTACTAAAGTCTTTGTTGACTTTTACTGCAGAGTATAGAGCATATAGACTCTCCCCTCTGATTCATCCATTTCTGTCTCTCATGTTCATTAATTTGTTTTTGTGAATCAGAGAGCACAAAGGAAGGCACTAGATGTCCTTAACACAGTGGGGCTCTCCAACTCCGTGCTGAAACTCATTGAGAGACGGCACCGAGTTGATAATTGGATTAAATATGCAGGCATGATTTTAACCATAGTTGTTGTGTTCTTTTTTGTTCGATGGGTACGCTAATTCTCACCCAATGATTGCCGTGCAATTCAATTCATGCTGGCTTCTTGAAGAAAGGTACATAAATACACATTGAGGCTGCTTTAATTTGACCTCCCAGGGTTTACACCTCTAGAGGTCTCACCATCCATGAGACAAAATACTACATACTAAATAGACTACGATGATGTTCCCCATGTCGAGCTTTGCTTCGCAAGTGCGATAACTTGATTATTTTTCAGCTAGTCTGTAGACTCCCTTCTGGGTTGCTATAGTATAAGTTCTGATTCGAGATGCACATATCTGTCAGAAGTGGCGTCTTGTTAATGGTTTTGATGATTCTAGGTTTTTGTTTGTTACATTTCACGAACTTTTGAACTTTTTCTGGTGCCTTGGTTCTATTCTCTATAGGTTTTTTCTTTCACTATTGTCATTCAAACAGGTGGAGATTTTGAACCTACAACTAAGCTTAGTTTATGCAGTTGAACTATGTTAAGGTTAGTTGGCTCAACATTCTCTGTAGTGTTTTTCCAATTTTAGAAGGAATGGTAAATTTTAAGTCCTTAGGTAAAAGCTTAGAATGGTGTTTAAACTCGAAAGTTGTACTCTTGTTGTATCTCTGCTATTTGGTTTAGAAAGACCTCAATTTTCGGCATATCAATCTTTATCGGGAGGAACTATGAAATTATTTCAGCAATTTATAGTTTGGTTACTTTAGTTTGAAGGCAAGCTCAATGTCTGCAATGAAATATTTGGAGTTGAATAATTTTGTTTCCTCATTATGAAAGATATATTATGCTTGAAACCCATGTGATAAGGTGGTTATTTACGTTTGACATAATTGTAGGAATGGCAAGAACGCAGGAGGTGGGTTGGGGTTTTGGCAACATTCTAAGCTATAATAAGTTCTTTTTTTTGCCCCTGCTATTGTTATATATCATATTGATTGAATGAATTCATGTATAATTTGTTCAACCAAATTCATGGATAAAGTATTGAATCATTAACACGTTGTATTTTTTATTATGAGATCCTAACCTAAATGAATGAATAGTTAAAGTTTGGAATACTTTTAAATTTTGAAATTGGTAATTTAGGCAATTATCTAGATCACTCAATCTTATTGTTTTTTTTTTATATAATTTTAAATTTAAATCAAACCATTGTTATGATTTAATAATGAATCACTACTTAATTAAAGTTTAAACAAGTAGGAAAATTAATGCATTCTTCTCCATTTTTATTATTTTAGATAACAATTATAATTCTTTTTATTATGATTACGATTTTTATTATTTTAAATGACAATAATCACTAAGAAAGTACGTATTTCTACAAACAAGTACCCATCCATTTCTAATGAGTAATTAATGTTTACTTTTTATGGTGCATGGAACGAAAGAGAATGAAGTTCACAATATGACATGACGATTGTGGCGTTGTTGAGACTTATCTTCTATTTGAGTACATAATATGAATACATATTCAAGTGATAAAGGGGAGGAGTTTTTGCCCAATCTGAATTTTGAATTAGTAGTTTAATTTCATATTCAATTTGATATGACCACTTTTCTCCAGAAATATATTTAGAATAAATCAATATATAATTAAAAGAATTACAAAAAATAGTAAATTTGACAAAATATTTACAACATATAACAAACATTGATAGATACATATATGTTTCTAAATTTTACGCAGGTAAATATTTCAATTTATTTTGCTATTTTTAAAAATGCTACTATATAATTTTTATATTACCATCTTGATTTCAATTTATACCATCTCTCTATATTTTACTTTATCTTGTTATTATTTTTATTATTTTAAGTTCAATGGATATATTTGCTTCATATCAAGATTTTATTAATTATTATTATTATCTAACAAATGATATATATCTTTGAATTTTATCATTTTTTGTATTTTTACTCACATTTTATTCACGATCATCTTATTATATTATTATTCCATTAATTTGTCTTTTAGACAAACAAATAAATATTAACTTTTTCGATCTGGTTGTTTTTTTATATGTCCTTACAACGAATTAAGCTTCTTGTAGTTTTTGTAGTTGATGGGTTATAAATATATTGTAATTGTTCGAACCTAAACGAAAATGAAATTATAAATAGAACCCAGTTGTAAATAAACACTCTTTTCTATTTTTTTTTTCTGGAATTCTATTTGAATTTATATTTTATTATCAAATTATATTTTCTCTAACTACTTATCATTCAATAACAACAACAATAAATATTATTATTATTTAGCAATCTAAATAAAATAAGATAAGAAAATATTCCTTTTCTTAAAATTCTTATTTGAATTAATAGTTTGATATTTCTCTTTAGGAATAGTTTCTGTTGTCTGTGGATTTGTATGAAGTAAACCTTTAGTCACCCCGACATAAAACAAGCTGTAAGCTTAAGGTCCAGTCTGATTGCAACAATGGCCATGGACTGGAGGGGGCACGCTAAGGCCCAAAAAAAGCTTTCCGTTCACAAGGCGGGAATTTTGGCGTTCTATCGAACAACAGAATCATCATCATCATCATCATCATTTGTTTTTTCTAACTTTGGTAAAAAGTTCTGAATCATTTCTGTAATCTATGTGGCACGACCTTGAACGCAAGAGAACCGACACAGTCGTCTTCTTTAACTCTCGCTTTTGCCCAAGACCGCTGGAAAAGACAGCAACATAGTAAAACAATGGAGGCCATTCTAAAGGTGAAAACGTTATTCTTCCTTCATTTTCCTTTGTTTCTGGATATGGGTTTATGTTTGTTTTGGTTGCTATGGCTGTTTTTGTACTTGCACTTCTTTGTAGTTGAGTTAATAGTGAACAATAAGGACAGCATTTGTGAAATAAATTTGTGGGTATTGAAATTTGTTATGGTTTGGTTGCTGTTGCAGAGGTACTTTGGATTCTCGGCGCTTAGGCCGTATCAGAAAGAAGTCATTCAGAGCATTCTTCGTGG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BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P15043 (ATP-dependent DNA helicase RecQ OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=recQ PE=1 SV=5) HSP 1 Score: 384.4 bits (986), Expect = 3.7e-105 Identity = 223/608 (36.68%), Postives = 324/608 (53.29%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q14191 (Werner syndrome ATP-dependent helicase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=WRN PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 379.4 bits (973), Expect = 1.2e-103 Identity = 258/813 (31.73%), Postives = 408/813 (50.18%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CL21 (ATP-dependent DNA helicase RecQ OS=Pasteurella multocida (strain Pm70) OX=272843 GN=recQ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 371.3 bits (952), Expect = 3.2e-101 Identity = 210/617 (34.04%), Postives = 335/617 (54.29%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P40724 (ATP-dependent DNA helicase RecQ OS=Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) OX=99287 GN=recQ PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 5.5e-101 Identity = 221/608 (36.35%), Postives = 322/608 (52.96%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Q5 (ATP-dependent DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485999 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1327.8 bits (3435), Expect = 0.0e+00 Identity = 655/723 (90.59%), Postives = 684/723 (94.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Q2 (ATP-dependent DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486004 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1266.9 bits (3277), Expect = 0.0e+00 Identity = 628/735 (85.44%), Postives = 666/735 (90.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HNL0 (ATP-dependent DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465921 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1196.4 bits (3094), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/734 (80.79%), Postives = 646/734 (88.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLT4 (ATP-dependent DNA helicase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021754 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1194.5 bits (3089), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/735 (80.27%), Postives = 640/735 (87.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DKF5 (ATP-dependent DNA helicase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021754 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1194.5 bits (3089), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/735 (80.27%), Postives = 640/735 (87.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. NCBI nr
Match: XP_011653461.2 (uncharacterized protein LOC101222268 [Cucumis sativus] >KAE8649368.1 hypothetical protein Csa_019123 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1420 bits (3676), Expect = 0.0 Identity = 705/722 (97.65%), Postives = 712/722 (98.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. NCBI nr
Match: XP_008442004.1 (PREDICTED: ATP-dependent DNA helicase RecQ-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1321 bits (3420), Expect = 0.0 Identity = 655/723 (90.59%), Postives = 684/723 (94.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. NCBI nr
Match: XP_008442015.1 (PREDICTED: ATP-dependent DNA helicase RecQ-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1261 bits (3262), Expect = 0.0 Identity = 628/735 (85.44%), Postives = 666/735 (90.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. NCBI nr
Match: XP_011653463.2 (uncharacterized protein LOC101222028 [Cucumis sativus] >KGN53928.2 hypothetical protein Csa_019113 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1258 bits (3255), Expect = 0.0 Identity = 629/736 (85.46%), Postives = 662/736 (89.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. NCBI nr
Match: XP_038883532.1 (ATP-dependent DNA helicase RecQ-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1238 bits (3203), Expect = 0.0 Identity = 616/734 (83.92%), Postives = 657/734 (89.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. TAIR 10
Match: AT1G60930.1 (RECQ helicase L4B ) HSP 1 Score: 302.4 bits (773), Expect = 1.3e-81 Identity = 200/643 (31.10%), Postives = 324/643 (50.39%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. TAIR 10
Match: AT2G36900.1 (membrin 11 ) HSP 1 Score: 302.4 bits (773), Expect = 1.3e-81 Identity = 151/219 (68.95%), Postives = 189/219 (86.30%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. TAIR 10
Match: AT1G31360.1 (RECQ helicase L2 ) HSP 1 Score: 300.8 bits (769), Expect = 3.8e-81 Identity = 190/488 (38.93%), Postives = 280/488 (57.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. TAIR 10
Match: AT1G10930.1 (DNA helicase (RECQl4A) ) HSP 1 Score: 297.4 bits (760), Expect = 4.2e-80 Identity = 197/651 (30.26%), Postives = 323/651 (49.62%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G150950 vs. TAIR 10
Match: AT5G50440.1 (membrin 12 ) HSP 1 Score: 287.0 bits (733), Expect = 5.7e-77 Identity = 147/223 (65.92%), Postives = 181/223 (81.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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