Cp4.1LG08g08620 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGAAGTATTTTAATGTTTCTCTCTCAAATTATAATTAGGTAATATCTATTAAGATATCGACTACACCTTATCTTATCCAGTAATTTTTTTTTAGTCTAGAAGCAAATAGATGTGCCAGTAAGAACGCTGGCCCCAAAGGGAGTGGATTTGGGGGCGGTCCCACATCGATTGGAAGAAGGAAAGAGTGCCGGCGAGGACGCTGGCCCCGAAAGGGGGTGGATTGTGATGTCCCACATTGGTTTGGGAGGAGAACAAATCACCATTTATGAGGGTGTGGAAACCTTCCCCTAGCAGACGCGTTTTAAAGCCTTGAGGGGAAGCCCGAAAGGGAAAGCCGAAAGGTAATATCCGTTCAAGAAATTCTCCTTTTTTTTTTATTTACTCTCCTGTAAAGTTACTCTCCTGTAAAGGTTCAGTCGTTTCTCTTTCATTTTCTTCGTTTACAGTGTTTGAATAAATAAGATCACTTATATAAGAGCCCAAGCCCACCGCTAGCAAATATTGTCCTCTTCGGGCTTTCCCTCAACTAGAGGTTTTCACACTCTTATAAATAATGTTTTGTTCTCCTCCCTAACCGGTGTAGAATCTCACAATTCATCCTCCTTCGGGACCCAACGTCCTCGCTAGCACTCATTCTCTTCTCCAATTGATGTGGGACCTCCCAATCCACCTCCTCCAGGGCCCAACATCCTTGCCAGCACACCGCCTCATGTCCACCCCTTTAGGGTTCAGCCTCCTCACTGACACATCGTCCGGTGTCTAGCTCGAGAACCCACATCAGTTAGAGAGGAGAACAAAACATTCTCTATAAAGAGTGTGAAAACCTCTCCCGAGCCGACCCATTTTAAAAACCTTAAGGGAAAGTCCAAAGAGAACAATATCGGCTAGAGGTAAGCTTAGATCGTTACATCTTATTTTCGGGATGACTCTCATAGTACATGGTATATTCATATACCCTTTCCTTTACTCGAGCGTCACATCAAAGATATTTTTCGGTGAAGAAGCAAATGGGAATAAACAAAGATTTGATGAAGCCCCTCAAGCATGTCCTATATAAGGAGATGAATGGATTGATTGTATACTCATCCCTTTACCAATGGCTATCTCTAAATCTTTGTCTCTTACTTTTCTTCTACTCCTTGGTTTAGGCTTAGCTTCGGCGGCCAGAACCCTTCTCTCTTATGATCCTCCACATCACTCCGATGTAGGCTATGGATACCAGCATAACCCAAGAGTAGGGTATGATCATGACCATCATGATGGACCTTATGGTGCATATGGTGGTGGGTCCGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGCTGGCTCTGCTCTTGGAGGCTCTGGATATGGAAGTGGCGGCGGCGGCGGAGGTGGTTCTGGCTATGCAGGTGTAGGAGACCTTGGAGGTAGTGGATATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGAAAGGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGAGCCAAAGGGTATGGTGGTGGTGCTAAAGGAAGTGGATATGGGAGTGGTGGCGGCGCCGGAAGTGGCTACGGTGGTGTTGGTGGTGAAGGAGGATATGATGGTGGATATTGACCTTAAACGAACACAATCTCAAAGCTTATCGTTAAAATGAAAATGCTTGCCTAGTTTTCAATGTGTTTGATAAAATAAGAAGAATTTGGGTAAGAATGTTTAAGTTTCTATATGAATGATGAGTACGAAGTTATCTTATAATCTCTCGTGCACGATTCTAGTAGATCATCTCATATAAATGTAGAGACTGATCCTGCATGTGGGTTCACATTATACCGAGCACGACCCTAATAGATCTTTTCGTATATATGCAGAGAGTGATCATGTATGTGGGTGCTTATTGTACCGGGCACGATCCTAGTAGATCATCTCGTATACATATAGAGAGTGATCTTGCATGTGGGTTCATATCGTACTGGGCACGACCCCAATAGATCATGTCATATACATGTAGAGAGTGATCTTGCATATGGGTTCATATCGTACTAGGCACGACCCTAGTAGATCATGTCATATATGTCATATATATGTAGAGAGTGATATTGCATGTGGGTTCATATCGTACCGGGNGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGAGCCAAAGGGTATGGTGGTGGTGCTAAAGGAAGTGGATATGGGAGTGGTGGCGGCGCCGGAAGTGGCTACGGTGGTGTTGGTGGTGAAGGAGGATATGATGGTGGATATTGACCTTAAACGAACACAATCTCAAAGCTTATCGTTAAAATGAAAATGCTTGCCTAGTTTTCAATGTGTTTGATAAAATAAGAAGAATTTGGGTAAGAATGTTTAAGTTTCTATATGAATGATGAGTACGAAGTTATCTTATAATCTCTCGTGCACGATTCTAGTAGATCATCTCATATAAATGTAGAGACTGATCCTGCATGTGGGTTCACATTATACCGAGCACGACCCTAATAGATCTTTTCGTATATATGCAGAGAGTGATCATGTATGTGGGTGCTTATTGTACCGGGCACGATCCTAGTAGATCATCTCGTATACATATAGAGAGTGATCTTGCATGTGGGTTCATATCGTACTGGGCACGACCCCAATAGATCATGTCATATACATGTAGAGAGTGATCTTGCATATGGGTTCATATCGTACTAGGCACGACCCTAGTAGATCATGTCATATATGTCATATATATGTAGAGAGTGATATTGCATGTGGGTTCATATCGTACCGGGCACGACCCTAGTAGATCATCTCGTATACATGCAGAGTGTGATCCTACATGTGGGTTCATATCTAACAAGGCACGACCCTAGTAGATCATCTCGTATACATGTAGAGAGTGATTCTACATGTGGGTTCATATCGTACCGAGCACAACCCTAGTAGATCATTTCGTATACATGTAGAGAGTGATCCTGCATGTGGGTTCATATCGTACCGAGCACAACCCTAAGAGATTATCTCGTATACATGTAGAGAGTGATGTTACATGTGGGTTCATATCTTACGGCGCACGGCTCTAGTAGATCAGCTCATATACATGCAGAGAGTGATTCTGCATGTGGGTTCATATCGTACAGGGCACAACCCTAGTAGATCATCTCGTATACATGCAAGTAGTTATTTCACGTGTGAGCTCATATCGAATAAGATTTTACAATTTTTTTATTCATATAAATCTCACGATCTCATCAGTTTTCCACTATTTCATATCAAATGGCTAATTATTTATTTATAGTAATGCAAGTCGTTTCATAAGCCATTTAAATCTCAATATCATGGCGGCTCATACGGCAACAATGTTCTTCAATTCAATAAACAATTGTTAAGGTTTAGATCTTTTTTTTTTTANCTAGAGGTTTTCACACTCTTATAAATAATGTTTTGTTCTCCTCCCTAACCGGTGTAGAATCTCACAATTCATCCTCCTTCGGGACCCAACGTCCTCGCTAGCACTCATTCTCTTCTCCAATTGATGTGGGACCTCCCAATCCACCTCCTCCAGGGCCCAACATCCTTGCCAGCACACCGCCTCATGTCCACCCCTTTAGGGTTCAGCCTCCTCACTGACACATCGTCCGGTGTCTAGCTCGAGAACCCACATCAGTTAGAGAGGAGAACAAAACATTCTCTATAAAGAGTGTGAAAACCTCTCCCGAGCCGACCCATTTTAAAAACCTTAAGGGAAAGTCCAAAGAGAACAATATCGGCTAGAGGTAAGCTTAGATCGTTACATCTTATTTTCGGGATGACTCTCATAGTACATGGTATATTCATATACCCTTTCCTTTACTCGAGCGTCACATCAAAGATATTTTTCGGTGAAGAAGCAAATGGGAATAAACAAAGATTTGATGAAGCCCCTCAAGCATGTCCTATATAAGGAGATGAATGGATTGATTGTATACTCATCCCTTTACCAATGGCTATCTCTAAATCTTTGTCTCTTACTTTTCTTCTACTCCTTGGTTTAGGCTTAGCTTCGGCGGCCAGAACCCTTCTCTCTTATGATCCTCCACATCACTCCGATGTAGGCTATGGATACCAGCATAACCCAAGAGTAGGGTATGATCATGACCATCATGATGGACCTTATGGTGCATATGGTGGTGGGTCCGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGCTGGCTCTGCTCTTGGAGGCTCTGGATATGGAAGTGGCGGCGGCGGCGGAGGTGGTTCTGGCTATGCAGGTGTAGGAGACCTTGGAGGTAGTGGATATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGAGCCAAAGGGTATGGTGGTGGTGCTAAAGGAAGTGGATATGGGAGTGGTGGCGGCGCCGGAAGTGGCTACGGTGGTGTTGGTGGTGAAGGAGGATATGATGGTGGATATTGA ATGAGAAGCTTAGCTTCGGCGGCCAGAACCCTTCTCTCTTATGATCCTCCACATCACTCCGATGTAGGCTATGGATACCAGCATAACCCAAGAGTAGGGTATGATCATGACCATCATGATGGACCTTATGGTGCATATGGTGGTGGGTCCGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGCTGGCTCTGCTCTTGGAGGCTCTGGATATGGAAGTGGCGGCGGCGGCGGAGGTGGTTCTGGCTATGCAGGTGTAGGAGACCTTGGAGGTAGTGGATATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGAAAGGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGAGCCAAAGGGTATGGTGGTGGTGCTAAAGGAAGTGGATATGGGAGTGGTGGCGGCGCCGGAAGTGGCTACGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGCTTAGCTTCGGCGGCCAGAACCCTTCTCTCTTATGATCCTCCACATCACTCCGATGTAGGCTATGGATACCAGCATAACCCAAGAGTAGGGTATGATCATGACCATCATGATGGACCTTATGGTGCATATGGTGGTGGGTCCGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGCTGGCTCTGCTCTTGGAGGCTCTGGATATGGAAGTGGCGGCGGCGGCGGAGGTGGTTCTGGCTATGCAGGTGTAGGAGACCTTGGAGGTAGTGGATATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGAGCCAAAGGGTATGGTGGTGGTGCTAAAGGAAGTGGATATGGGAGTGGTGGCGGCGCCGGAAGTGGCTACGGTGGTGTTGGTGGTGAAGGAGGATATGATGGTGGATATTGA ATGAGAAGCTTAGCTTCGGCGGCCAGAACCCTTCTCTCTTATGATCCTCCACATCACTCCGATGTAGGCTATGGATACCAGCATAACCCAAGAGTAGGGTATGATCATGACCATCATGATGGACCTTATGGTGCATATGGTGGTGGGTCCGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGCTGGCTCTGCTCTTGGAGGCTCTGGATATGGAAGTGGCGGCGGCGGCGGAGGTGGTTCTGGCTATGCAGGTGTAGGAGACCTTGGAGGTAGTGGATATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGAAAGGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGAGCCAAAGGGTATGGTGGTGGTGCTAAAGGAAGTGGATATGGGAGTGGTGGCGGCGCCGGAAGTGGCTACGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGCTTAGCTTCGGCGGCCAGAACCCTTCTCTCTTATGATCCTCCACATCACTCCGATGTAGGCTATGGATACCAGCATAACCCAAGAGTAGGGTATGATCATGACCATCATGATGGACCTTATGGTGCATATGGTGGTGGGTCCGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGCTGGCTCTGCTCTTGGAGGCTCTGGATATGGAAGTGGCGGCGGCGGCGGAGGTGGTTCTGGCTATGCAGGTGTAGGAGACCTTGGAGGTAGTGGATATGGAAGTGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGAAGTGGTGTAGGATATGGGGATTTGGGTGGACATGGGAAAGGCTATGGTAGCGGTGGTGGTGGAGGGAGTGGGTATGGCGGTGGAGCTGATCATGGAGTTGGGTATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGATATGGAGCTGGAGGTGGAGCTGGATATGGTCCAGGAGGAGACCGTGGTGTTGGCTATGGGAGTGGAGGAGGGGGTGGGTCAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGAGCCAAAGGGTATGGTGGTGGTGCTAAAGGAAGTGGATATGGGAGTGGTGGCGGCGCCGGAAGTGGCTACGGTGGTGTTGGTGGTGAAGGAGGATATGATGGTGGATATTGA MRSLASAARTLLSYDPPHHSDVGYGYQHNPRVGYDHDHHDGPYGAYGGGSGGGYGAGAGSALGGSGYGSGGGGGGGSGYAGVGDLGGSGYGSGGGGGSGVGYGDLGGHGKGYGSGGGGGSGVGYGDLGGHGKGYGSGGGGGSGYGGGADHGVGYGSGGGGGYGAGGGAGYGPGGDRGVGYGSGGGGGSGGGYGGGAKGYGGGAKGSGYGSGGGAGSGYGYGDLGGHGKGYGSGGGGGSGVGYGDLGGHGKGYGSGGGGGSGYGGGADHGVGYGSGGGGGYGAGGGAGYGPGGDRGVGYGSGGGGGSGGGYGLASAARTLLSYDPPHHSDVGYGYQHNPRVGYDHDHHDGPYGAYGGGSGGGYGAGAGSALGGSGYGSGGGGGGGSGYAGVGDLGGSGYGSGGGGGSGVGYGDLGGHGKGYGSGGGGGSGVGYGDLGGHGKGYGSGGGGGSGYGGGADHGVGYGSGGGGGYGAGGGAGYGPGGDRGVGYGSGGGGGSGGGYGGGAKGYGGGAKGSGYGSGGGAGSGYGGVGGEGGYDGGY
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. Swiss-Prot
Match: GRP2_PHAVU (Glycine-rich cell wall structural protein 1.8 OS=Phaseolus vulgaris PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 1.1e-18 Identity = 272/494 (55.06%), Postives = 289/494 (58.50%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. TrEMBL
Match: A0A169WK47_DAUCA (Uncharacterized protein OS=Daucus carota subsp. sativus GN=DCAR_005637 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 1.7e-21 Identity = 279/509 (54.81%), Postives = 295/509 (57.96%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. TrEMBL
Match: F6HT88_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_02s0012g01350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.4 bits (241), Expect = 5.5e-17 Identity = 175/283 (61.84%), Postives = 185/283 (65.37%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. TrEMBL
Match: A0A0L9UYC0_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Phaseolus angularis GN=LR48_Vigan07g128100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 9.4e-17 Identity = 245/475 (51.58%), Postives = 262/475 (55.16%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. TrEMBL
Match: V7CJJ8_PHAVU (Uncharacterized protein OS=Phaseolus vulgaris GN=PHAVU_002G141200g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 1.1e-12 Identity = 169/282 (59.93%), Postives = 179/282 (63.48%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. TrEMBL
Match: A0A0S7APE9_MEIRU (Uncharacterized protein OS=Meiothermus ruber H328 GN=MrH_1445 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 79.3 bits (194), Expect = 1.5e-11 Identity = 274/498 (55.02%), Postives = 274/498 (55.02%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. NCBI nr
Match: gi|778675041|ref|XP_011650342.1| (PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 2-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 149.4 bits (376), Expect = 1.7e-32 Identity = 177/255 (69.41%), Postives = 185/255 (72.55%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. NCBI nr
Match: gi|3810890|dbj|BAA34064.1| (glycine-rich protein-2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 148.3 bits (373), Expect = 3.9e-32 Identity = 176/255 (69.02%), Postives = 185/255 (72.55%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. NCBI nr
Match: gi|586676268|ref|XP_006838588.1| (PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1.8 [Amborella trichopoda]) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 1.5e-23 Identity = 167/247 (67.61%), Postives = 174/247 (70.45%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. NCBI nr
Match: gi|1021047020|gb|KZN04800.1| (hypothetical protein DCAR_005637 [Daucus carota subsp. sativus]) HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 2.4e-21 Identity = 279/509 (54.81%), Postives = 295/509 (57.96%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG08g08620 vs. NCBI nr
Match: gi|720076849|ref|XP_010240849.1| (PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 2.5e-18 Identity = 277/536 (51.68%), Postives = 304/536 (56.72%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene: None The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |