Cla97C08G144740 (gene) Watermelon (97103) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACAATCACAGCAACATTAGCAACACCCTCAATAACAGCACTACTTCTACTTCTCCCCAAGATCTCGGATTGCACTTCTTGGAAATGGCTCGATTGGGTCTGCCTCGGGGGCTATGCGACATGGACGAGGACGAGGAGTCTCCCACTGAACTCAATACCATCAACAGTTCCGGAGGTTTCTTGTTGGTTACCACCGATAAGCTCTCTGTCAAGTATACGAATGTGAATCTTCACGGCCACGATGTCGGGGTTGTCCAAGCTAACAAGCCAGCTCCAGTTAAACGACTTGTCTACTACTTCGAGATTCATGTAAAGGATGCTGGGGCCAAAGGCCAGATTGCCATTGGCTTCACCACCGAGAGCTTCAAGATGCGAAGGCAGCCCGGGTGGGACACACTTTCTCTATCTCTCTTTCTTTCTTGATTCCTTTTTCGATTTTTCTTTGATTTTCTTGATTATGTATATTATTTCCTGTCACCAGGAAGTGTTACGAATGTGCCTTTTTATTGGAATTGATTGATAAATGGAATTGAATACAGTATCTGCAATCATCCAGTTAGTGCTTATCTTTATAATCCCTCAGTGGATGTAACTCAGTTTGGCTCAATCTTTTGCATTTTCCTGAGATATCCCTTCCCCGATTCTAAGCCTCAAAAGTACTCATATGCCCTGTCCTGTTAATTTGGACGAGTAGGTGGGAGCCTAATAGCTGTGGATATCATGGAGATGACGGACTACTTTATCGTGGACTAGGTAAGAAAGAACCTTTTGGTCCAACATATACATCTGGTGATACGGTTGGTGCCGGAATTAATTACGCCTCACAGGAATTCTTTTTCACGTAAGACATTTGCGCACTGTAATTGTTGTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGTTATCATCATGATACTTTATGATTCTTTCTGTCGATGTACTAGAAAAAATGGGATAGTAGTCGGAGCAGTAGAAAAGGACATGAAGGGTCCCTTGTTCCCTACCATTGCCGTTCACAGCCAAAACGAAGAGTATGCTCGTCATCAAACTTTTATCCCTTTGATACCTTGTTTTGCATATACTTTGTCTATTCTGATAACTTAATTAGGATTATATATGCGTTAGGGTTTTATAACATCACAATGGAGTTTTACTGGTGATGTAGTAAGTCCTGTCTCAAACTAGATAGATGTAGTTGGAACCAGGACGTAAAGTATCTGATGTTTCTTTAGCTTAACAAAAGGCTTTCATTGCTTTTGTTATTCCTTCAAAGTAATCCTTTACCAATGTTACTGGTGTGAAGTATCTGATAATTCTATGGCAAACTTTCCTGATTTTTAGGTGGTAACGTGCCCAAATTTGAGGTCCGTTCCCTTGGATTGAAAGCTTAACGTGTGAAAGCTCTTTATGTTTCGAGCTGCCATTAGGCACATGGAATCTTTTTGTGGAGTAGTTGGATGGTGCCAAATACCATGGTTGTAAAAAAAAATTCACTCAGCTTTTTCTTTTATCGATCAATAACCAAGCTTTCATTGAGAAAAAAATAAAGAAAAGAATACAAGGCCAGAAGAAAAACTAGAGCCACAAACAAGCAGAGGCTAATTAAAAGAAAGACCTCCAGTCAAGCAAGATAAAACTAAGCGGATAATTAAAAAAAGGCTTCATTATTGAAGCCCACAAAGAAACATGAAACTTGGCAAAGGACCAAACATCATAAGTAGTCTGCTCAAGCCCTCTAAAGACTCAATTGTTCCTCTCGCCCCATAGACCCCACAACACATTGTACACCCCACTTTTCGAAAAAACTTATCTTTCTCCCTAAAAGGAGTATGGAGAAGGAACTCATTGATCATCTAAATGAACTTGATCAAAACCAAACTCATCAAAGAAACAACTCCACACAACATATGCAAAATCACAACTCCTATGCAATGATCAAGGTCCTTAACTGCCCTCCCGCACCATGACTCCATCAAGGAAGACATCCTCTTTGACACCCAGTTTTAAGGTATTTTACCTTTCCATGGAGCACTTGCCAAATTAAAAGCTTAATCTTTTTGGGTTCTTTTTCATCCTCCACATCGCGACATAGACTGAATCTCTCAATGGAGAAGGGTTAACCAAACAAAGAAAGAAGGAATTACAAGAAAAGCCCTTCAAAGGACTGGGGCACCACAAGCGAAAGTCCCTTCTCCCAGACGAACACTAAAAATCCCCCAATGAAGAGTCCCCTGTTTTCCTATCAAATAATGAATGACAAAACCCAAAGTAGGGGTTGGCTGAGCGAAAACATTAGCCATTGAGACATTTTTCATCAAAGACAAATGGTATAGATGAGGAAGAGCAGAGTAGAGGGGGGTTATCTCCCAACCACCTATCTTCTCAAAAAAACCTAACCCTCTCATTCCCAACCAAGCAACAGATAGAAGTAAGGAAGCTCTCCTACAATACCAAGAAGTGCTACTAACCCATTCAAGGTCCATTCAAAAGTGAACAAACCATATTTACTTGCAATAACCTTATGCCATAGGGTGCCAAGTTCATGTTAAGAGTCATTTAACCCTTATTACAAGCAGGTTCCCTTTACCTAAGCTGTCAAAATCCATGGGATTTGTAACCTCTTCCTAGTTAACTGTGTGAGACTCACCGCCTTCCTCCACTCCTTCCTAGAGAAAGTCATTATTTTTTTAGAAGGAAACGAAGCTTTTCATCAAAATAATAAAAAGAAAGTTAAAATTTATTGATATATTGCTTTGTATCATGGGTACTACTGACTTGAGCATGTTTCATCTCTTCCCTATAATTTCATGCCATCAATGAAATTGTTTTTCATTAAAAAAACTTCATGGGTACTACCAACGTGAGCATAGGCCAAGGAATTCACAATCTTCTTTAGAAGTTGAGGTTCAAGTTCCCACATCCATAATTGCAATGCTATGTTTTAAAAGAACATAATGGGTATTGTATTTTCTTCGATGGAAAATAAAGTAATTTTATTAGAGGAGTTATGAAAAAAAAATTGGATAAAGAACTCAATCATAAGCTGCAGCCCATCCTAAATGTCCAGGGACCTGACAAGTTTCAAAACACATGACTTCTAGGTAAGTGTTTTTCAGATATTGAGGTCTTAGCCAATGGGACTGCCCTTTAAGGTCTGGAAGCACAATCTTACTATAAAAGGAGTAGATTTATATAATGGATTAGCCAAAAAACACTAGGAAGAGAACTGGATCTTAGCCTTCTCGAAACACTTCATGAAAAGGTTTCTCTTGTTAAAAAGGAAAAAAAATTTGGTCAGTGATACACACAAGTGAAAGAAATGCCTCAAACTTTATTAAAAGATGATCAAATGATACAATTGATGTCCCTTTATAGGGAGCTAGTCAGTTCTAACTAAGAAGAAGGTGACCGGTTAAGCAAGTAACCGGTTTACATTAAAATAAAACTATATCTTGCTATTGGAAACAAATACAACATATGTTCCTACATCAATTCCTTCTAAAAAATTAAACATGCCCTCGAGTTACTTAGCTAAAGAGAAACAAGCCAAGCAAACAAGCAATCCTTTTCTTCCTCTCCAGCAACACCCATCCTTGCCAGCCAAGCTACCTCTCTTGGTAGTCACCCCTCTTTTACACATTGGTCATGGAAGTAGTCAGTTGCAAGATCAATGGAATTTTCTTTTGCACTTAGTTCGAAGATGGTAATTTCGTTGTAGAGGATATGGAAGTTCGAAAAGCAATTTACTTATCGGAGACGCATATGCATTGGATGGTAAAGCAAATCTCAGACCTCCTCAATGGATCAAGTGTTCGTTTTTTCTTAAGGGAAGTGTGTGATGACTGGGGAGCTATGAGATTATCAAAATTCAAGAGTAATATGGGTTGGAATCTAAGATTCGTGGTTTGGCCAGCTACCGGAGGACGCTTCTTCATTCACGTACCAAAAGGGACAGCGCAACAAGGTTGGAATGAATTTTTGGAAATGATTATTAGCTTTAACCATCGAATTGGGTGCTCAAGAGACAAAACAACGATTGTTAGTTTTTTGGAAGATCTTTATCAAATCAAAATTAGTATTAACCCTCTGTTTGCTGATAAGGCTTTGATTAAAGTATCCCAAGGAAATTTAGAAAAGATCATTGAAATGCCTGGAAAATGGTTTGACTATCGTAAATTCCATCTTCTATTTGAAAAATGGAATTCAATTCAGCATAGTAGGCCTACTTGCATTAAAGGTTATGGTGGATGGTTGATAATAAGAAACCTACCGTTGGAATACTAGAGCAGAGCAACCTTTGAAGCTATTGGCTCCCACTTTGGAGGTTTAGAAGAAATAGCATTTGAAACTCTCAATCTTTTGAACGTGTTAGAAGCAAAAATCAAAGTCAAAAGAAATTTATGTGGTTTTATGCCTGCATTGGTTGAAAGGAAAAATGAACTGAGAGGTTCCATATTTTTAAATTTTTGGGAATGTTGAAGCCATGGAGGTACCTTCTTATGCACACAAGGATTTATTTTTTAAAGAGTTCAATAACCCAATCGATCAAAACTGTATAAATAAAGTTGCAGAAGATGAAGATGCTTGTGGTATGGTAGCAAACTGCATCAGATTAGGTCGTTTTGTGACCATCTCGCCGGAGAAGATACCGGAAAATTTTGAAATCGTTGAGCCGGTGCCAGAGCGAAAAAGTTTAATTCTGGTGTTAATGAAGTAGTTGAAAAGTTGGAAGTTATTAGGAGAGAGAAACTCATTGGCTGAAATTGTAGTTTCTCAAGCAGCCAAAAAAATTTGCTCAAAATTCTTTATTTAATAAGGACCCCAAGGAGTCGGCGTCCCTTGATCTCCCCTCGTTGGAAAAAGACTTCATTAATGCCTTGTGGGTAAGCATCGACGGGCAAAATTTCGTGCAAGCTCCAGTTGTTTCGGACATTCCTTTGTCCCCGACTTCAGCAAACTCACCGGAGAAGAAGATGAAAACTTTCCAAACTA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ATGAACAATCACAGCAACATTAGCAACACCCTCAATAACAGCACTACTTCTACTTCTCCCCAAGATCTCGGATTGCACTTCTTGGAAATGGCTCGATTGGGTCTGCCTCGGGGGCTATGCGACATGGACGAGGACGAGGAGTCTCCCACTGAACTCAATACCATCAACAGTTCCGGAGGTTTCTTGTTGGTTACCACCGATAAGCTCTCTGTCAAGTATACGAATGTGAATCTTCACGGCCACGATGTCGGGGTTGTCCAAGCTAACAAGCCAGCTCCAGTTAAACGACTTGTCTACTACTTCGAGATTCATGTAAAGGATGCTGGGGCCAAAGGCCAGATTGCCATTGGCTTCACCACCGAGAGCTTCAAGATGCGAAGGCAGCCCGGGTGGGAGCCTAATAGCTGTGGATATCATGGAGATGACGGACTACTTTATCGTGGACTAGGTAAGAAAGAACCTTTTGGTCCAACATATACATCTGGTGATACGGTTGGTGCCGGAATTAATTACGCCTCACAGGAATTCTTTTTCACAAAAAATGGGATAGTAGTCGGAGCAGTAGAAAAGGACATGAAGGGTCCCTTGTTCCCTACCATTGCCGTTCACAGCCAAAACGAAGAGGTGCTAGTCAACTTTGGACAGAAACCATTTGCGTTTGATCTCAAGGTATTTGAAACACAAGAGAGGATGAAGCAACAAGCCGCCATTGAGAAGTTATCTTTGCCATCAAATGTCAGTTATAGAATAGTGCGCTCATACTTGCAACATTATGGTTATGAGGATACGCTCAGTGCGTTTGATATGGCTTGCCAAAGCACTGTTCCTCCTATCTATATAGCTCAGGAAAATGGCTTTGATGAGCAAGATATCGTGTATGCTCTAAACCAGAGAAAGACTTTAAGGCAGCTTATCAGGAAGGGGGAGATTGATGCTGCACTTGGAAAGCTTAGTGAGTGGTATCCGCAGATTGTTCAGGATGAAAAATCAGCTACTTGCTTTCTCCTTCATTGTCAAAAGTTCATTGAATTAGTCAGGGTTGGAGCGCTAGAGGAGGCTGTTAAATATGGAAGGAATCAGTTGGGAAAGTTTTATGGTCTGCCTGGGTTTCAGGATCTAGTTCAGGACTCTGTTGCTTTGTTGGCATATGAACGACCACAAGAGTCCCCTGTTGGTTATCTTCTCGAGGATACACAGCGTGAAATTGTAGCTGACACGGTGAATGCCATGGTTTTATCAACTAATCCCAATGTGAAAAATTTACAAGGTTGTTTGCATCCATATCTCGAACGGTTGTTGAGGCAGCTGACTGCTTGCTGCTTGGTACGAAGGTCTTTGAATGGGGATCAAGGTGAAGCTTTTCAATTGCATCGACTGCTTAACAGCATTGAAAAGTCTAAGTGCTAG 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BLAST of Cla97C08G144740 vs. NCBI nr
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BLAST of Cla97C08G144740 vs. NCBI nr
Match: XP_008459671.1 (PREDICTED: ran-binding protein 10 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 926.8 bits (2394), Expect = 2.9e-266 Identity = 451/468 (96.37%), Postives = 461/468 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. NCBI nr
Match: XP_022155235.1 (ran-binding protein 10 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 901.4 bits (2328), Expect = 1.3e-258 Identity = 439/468 (93.80%), Postives = 453/468 (96.79%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. NCBI nr
Match: XP_023525068.1 (ran-binding protein M homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 887.9 bits (2293), Expect = 1.5e-254 Identity = 429/448 (95.76%), Postives = 438/448 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. NCBI nr
Match: XP_022998100.1 (ran-binding protein M homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 885.2 bits (2286), Expect = 9.8e-254 Identity = 427/448 (95.31%), Postives = 438/448 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KW89|A0A0A0KW89_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G651700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 1.0e-267 Identity = 453/468 (96.79%), Postives = 463/468 (98.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CB75|A0A1S3CB75_CUCME (ran-binding protein 10 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498719 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 926.8 bits (2394), Expect = 2.0e-266 Identity = 451/468 (96.37%), Postives = 461/468 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TrEMBL
Match: tr|M5XYJ8|M5XYJ8_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_1G552200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 766.1 bits (1977), Expect = 4.4e-218 Identity = 373/456 (81.80%), Postives = 408/456 (89.47%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5EHM5|A0A2P5EHM5_9ROSA (SPRY domain containing protein OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_191460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 746.1 bits (1925), Expect = 4.7e-212 Identity = 363/442 (82.13%), Postives = 395/442 (89.37%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2C9WI37|A0A2C9WI37_MANES (Uncharacterized protein OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_02G196200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 745.3 bits (1923), Expect = 8.1e-212 Identity = 366/477 (76.73%), Postives = 414/477 (86.79%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|F4HYD7|RANBM_ARATH (Ran-binding protein M homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RANBPM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 7.3e-184 Identity = 317/466 (68.03%), Postives = 370/466 (79.40%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q4Z8K6|RBP9X_DROME (Ran-binding proteins 9/10 homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=RanBPM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 172.6 bits (436), Expect = 1.1e-41 Identity = 92/297 (30.98%), Postives = 154/297 (51.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q28FM1|RANB9_XENTR (Ran-binding protein 9 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=ranbp9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 1.8e-41 Identity = 96/312 (30.77%), Postives = 155/312 (49.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q1LUS8|RBP10_DANRE (Ran-binding protein 10 OS=Danio rerio OX=7955 GN=ranbp10 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 2.4e-41 Identity = 88/291 (30.24%), Postives = 151/291 (51.89%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9PTY5|RANB9_XENLA (Ran-binding protein 9 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=ranbp9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 4.0e-41 Identity = 90/288 (31.25%), Postives = 149/288 (51.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TAIR10
Match: AT1G35470.2 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 4.1e-185 Identity = 317/466 (68.03%), Postives = 370/466 (79.40%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TAIR10
Match: AT4G09340.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein) HSP 1 Score: 591.7 bits (1524), Expect = 4.1e-169 Identity = 288/427 (67.45%), Postives = 341/427 (79.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TAIR10
Match: AT4G09200.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 1.5e-83 Identity = 176/403 (43.67%), Postives = 237/403 (58.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TAIR10
Match: AT4G09310.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 1.5e-83 Identity = 176/403 (43.67%), Postives = 237/403 (58.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C08G144740 vs. TAIR10
Match: AT4G09250.1 (SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 2.8e-69 Identity = 159/403 (39.45%), Postives = 214/403 (53.10%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
The following gene(s) are orthologous to this gene: The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |